MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 9794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017028	ACTT	2	8	1160437	1160444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_017028	C	10	10	1160445	1160454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8003	NC_017028	TC	3	6	1160466	1160471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_017028	AT	3	6	1160497	1160502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017028	AGA	3	9	1160531	1160539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017028	TGA	2	6	1160564	1160569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017028	GAA	2	6	1160574	1160579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017028	TTAATA	2	12	1160618	1160629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017028	TGTT	2	8	1161662	1161669	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017028	TAA	2	6	1161692	1161697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017028	AGTA	2	8	1162664	1162671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017028	GGAGC	2	10	1162715	1162724	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8013	NC_017028	GAC	2	6	1162760	1162765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_017028	ATT	2	6	1164922	1164927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017028	TAA	2	6	1164945	1164950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017028	AT	3	6	1164951	1164956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017028	ATA	2	6	1164971	1164976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017028	AT	3	6	1164991	1164996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017028	ATA	2	6	1165000	1165005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017028	A	6	6	1165005	1165010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017028	TGCT	2	8	1165014	1165021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_017028	GAT	2	6	1165050	1165055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017028	GAG	2	6	1165068	1165073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017028	AAT	2	6	1165163	1165168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017028	A	6	6	1165185	1165190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017028	TAA	2	6	1165199	1165204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017028	AGC	2	6	1166567	1166572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_017028	AAT	2	6	1166599	1166604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017028	TGC	2	6	1166621	1166626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_017028	CTT	2	6	1166646	1166651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_017028	GAC	2	6	1166657	1166662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017028	CAA	2	6	1166676	1166681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_017028	A	7	7	1166734	1166740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017028	TTTTTA	2	12	1166765	1166776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017028	ACGA	2	8	1166818	1166825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_017028	ACA	2	6	1166826	1166831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_017028	AAC	2	6	1166865	1166870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017028	TA	3	6	1166887	1166892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017028	TTG	2	6	1166915	1166920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017028	TAC	2	6	1166934	1166939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_017028	AATT	2	8	1166960	1166967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017028	TGC	2	6	1166976	1166981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_017028	CAG	2	6	1167065	1167070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_017028	TAC	2	6	1167081	1167086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_017028	GAA	2	6	1167130	1167135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017028	ATT	2	6	1167141	1167146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017028	TAT	2	6	1167147	1167152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017028	TA	3	6	1167265	1167270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017028	AT	3	6	1167297	1167302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017028	AAT	2	6	1167306	1167311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017028	AAT	2	6	1167329	1167334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017028	AAGA	2	8	1167336	1167343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017028	GAA	2	6	1167394	1167399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017028	AT	3	6	1167412	1167417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017028	A	7	7	1167465	1167471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017028	AATTT	2	10	1167495	1167504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017028	GAT	2	6	1167512	1167517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017028	A	7	7	1167539	1167545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017028	TTA	2	6	1167546	1167551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017028	ACAT	2	8	1167554	1167561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_017028	AT	3	6	1167560	1167565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017028	TTGCTT	2	12	1167630	1167641	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8063	NC_017028	ATT	2	6	1167650	1167655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017028	A	6	6	1167667	1167672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017028	TAG	2	6	1167718	1167723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017028	CTT	2	6	1167785	1167790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017028	GTA	2	6	1167808	1167813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017028	ATT	2	6	1167833	1167838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017028	ATT	2	6	1167841	1167846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017028	TAT	2	6	1167851	1167856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017028	ATT	2	6	1167879	1167884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017028	ATA	2	6	1167900	1167905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017028	TAT	2	6	1167909	1167914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017028	TTA	3	9	1167929	1167937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017028	T	6	6	1167970	1167975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017028	TAT	2	6	1168017	1168022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017028	GAGT	2	8	1168055	1168062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_017028	TAT	2	6	1168100	1168105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017028	AGT	2	6	1168117	1168122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017028	TTA	2	6	1168178	1168183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017028	AGA	2	6	1168242	1168247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8084	NC_017028	A	8	8	1169108	1169115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017028	TA	3	6	1170998	1171003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_017028	T	7	7	1171062	1171068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017028	TAT	2	6	1171074	1171079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017028	AT	3	6	1171094	1171099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017028	T	6	6	1171166	1171171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_017028	TAA	2	6	1171207	1171212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017028	A	8	8	1171242	1171249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8096	NC_017028	GTA	2	6	1171362	1171367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017028	TAA	2	6	1171439	1171444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017028	ATA	2	6	1171449	1171454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017028	TAA	2	6	1171515	1171520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017028	AGCA	2	8	1171536	1171543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_017028	T	6	6	1171657	1171662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017028	CTA	2	6	1171721	1171726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_017028	GGCT	2	8	1171763	1171770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8104	NC_017028	AAT	2	6	1171792	1171797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017028	T	6	6	1171827	1171832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017028	TCA	2	6	1171887	1171892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8109	NC_017028	TCT	2	6	1171994	1171999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8111	NC_017028	ATA	2	6	1172108	1172113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017028	ATA	2	6	1172168	1172173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017028	TAA	2	6	1172244	1172249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017028	A	7	7	1172280	1172286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017028	ATT	2	6	1172323	1172328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8117	NC_017028	TCTT	2	8	1172385	1172392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_017028	CTT	2	6	1172423	1172428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_017028	CTA	2	6	1172474	1172479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_017028	ATA	2	6	1172501	1172506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017028	AATT	2	8	1172563	1172570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017028	TAATTT	2	12	1172614	1172625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017028	ACT	2	6	1172674	1172679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8125	NC_017028	TCT	2	6	1172795	1172800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_017028	TTAA	2	8	1172828	1172835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017028	TAT	2	6	1172848	1172853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017028	A	6	6	1172924	1172929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017028	TTAT	2	8	1172951	1172958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017028	ATTCT	2	10	1172982	1172991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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