MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 3801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017281	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017281	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017281	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017281	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017281	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017281	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017281	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017281	TA	3	6	6516	6521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017281	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017281	TAAT	2	8	6557	6564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017281	TAAT	2	8	6566	6573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017281	A	7	7	6584	6590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017281	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017281	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017281	TCA	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017281	TTA	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017281	T	6	6	6664	6669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017281	ATT	2	6	6689	6694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017281	T	6	6	8031	8036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017281	ATTT	3	12	8038	8049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017281	A	7	7	8075	8081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017281	AAG	2	6	14675	14680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017281	A	6	6	14953	14958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017281	T	6	6	15657	15662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017281	TAT	2	6	15681	15686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017281	A	7	7	15687	15693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017281	TAA	2	6	15707	15712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017281	AAAT	2	8	15741	15748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017281	A	6	6	15783	15788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017281	TTA	2	6	15789	15794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017281	A	6	6	17672	17677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017281	GTT	2	6	17711	17716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017281	CTG	2	6	17756	17761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017281	AAAAT	2	10	17915	17924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017281	TTTA	2	8	17941	17948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017281	TAG	2	6	17963	17968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017281	T	7	7	19219	19225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017281	AATTTA	2	12	19228	19239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017281	AAAAT	2	10	21740	21749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017281	GTTAA	2	10	21767	21776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017281	A	6	6	21786	21791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017281	AGATA	2	10	23524	23533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017281	T	6	6	25431	25436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017281	ATT	2	6	25466	25471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017281	T	7	7	25470	25476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017281	A	6	6	25492	25497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017281	TGAT	2	8	25499	25506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017281	CAT	2	6	25522	25527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017281	T	6	6	26391	26396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017281	ATT	2	6	26399	26404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017281	TTTTAT	2	12	26411	26422	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017281	TAA	2	6	26433	26438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017281	T	6	6	26469	26474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017281	AAGG	2	8	27843	27850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017281	T	6	6	32399	32404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017281	T	6	6	32415	32420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017281	T	6	6	32433	32438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017281	A	7	7	32487	32493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017281	TTA	2	6	32500	32505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017281	TAA	2	6	35722	35727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017281	A	6	6	35732	35737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017281	A	6	6	35755	35760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017281	TTAT	2	8	35761	35768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017281	TGT	2	6	35770	35775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017281	T	6	6	36792	36797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017281	TATAT	2	10	36860	36869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017281	TATAT	2	10	36873	36882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017281	T	6	6	36889	36894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017281	C	10	10	36912	36921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_017281	CCA	2	6	36932	36937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017281	TA	4	8	36944	36951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017281	T	7	7	37031	37037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017281	A	6	6	37039	37044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017281	TAG	2	6	37083	37088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017281	T	6	6	37135	37140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017281	T	6	6	37151	37156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017281	CTTTT	2	10	37167	37176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017281	T	6	6	37185	37190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017281	TTA	2	6	37227	37232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017281	TAA	2	6	37314	37319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017281	GAA	2	6	37368	37373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017281	CTAT	2	8	37384	37391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017281	GGC	2	6	37433	37438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017281	ACA	2	6	37543	37548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017281	TA	3	6	37628	37633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017281	GGTAA	2	10	37647	37656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017281	GAT	2	6	37695	37700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017281	GCA	2	6	37744	37749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017281	GCA	2	6	37784	37789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017281	CGC	2	6	37791	37796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017281	GGA	2	6	37799	37804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017281	GAA	2	6	37840	37845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017281	CAG	2	6	37888	37893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017281	TGG	2	6	38047	38052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017281	CTG	2	6	38105	38110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017281	GTT	2	6	38198	38203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017281	GAA	2	6	38342	38347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017281	TGC	2	6	38422	38427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017281	GTC	2	6	38434	38439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017281	TCGTG	2	10	38443	38452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017281	AGG	3	9	38542	38550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017281	GAC	2	6	38559	38564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017281	TCA	2	6	38571	38576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017281	AC	3	6	38597	38602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017281	CCT	2	6	38901	38906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017281	TAA	2	6	38922	38927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017281	AT	3	6	38948	38953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017281	TGA	2	6	38988	38993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017281	AGG	2	6	39051	39056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017281	CCA	2	6	39081	39086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017281	TTA	2	6	39088	39093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017281	A	6	6	39173	39178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017281	AAG	2	6	39189	39194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017281	TA	3	6	39214	39219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017281	ATTT	2	8	39257	39264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017281	ATTTAT	2	12	39323	39334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017281	AT	4	8	39348	39355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017281	CAAG	2	8	39411	39418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017281	TAA	2	6	39422	39427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017281	TCTTT	2	10	39469	39478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017281	TAACT	2	10	39483	39492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017281	TCT	2	6	39501	39506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017281	AAG	2	6	39636	39641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017281	AAT	2	6	39687	39692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017281	A	6	6	39700	39705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017281	CTA	2	6	39712	39717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017281	TGG	2	6	39726	39731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017281	AAG	2	6	39795	39800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017281	TA	3	6	39857	39862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017281	GCG	2	6	39933	39938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017281	TAGC	2	8	40076	40083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017281	TGC	2	6	40389	40394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017281	GGA	2	6	40452	40457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017281	TC	3	6	40538	40543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017281	AT	3	6	40548	40553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017281	CAG	2	6	40662	40667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017281	GGC	2	6	40671	40676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017281	CGT	2	6	40690	40695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017281	AAC	2	6	40705	40710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017281	CTTA	2	8	40738	40745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017281	AGG	2	6	40779	40784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017281	AGC	2	6	40795	40800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017281	AAAG	2	8	40809	40816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017281	AGTA	2	8	40869	40876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017281	CA	3	6	40894	40899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017281	ATT	2	6	40906	40911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017281	AGT	2	6	41031	41036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017281	TG	3	6	41043	41048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017281	GGTG	2	8	41496	41503	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017281	T	6	6	42976	42981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017281	AAG	2	6	43063	43068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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