MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 14862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016791	TGA	3	9	2488846	2488854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_016791	GTC	2	6	2488878	2488883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_016791	ATA	2	6	2489038	2489043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_016791	TAT	2	6	2490827	2490832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_016791	AT	3	6	2490843	2490848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016791	GAA	2	6	2490853	2490858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_016791	CCT	2	6	2491789	2491794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_016791	ATT	2	6	2491808	2491813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_016791	CTA	2	6	2491817	2491822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_016791	TA	3	6	2491821	2491826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_016791	CTG	2	6	2491879	2491884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_016791	TAAA	2	8	2491901	2491908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_016791	A	6	6	2491931	2491936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_016791	TA	3	6	2491973	2491978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_016791	TCAAA	2	10	2491991	2492000	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8016	NC_016791	A	7	7	2491998	2492004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_016791	A	6	6	2492025	2492030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_016791	T	6	6	2492045	2492050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_016791	TTATG	2	10	2492089	2492098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_016791	TGTT	2	8	2492144	2492151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_016791	T	6	6	2492163	2492168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_016791	TGT	2	6	2492191	2492196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_016791	CCA	2	6	2492202	2492207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_016791	AT	3	6	2492246	2492251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_016791	AT	3	6	2492258	2492263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_016791	TTTTGC	2	12	2492269	2492280	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8027	NC_016791	TAT	2	6	2492285	2492290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_016791	TG	3	6	2492382	2492387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_016791	TTC	2	6	2492433	2492438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_016791	TTAT	2	8	2492458	2492465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_016791	TGTT	2	8	2492469	2492476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_016791	ACAG	2	8	2492524	2492531	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8033	NC_016791	CTAG	3	12	2492535	2492546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8034	NC_016791	CAT	2	6	2492569	2492574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_016791	CAT	2	6	2492734	2492739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_016791	A	7	7	2492798	2492804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_016791	CAT	2	6	2492830	2492835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_016791	TAT	2	6	2493086	2493091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_016791	CTC	2	6	2493108	2493113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_016791	ATG	2	6	2493117	2493122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_016791	TAT	2	6	2495024	2495029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_016791	A	7	7	2495098	2495104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_016791	AAC	2	6	2495114	2495119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_016791	T	6	6	2495136	2495141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_016791	AGC	2	6	2495202	2495207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_016791	AT	3	6	2495351	2495356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_016791	ATCCTG	2	12	2495392	2495403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_016791	TAT	2	6	2495414	2495419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_016791	TAT	2	6	2495422	2495427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_016791	TTA	2	6	2495461	2495466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_016791	ATT	2	6	2495558	2495563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_016791	AGT	2	6	2495569	2495574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_016791	A	6	6	2495630	2495635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_016791	TAT	2	6	2495664	2495669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_016791	CG	3	6	2495717	2495722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_016791	TCT	2	6	2495739	2495744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_016791	GTA	2	6	2495762	2495767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_016791	ATA	2	6	2495837	2495842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_016791	TAAT	2	8	2497792	2497799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_016791	ATT	2	6	2497909	2497914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_016791	TTTC	2	8	2497964	2497971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_016791	TTC	2	6	2497976	2497981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_016791	TAAA	2	8	2497992	2497999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_016791	ATA	2	6	2498024	2498029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_016791	A	6	6	2498049	2498054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_016791	TTTA	2	8	2498092	2498099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_016791	T	6	6	2498133	2498138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_016791	G	6	6	2498154	2498159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_016791	ATA	2	6	2498182	2498187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_016791	CTT	2	6	2498200	2498205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_016791	T	6	6	2498204	2498209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_016791	TAA	2	6	2498254	2498259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_016791	TCA	2	6	2498265	2498270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_016791	TATGA	2	10	2498303	2498312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_016791	TGG	2	6	2498342	2498347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_016791	TC	3	6	2498350	2498355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_016791	TAC	2	6	2498524	2498529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_016791	GT	3	6	2498550	2498555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_016791	CCA	2	6	2498591	2498596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_016791	G	7	7	2498608	2498614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_016791	TCC	2	6	2498634	2498639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_016791	ATC	2	6	2498660	2498665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_016791	ATT	2	6	2498759	2498764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_016791	ATC	2	6	2498781	2498786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_016791	TAA	2	6	2499502	2499507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_016791	CCT	2	6	2499509	2499514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_016791	AT	3	6	2499531	2499536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_016791	CTT	2	6	2499556	2499561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_016791	TC	3	6	2499949	2499954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_016791	TTA	2	6	2499959	2499964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_016791	CCT	2	6	2501998	2502003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_016791	TTG	2	6	2502017	2502022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_016791	TTTATA	2	12	2502051	2502062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_016791	ATT	2	6	2502073	2502078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_016791	TAAA	2	8	2502093	2502100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_016791	A	7	7	2502098	2502104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_016791	AT	3	6	2502144	2502149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_016791	TAT	2	6	2504095	2504100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_016791	TAG	2	6	2504185	2504190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_016791	CAA	2	6	2504204	2504209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_016791	CTG	2	6	2504296	2504301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_016791	TA	3	6	2504367	2504372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_016791	AAT	2	6	2505251	2505256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_016791	ATA	2	6	2505290	2505295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_016791	TTTTA	2	10	2505320	2505329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_016791	GA	3	6	2505359	2505364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_016791	TCC	2	6	2506022	2506027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_016791	CTCC	2	8	2506356	2506363	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8112	NC_016791	GTT	2	6	2506401	2506406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_016791	TTTA	2	8	2506416	2506423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_016791	A	6	6	2506451	2506456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_016791	TAT	2	6	2506469	2506474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_016791	T	6	6	2506509	2506514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_016791	ATTA	2	8	2510446	2510453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_016791	ATA	2	6	2510463	2510468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_016791	ACC	2	6	2510509	2510514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_016791	ATT	2	6	2510518	2510523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_016791	ATA	2	6	2510538	2510543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_016791	AAT	2	6	2510551	2510556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_016791	TCA	2	6	2510576	2510581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8126	NC_016791	CT	3	6	2510693	2510698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_016791	ATC	2	6	2510728	2510733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8129	NC_016791	CCG	2	6	2510781	2510786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_016791	CTA	2	6	2510793	2510798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_016791	CT	3	6	2510822	2510827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8133	NC_016791	TAT	2	6	2512853	2512858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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