MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC03 chromosome

Total Repeats: 5572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016787	GGT	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016787	ACA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016787	GT	3	6	1787	1792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016787	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016787	AGCGA	2	10	2132	2141	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016787	AAG	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016787	CTC	3	9	2245	2253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016787	GATC	2	8	2270	2277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016787	GAG	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016787	CT	3	6	3491	3496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016787	CGC	2	6	7443	7448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016787	TTC	2	6	8087	8092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016787	ACA	2	6	8155	8160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016787	ATC	2	6	11723	11728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016787	GCA	2	6	11732	11737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016787	TAT	2	6	11753	11758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016787	CCA	2	6	11868	11873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016787	T	6	6	11988	11993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016787	T	6	6	12007	12012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016787	CCT	2	6	12014	12019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016787	CG	3	6	12060	12065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016787	TAATCC	2	12	12927	12938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016787	CAGG	2	8	14684	14691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016787	TCGAC	2	10	14705	14714	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016787	TGA	2	6	14793	14798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016787	AAT	2	6	14830	14835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016787	A	7	7	14858	14864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016787	GT	3	6	14961	14966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016787	CCGG	2	8	14972	14979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016787	GCA	2	6	15116	15121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016787	TGC	2	6	15133	15138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016787	CCA	2	6	19108	19113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016787	TG	3	6	19237	19242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016787	T	6	6	19246	19251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016787	CCT	2	6	19254	19259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016787	CG	3	6	19300	19305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016787	GGA	2	6	19348	19353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016787	CAA	2	6	19367	19372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016787	TGTGA	2	10	19402	19411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016787	GGT	2	6	19476	19481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016787	GGC	2	6	19549	19554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016787	GAT	2	6	19563	19568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016787	TACTGC	2	12	19569	19580	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016787	ACC	2	6	19648	19653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016787	AAG	2	6	20052	20057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016787	AAGCTA	2	12	20103	20114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016787	CGGGGA	2	12	20123	20134	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016787	GTT	2	6	20165	20170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016787	T	6	6	20282	20287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016787	TG	3	6	20291	20296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016787	CCT	2	6	20307	20312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016787	GCAC	2	8	20343	20350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016787	CTT	2	6	20364	20369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016787	GAG	2	6	20393	20398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016787	AGC	2	6	21080	21085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016787	GCT	2	6	21120	21125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016787	AC	3	6	21152	21157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016787	TGG	2	6	21194	21199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016787	CAG	2	6	21260	21265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016787	GAA	2	6	21345	21350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016787	ACG	2	6	25514	25519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016787	GGT	2	6	25577	25582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016787	CAC	2	6	25674	25679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016787	GTT	2	6	26164	26169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016787	GGT	2	6	26170	26175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016787	CTG	2	6	26200	26205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016787	GTG	2	6	26868	26873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016787	AAGG	2	8	27048	27055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016787	CTTG	2	8	27365	27372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016787	GAT	2	6	27385	27390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016787	TCTAGC	2	12	27488	27499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016787	TGA	2	6	27515	27520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016787	ATC	2	6	27587	27592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016787	CTG	2	6	27630	27635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016787	GGC	2	6	27786	27791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016787	CCA	2	6	27810	27815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016787	GCT	2	6	27842	27847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016787	CTT	2	6	27858	27863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016787	GGA	2	6	27885	27890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016787	GGC	2	6	27957	27962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016787	GGTAA	2	10	28041	28050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016787	GTA	2	6	28087	28092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016787	CGCA	2	8	28126	28133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016787	T	6	6	28182	28187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016787	TTGA	2	8	28220	28227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016787	TTGC	2	8	28291	28298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016787	GAAT	2	8	28479	28486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016787	ATT	2	6	28513	28518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016787	T	7	7	29384	29390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016787	CA	3	6	29405	29410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016787	ATAA	2	8	29417	29424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016787	CAG	2	6	29434	29439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016787	GTT	2	6	29458	29463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016787	TGG	2	6	29542	29547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016787	GC	3	6	29554	29559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016787	CCA	2	6	29596	29601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016787	CAG	2	6	29658	29663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016787	TG	3	6	29688	29693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016787	TGA	2	6	29706	29711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016787	TG	3	6	29721	29726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016787	GAA	2	6	29784	29789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016787	TTC	2	6	29858	29863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016787	GTG	2	6	29903	29908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016787	TGG	2	6	29938	29943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016787	AGAT	2	8	30037	30044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016787	AAG	2	6	30059	30064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016787	CCA	2	6	30090	30095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016787	TG	3	6	30124	30129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016787	GTG	3	9	30127	30135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016787	GGT	2	6	30171	30176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016787	GTT	2	6	30235	30240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016787	GCA	2	6	30263	30268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016787	AGTG	2	8	30294	30301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016787	GAAG	2	8	30384	30391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016787	AG	3	6	30390	30395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016787	CAAC	2	8	34036	34043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016787	ACC	2	6	34070	34075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016787	ACC	2	6	34092	34097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016787	GGA	2	6	34121	34126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016787	ACC	3	9	37326	37334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016787	TAGG	2	8	37370	37377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016787	G	6	6	37430	37435	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016787	GCG	2	6	37556	37561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016787	GTG	2	6	37569	37574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016787	GAA	2	6	37585	37590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016787	CGT	2	6	37631	37636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016787	GTA	2	6	37690	37695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016787	TGAT	2	8	37794	37801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016787	TCG	2	6	37810	37815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016787	GTT	2	6	38798	38803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016787	AT	3	6	38860	38865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016787	GGA	2	6	39080	39085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016787	AGA	2	6	41998	42003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016787	TAA	2	6	42092	42097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016787	CGC	2	6	42243	42248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016787	T	6	6	42500	42505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016787	CGC	2	6	42528	42533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016787	AAG	2	6	42600	42605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016787	GGT	2	6	42962	42967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016787	CGG	2	6	43023	43028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016787	GCA	2	6	43076	43081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016787	TGC	2	6	43096	43101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016787	GCC	2	6	43210	43215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016787	TTAT	2	8	43274	43281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016787	AAG	2	6	43287	43292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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