MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 5940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016932	TTTA	2	8	238127	238134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016932	GAT	2	6	238137	238142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016932	A	6	6	238144	238149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016932	ACT	2	6	238203	238208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016932	GAA	2	6	238284	238289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016932	ATT	2	6	239101	239106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016932	CGCC	2	8	245973	245980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
508	NC_016932	TTC	2	6	247116	247121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016932	AGTT	2	8	247136	247143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016932	CTG	2	6	247192	247197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016932	TTC	2	6	247218	247223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016932	GTA	2	6	247256	247261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016932	GTT	2	6	247390	247395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016932	TTC	2	6	247466	247471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016932	ATT	2	6	249367	249372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016932	TGA	2	6	251021	251026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016932	GTG	2	6	251068	251073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016932	A	6	6	251082	251087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016932	AT	3	6	251096	251101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016932	GAA	2	6	251126	251131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016932	G	6	6	251166	251171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016932	TAA	2	6	252076	252081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016932	ACTC	2	8	254873	254880	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_016932	ATGA	2	8	255345	255352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016932	ATTA	2	8	255408	255415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016932	CTG	2	6	256850	256855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016932	GGT	2	6	259628	259633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016932	ACA	2	6	259672	259677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016932	GC	3	6	259748	259753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_016932	GAAT	2	8	260034	260041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016932	GTA	2	6	262318	262323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016932	GGC	2	6	262397	262402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016932	G	6	6	262451	262456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016932	ATG	2	6	262489	262494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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537	NC_016932	TATT	2	8	262587	262594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016932	AGTC	2	8	262596	262603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_016932	GGT	2	6	262699	262704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016932	TGG	2	6	272507	272512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016932	CAG	2	6	272596	272601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016932	CGG	2	6	272636	272641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016932	AACT	2	8	272652	272659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_016932	TGA	2	6	272661	272666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016932	CCTT	2	8	272741	272748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_016932	CGG	3	9	272802	272810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016932	GCA	2	6	272848	272853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016932	TTG	2	6	272871	272876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016932	GCC	2	6	272882	272887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_016932	GA	3	6	272997	273002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016932	AG	3	6	274124	274129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016932	CGG	2	6	274143	274148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016932	TGA	2	6	274188	274193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016932	CGTG	2	8	275237	275244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_016932	AGG	2	6	275255	275260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016932	GC	3	6	275272	275277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_016932	CCA	2	6	275526	275531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016932	TAT	2	6	275607	275612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_016932	CGG	2	6	275645	275650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016932	TGG	2	6	275948	275953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016932	AGT	2	6	278768	278773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016932	GAA	2	6	279134	279139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016932	GGT	2	6	279227	279232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016932	GTT	2	6	279251	279256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016932	TCCC	2	8	281512	281519	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
567	NC_016932	CTG	2	6	281561	281566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016932	TTA	2	6	281571	281576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016932	GCG	2	6	281664	281669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016932	GTT	2	6	283446	283451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016932	CAA	2	6	283465	283470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016932	GAA	2	6	283475	283480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016932	ATT	2	6	283484	283489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016932	GCT	2	6	285179	285184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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576	NC_016932	GCT	4	12	285239	285250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_016932	AAGG	2	8	288948	288955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016932	GT	3	6	291227	291232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016932	ATTAG	2	10	299900	299909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016932	T	6	6	300070	300075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016932	GTA	2	6	301230	301235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016932	AGA	2	6	301606	301611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016932	T	6	6	306634	306639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016932	ATCG	2	8	306678	306685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_016932	CAA	2	6	306788	306793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016932	ATG	2	6	306814	306819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016932	TGCC	2	8	307903	307910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_016932	AGCGG	2	10	307922	307931	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
591	NC_016932	CCTT	2	8	314239	314246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_016932	GT	3	6	314258	314263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016932	GCT	2	6	314341	314346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_016932	TTTGCC	2	12	315415	315426	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016932	GTA	2	6	315437	315442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016932	TCT	2	6	315542	315547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016932	CAG	2	6	315567	315572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016932	TGGGG	2	10	315610	315619	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_016932	GAT	2	6	315654	315659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_016932	GGA	2	6	315697	315702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016932	GT	4	8	315735	315742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016932	CAA	2	6	315847	315852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016932	CTA	2	6	316041	316046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_016932	TTG	2	6	316111	316116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016932	GGT	2	6	316117	316122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016932	AAC	2	6	316160	316165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016932	GT	3	6	316292	316297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016932	TTC	2	6	316301	316306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_016932	AAG	2	6	316346	316351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016932	GTC	2	6	316361	316366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_016932	GTA	2	6	316384	316389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016932	ACA	2	6	316551	316556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016932	GAG	2	6	316559	316564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_016932	AGC	2	6	318026	318031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016932	GTT	2	6	318041	318046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016932	AGT	2	6	318078	318083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016932	ACT	3	9	318108	318116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016932	CA	3	6	318615	318620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_016932	CCT	2	6	319395	319400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_016932	CA	3	6	319406	319411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_016932	AGG	2	6	319418	319423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016932	GA	3	6	322183	322188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016932	ATG	2	6	322202	322207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016932	TTAT	2	8	322241	322248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016932	ACC	2	6	324265	324270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_016932	TAC	2	6	324664	324669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016932	TCA	2	6	327593	327598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016932	AGCG	2	8	327612	327619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
632	NC_016932	ATC	2	6	327642	327647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016932	TGCC	2	8	327696	327703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_016932	CAA	2	6	327731	327736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_016932	GCT	2	6	327769	327774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016932	GCT	2	6	327793	327798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016932	ACAG	2	8	327831	327838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_016932	CCA	2	6	327970	327975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_016932	TGG	2	6	328239	328244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_016932	CAC	2	6	328397	328402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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643	NC_016932	CAA	2	6	328498	328503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_016932	GAG	2	6	328509	328514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_016932	GAT	2	6	328598	328603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_016932	CGA	2	6	333460	333465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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655	NC_016932	G	6	6	337190	337195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_016932	CAT	2	6	343679	343684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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667	NC_016932	AAT	2	6	343829	343834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_016932	GAA	2	6	345723	345728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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670	NC_016932	GTT	2	6	349912	349917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
671	NC_016932	CTTGC	2	10	349958	349967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
672	NC_016932	TG	3	6	349986	349991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
673	NC_016932	GTC	2	6	350002	350007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_016932	GTC	2	6	350558	350563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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683	NC_016932	T	6	6	350853	350858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
684	NC_016932	CTT	2	6	350917	350922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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721	NC_016932	CCA	2	6	359872	359877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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769	NC_016932	CCT	2	6	389624	389629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
770	NC_016932	AGC	2	6	389639	389644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_016932	T	6	6	389659	389664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_016932	GTA	2	6	393046	393051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_016932	TCG	2	6	449224	449229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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