MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 15613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017295	A	8	8	90	97	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017295	TACC	2	8	121	128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017295	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017295	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017295	T	6	6	166	171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017295	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017295	T	10	10	230	239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017295	ATTA	2	8	246	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017295	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017295	T	6	6	352	357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017295	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017295	TTTA	2	8	428	435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017295	AAAT	2	8	436	443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017295	T	7	7	443	449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017295	AGG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017295	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017295	TAT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017295	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017295	AGT	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017295	TAA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017295	T	7	7	1921	1927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017295	TTG	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017295	CAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017295	CTA	3	9	1983	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017295	TAC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017295	TAT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017295	TAA	2	6	2045	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017295	GGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017295	TAT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017295	AGG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017295	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017295	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017295	AGG	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017295	TGA	2	6	6774	6779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017295	TA	3	6	9287	9292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017295	ATA	2	6	9391	9396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017295	GAA	2	6	9397	9402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017295	TA	3	6	9417	9422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017295	ATA	2	6	9461	9466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017295	TGT	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017295	GCA	2	6	9489	9494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017295	A	8	8	9516	9523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017295	TAAA	2	8	9538	9545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017295	TAAA	2	8	9651	9658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017295	TAT	2	6	9696	9701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017295	GGC	2	6	9749	9754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017295	GCG	2	6	9797	9802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017295	ACCT	2	8	9826	9833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017295	ATA	2	6	9875	9880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017295	TTG	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017295	GCA	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017295	GCA	2	6	10091	10096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017295	CGC	2	6	10098	10103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017295	GTGA	2	8	10104	10111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017295	AGG	2	6	10167	10172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017295	CAG	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017295	GAA	2	6	10386	10391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017295	GGC	2	6	10405	10410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017295	AGG	2	6	10509	10514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017295	AGC	2	6	10614	10619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017295	GAA	2	6	10649	10654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017295	GGT	2	6	10724	10729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017295	GTC	2	6	10738	10743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017295	TCGTG	2	10	10747	10756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017295	GGA	2	6	10850	10855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017295	ATC	2	6	10874	10879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017295	AC	3	6	10901	10906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017295	TGG	2	6	10916	10921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017295	AC	3	6	11069	11074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017295	CCT	2	6	11210	11215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017295	TC	3	6	11289	11294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017295	TGT	2	6	11368	11373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017295	AT	3	6	11384	11389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017295	TA	3	6	11566	11571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017295	GGA	2	6	11608	11613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017295	AGAA	2	8	11616	11623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017295	TAG	2	6	11637	11642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017295	GCGA	2	8	11645	11652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017295	A	6	6	11780	11785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017295	ACC	2	6	11843	11848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017295	TAC	2	6	11862	11867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017295	GAA	2	6	11883	11888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017295	AGG	2	6	11919	11924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017295	GT	3	6	11948	11953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017295	TG	3	6	11978	11983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017295	ATG	2	6	11984	11989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017295	GCA	2	6	12025	12030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017295	ATGA	2	8	12274	12281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017295	ACA	2	6	12318	12323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017295	AGC	2	6	12501	12506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017295	GA	3	6	12674	12679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017295	AGG	2	6	12865	12870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017295	TAC	2	6	12972	12977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017295	TGC	2	6	12995	13000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017295	AGGT	2	8	13051	13058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017295	GAG	2	6	13059	13064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017295	GAA	2	6	13083	13088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017295	CGG	2	6	13306	13311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017295	TGCT	2	8	13438	13445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017295	GTC	2	6	13563	13568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017295	ACC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017295	AGG	2	6	13638	13643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017295	CCT	2	6	13665	13670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017295	CG	3	6	13718	13723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017295	ACAA	2	8	13759	13766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017295	TCG	2	6	13916	13921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017295	CGT	2	6	13996	14001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017295	GAG	2	6	14045	14050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017295	AGATT	2	10	14181	14190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017295	CATAA	2	10	14194	14203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017295	AAC	2	6	14224	14229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017295	CTGA	2	8	14270	14277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017295	AT	3	6	14315	14320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017295	TAAA	2	8	14365	14372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017295	CGGT	2	8	14537	14544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017295	CCA	2	6	14568	14573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017295	CCA	2	6	14645	14650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017295	A	6	6	14652	14657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017295	T	6	6	14680	14685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017295	TA	3	6	14697	14702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017295	AGG	2	6	14722	14727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017295	AT	3	6	15250	15255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017295	A	6	6	15805	15810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017295	T	7	7	18583	18589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017295	ATTT	2	8	18595	18602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017295	ATA	2	6	18626	18631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017295	GGA	2	6	18642	18647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017295	G	6	6	19532	19537	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017295	ATT	2	6	21205	21210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017295	AT	3	6	21216	21221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017295	AAT	2	6	21236	21241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017295	AG	3	6	21282	21287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017295	TGGT	2	8	21292	21299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017295	ATTA	2	8	21403	21410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017295	GGT	2	6	21412	21417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017295	T	7	7	21458	21464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017295	AGA	2	6	21493	21498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017295	T	8	8	21513	21520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017295	T	6	6	21552	21557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017295	ATA	2	6	21565	21570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017295	A	6	6	21572	21577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017295	TA	3	6	22709	22714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017295	ATAA	2	8	23637	23644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017295	GAA	2	6	23653	23658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017295	TA	3	6	23659	23664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017295	AAG	2	6	23689	23694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017295	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017295	ATT	2	6	26289	26294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017295	T	6	6	26293	26298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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