MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 5940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016932	ACT	2	6	2054291	2054296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_016932	CCG	2	6	2054323	2054328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_016932	AGC	2	6	2054335	2054340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_016932	AAC	2	6	2054343	2054348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_016932	ATG	2	6	2054353	2054358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016932	ATC	2	6	2054451	2054456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_016932	AG	3	6	2054626	2054631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016932	TCAA	2	8	2054755	2054762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_016932	CTG	2	6	2054877	2054882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_016932	AAC	2	6	2054923	2054928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016932	GCT	2	6	2054978	2054983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_016932	CTC	2	6	2054994	2054999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_016932	CAG	2	6	2055007	2055012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_016932	TG	3	6	2055136	2055141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016932	AGC	2	6	2055145	2055150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_016932	TCCA	2	8	2055247	2055254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_016932	AAG	2	6	2055337	2055342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016932	CGATG	2	10	2055370	2055379	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5020	NC_016932	A	6	6	2055560	2055565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016932	CTG	2	6	2055609	2055614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_016932	AC	3	6	2055954	2055959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_016932	GGCC	2	8	2055993	2056000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_016932	CAG	2	6	2056043	2056048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_016932	CAT	2	6	2056256	2056261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5029	NC_016932	CAC	2	6	2056550	2056555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5031	NC_016932	GCC	2	6	2056710	2056715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_016932	TAA	2	6	2056766	2056771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016932	GGC	2	6	2056878	2056883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5042	NC_016932	CTTTAA	2	12	2057417	2057428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5043	NC_016932	GCA	2	6	2057458	2057463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5047	NC_016932	T	6	6	2057709	2057714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5050	NC_016932	AAT	2	6	2057808	2057813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016932	GTT	2	6	2057838	2057843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5058	NC_016932	CGCTT	2	10	2058360	2058369	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5061	NC_016932	CGG	2	6	2058487	2058492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_016932	CTTT	2	8	2058518	2058525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_016932	TCT	2	6	2058713	2058718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_016932	CCA	2	6	2058742	2058747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_016932	TCC	2	6	2058784	2058789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_016932	TTG	2	6	2058807	2058812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016932	TTCT	2	8	2058897	2058904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5075	NC_016932	GTA	2	6	2059137	2059142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_016932	AGGTCA	2	12	2059699	2059710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5083	NC_016932	GAG	2	6	2059718	2059723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016932	GGC	2	6	2059753	2059758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_016932	GCC	2	6	2059783	2059788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_016932	T	6	6	2059881	2059886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_016932	CAAT	2	8	2061613	2061620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_016932	CTT	2	6	2061724	2061729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_016932	ATTT	2	8	2061737	2061744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_016932	ATA	2	6	2061745	2061750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_016932	TATT	2	8	2061859	2061866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016932	A	6	6	2063280	2063285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016932	TCCT	2	8	2066655	2066662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_016932	AGAA	2	8	2068407	2068414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016932	AAG	2	6	2068420	2068425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016932	ATC	2	6	2068442	2068447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_016932	TA	3	6	2068477	2068482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016932	ACC	2	6	2068488	2068493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_016932	CTTTAG	2	12	2068496	2068507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5101	NC_016932	GAA	2	6	2068511	2068516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016932	T	6	6	2068527	2068532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016932	GCT	2	6	2068567	2068572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016932	AGTC	2	8	2070211	2070218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_016932	TC	3	6	2070221	2070226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_016932	ACCC	2	8	2070303	2070310	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5107	NC_016932	AGCAC	2	10	2070402	2070411	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5111	NC_016932	GTA	3	9	2076686	2076694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016932	GAA	2	6	2077732	2077737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_016932	CAAT	2	8	2077760	2077767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_016932	A	6	6	2077813	2077818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016932	TTGA	2	8	2078176	2078183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_016932	GCA	2	6	2078224	2078229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_016932	CTT	3	9	2083612	2083620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_016932	CAT	2	6	2083685	2083690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_016932	TCA	2	6	2083743	2083748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_016932	TGT	2	6	2083795	2083800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016932	GCT	2	6	2083818	2083823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_016932	TCT	2	6	2083828	2083833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_016932	ATC	2	6	2083887	2083892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_016932	GGAT	2	8	2083912	2083919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016932	AAC	2	6	2083949	2083954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_016932	AGG	2	6	2083974	2083979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016932	TCA	2	6	2084083	2084088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_016932	CCA	2	6	2084172	2084177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_016932	TGC	2	6	2084222	2084227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_016932	CAT	2	6	2084237	2084242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_016932	ACC	2	6	2084411	2084416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_016932	ATG	2	6	2084439	2084444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_016932	CGG	2	6	2084465	2084470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_016932	AGA	2	6	2084560	2084565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_016932	GCG	2	6	2084610	2084615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5138	NC_016932	CTT	2	6	2084633	2084638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_016932	GCTT	2	8	2084646	2084653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5140	NC_016932	GCA	2	6	2084680	2084685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_016932	AAT	2	6	2084792	2084797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_016932	T	6	6	2084822	2084827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_016932	T	6	6	2084974	2084979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_016932	A	6	6	2085036	2085041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_016932	TAC	2	6	2085094	2085099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5146	NC_016932	A	7	7	2085108	2085114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_016932	ATT	2	6	2085131	2085136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_016932	A	6	6	2085197	2085202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_016932	T	7	7	2085272	2085278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_016932	AT	3	6	2085283	2085288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_016932	CA	3	6	2085331	2085336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5152	NC_016932	TGGG	2	8	2088499	2088506	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_016932	CCT	2	6	2093233	2093238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5154	NC_016932	GC	3	6	2093243	2093248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5155	NC_016932	C	6	6	2095161	2095166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5156	NC_016932	AAC	2	6	2095172	2095177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5157	NC_016932	CTT	2	6	2095227	2095232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5158	NC_016932	T	6	6	2095315	2095320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_016932	CCCCCG	2	12	2095373	2095384	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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5161	NC_016932	GCAA	2	8	2097030	2097037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5162	NC_016932	GC	3	6	2097077	2097082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5163	NC_016932	CG	3	6	2097094	2097099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5164	NC_016932	TAG	2	6	2098786	2098791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_016932	CTG	2	6	2098831	2098836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5166	NC_016932	T	6	6	2098842	2098847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_016932	CGC	2	6	2098848	2098853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5171	NC_016932	CG	3	6	2111334	2111339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5172	NC_016932	CTC	2	6	2111409	2111414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5174	NC_016932	TCCC	2	8	2111434	2111441	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5175	NC_016932	CA	3	6	2111572	2111577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5176	NC_016932	TGG	2	6	2115687	2115692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5180	NC_016932	CAT	2	6	2117314	2117319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5188	NC_016932	CG	3	6	2117641	2117646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5189	NC_016932	AGG	2	6	2117647	2117652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5191	NC_016932	CCA	2	6	2117783	2117788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5192	NC_016932	GAC	2	6	2117824	2117829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5195	NC_016932	CAC	2	6	2117980	2117985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5199	NC_016932	AGTC	2	8	2120329	2120336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5200	NC_016932	TTCTA	2	10	2125269	2125278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5201	NC_016932	AAG	2	6	2125344	2125349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5202	NC_016932	GCC	2	6	2125352	2125357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5240	NC_016932	CAA	2	6	2142843	2142848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_016932	CCAGA	2	10	2142861	2142870	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5242	NC_016932	CTA	2	6	2142978	2142983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_016932	TCT	2	6	2143418	2143423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5250	NC_016932	TTC	2	6	2143565	2143570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5252	NC_016932	GTC	2	6	2143652	2143657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_016932	TTA	2	6	2143661	2143666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_016932	TCAAAG	2	12	2143694	2143705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5255	NC_016932	AAAGC	2	10	2143748	2143757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5256	NC_016932	CCA	2	6	2143781	2143786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_016932	AAC	2	6	2143798	2143803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_016932	CTGC	2	8	2143853	2143860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_016932	TTC	2	6	2143867	2143872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_016932	CTC	2	6	2144061	2144066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_016932	GGT	2	6	2144180	2144185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_016932	TTC	2	6	2144300	2144305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_016932	A	6	6	2144461	2144466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_016932	ACT	2	6	2144558	2144563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5266	NC_016932	ACC	2	6	2144767	2144772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5269	NC_016932	TTG	2	6	2144874	2144879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5275	NC_016932	A	6	6	2145146	2145151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_016932	CTT	2	6	2145155	2145160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5292	NC_016932	CTT	2	6	2152309	2152314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5293	NC_016932	CTTT	2	8	2152348	2152355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5294	NC_016932	GACA	2	8	2152391	2152398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5295	NC_016932	GCT	2	6	2152471	2152476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5332	NC_016932	AGAAAA	2	12	2168571	2168582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5335	NC_016932	AT	3	6	2170366	2170371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5378	NC_016932	CA	3	6	2179508	2179513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5379	NC_016932	CCG	2	6	2179515	2179520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5380	NC_016932	T	6	6	2179624	2179629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_016932	GC	3	6	2179651	2179656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5382	NC_016932	CTG	2	6	2180297	2180302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5385	NC_016932	TAT	2	6	2180531	2180536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_016932	GA	3	6	2182642	2182647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_016932	TC	3	6	2182657	2182662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5388	NC_016932	CTA	2	6	2182678	2182683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_016932	CGT	2	6	2182753	2182758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5390	NC_016932	CCG	2	6	2182770	2182775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_016932	ACAA	2	8	2182795	2182802	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5392	NC_016932	GATA	2	8	2182858	2182865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_016932	TGAG	2	8	2184010	2184017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_016932	AGG	2	6	2184076	2184081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5396	NC_016932	CCCA	2	8	2184262	2184269	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5400	NC_016932	AGCA	2	8	2184516	2184523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5401	NC_016932	GAC	2	6	2184550	2184555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5430	NC_016932	TGA	2	6	2192105	2192110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5433	NC_016932	AACT	2	8	2192160	2192167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5434	NC_016932	GTAA	2	8	2192180	2192187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5435	NC_016932	AGAT	2	8	2192226	2192233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_016932	CA	3	6	2202865	2202870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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