MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae 31A chromosome

Total Repeats: 6127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016799	GTT	3	9	2473984	2473992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016799	ACC	2	6	2473997	2474002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_016799	TTG	2	6	2475752	2475757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016799	GTG	2	6	2475788	2475793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016799	TTCC	2	8	2478575	2478582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_016799	AGT	2	6	2481024	2481029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_016799	GGA	2	6	2481069	2481074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016799	CAA	2	6	2481091	2481096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_016799	TCC	2	6	2483005	2483010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_016799	AAT	2	6	2483016	2483021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_016799	TCG	2	6	2483037	2483042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_016799	AAAAC	2	10	2483054	2483063	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_016799	CAA	2	6	2483156	2483161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_016799	AGG	2	6	2483163	2483168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016799	TCCCTT	2	12	2483175	2483186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_016799	ACC	2	6	2483219	2483224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_016799	CGCCAT	2	12	2483230	2483241	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_016799	TGGTC	2	10	2483242	2483251	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6019	NC_016799	A	6	6	2483258	2483263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016799	CTT	2	6	2483279	2483284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016799	TG	3	6	2483287	2483292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_016799	GAG	3	9	2483386	2483394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016799	AGT	2	6	2484923	2484928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016799	GAG	2	6	2484946	2484951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_016799	GAG	2	6	2485763	2485768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016799	G	6	6	2487430	2487435	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016799	GC	3	6	2487448	2487453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_016799	CCA	2	6	2487454	2487459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_016799	GCCA	2	8	2487472	2487479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_016799	AGCCA	2	10	2487485	2487494	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6031	NC_016799	AT	3	6	2487568	2487573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016799	GCGAG	2	10	2489963	2489972	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_016799	ATG	2	6	2490006	2490011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016799	ATCG	2	8	2491461	2491468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_016799	CAC	2	6	2491487	2491492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_016799	AAT	2	6	2491502	2491507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016799	CAG	2	6	2491511	2491516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_016799	CCAT	2	8	2491559	2491566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_016799	AATCA	2	10	2491580	2491589	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_016799	TGC	2	6	2491647	2491652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_016799	CTG	3	9	2491658	2491666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_016799	GCCA	2	8	2491903	2491910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_016799	GCA	2	6	2494234	2494239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_016799	AGG	2	6	2494257	2494262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016799	GCTTT	2	10	2494280	2494289	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6046	NC_016799	CT	3	6	2495108	2495113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_016799	TGG	2	6	2495147	2495152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016799	GAG	2	6	2495782	2495787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016799	AAT	2	6	2497790	2497795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016799	A	6	6	2499967	2499972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016799	CCGTG	2	10	2500716	2500725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6052	NC_016799	GCT	2	6	2500731	2500736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_016799	GGC	2	6	2500822	2500827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_016799	GCT	2	6	2500896	2500901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_016799	A	6	6	2501004	2501009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016799	GTT	2	6	2502328	2502333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016799	TGCG	2	8	2502982	2502989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_016799	GTATT	2	10	2503003	2503012	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016799	TGG	3	9	2503042	2503050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016799	CATT	2	8	2503078	2503085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_016799	CAA	2	6	2503105	2503110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016799	CCA	2	6	2503131	2503136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_016799	ACA	2	6	2503172	2503177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016799	ATG	2	6	2509251	2509256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016799	CCG	2	6	2509264	2509269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_016799	AGT	2	6	2511329	2511334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_016799	ACT	2	6	2511358	2511363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6069	NC_016799	GGT	2	6	2511410	2511415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_016799	CGCC	2	8	2511442	2511449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6071	NC_016799	CAA	2	6	2511488	2511493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_016799	TGA	2	6	2511494	2511499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016799	TGG	2	6	2511517	2511522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_016799	TG	3	6	2511547	2511552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_016799	CAAC	2	8	2511629	2511636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_016799	TG	3	6	2513742	2513747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016799	CA	3	6	2515467	2515472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_016799	CAC	2	6	2515482	2515487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_016799	A	6	6	2515490	2515495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016799	ACA	2	6	2515510	2515515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_016799	CAC	2	6	2515549	2515554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6088	NC_016799	TG	3	6	2525964	2525969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_016799	ACT	2	6	2526752	2526757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6096	NC_016799	GCACA	2	10	2529334	2529343	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6100	NC_016799	T	6	6	2531545	2531550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016799	TA	3	6	2531560	2531565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016799	GT	3	6	2531582	2531587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016799	CAG	2	6	2532368	2532373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_016799	GCC	2	6	2533456	2533461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_016799	ACCGC	2	10	2533620	2533629	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6109	NC_016799	CGT	2	6	2534036	2534041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6111	NC_016799	GAT	2	6	2534284	2534289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016799	AG	3	6	2534301	2534306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016799	CGC	2	6	2534312	2534317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_016799	GGC	2	6	2534408	2534413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_016799	GACA	2	8	2534464	2534471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_016799	CAA	2	6	2534502	2534507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_016799	AATGA	2	10	2534596	2534605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016799	ACT	2	6	2534709	2534714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_016799	A	6	6	2534721	2534726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016799	T	6	6	2534761	2534766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016799	GAAA	2	8	2534827	2534834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016799	AAAAT	2	10	2534852	2534861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016799	T	6	6	2534894	2534899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016799	T	6	6	2535017	2535022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016799	TCG	2	6	2535097	2535102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_016799	CTG	2	6	2535237	2535242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_016799	AAC	2	6	2535243	2535248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.