MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC03 chromosome

Total Repeats: 5572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016787	A	6	6	2443179	2443184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016787	GCT	2	6	2444108	2444113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_016787	GTT	2	6	2445539	2445544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016787	TGCG	2	8	2446193	2446200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_016787	TGG	3	9	2446253	2446261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_016787	CATT	2	8	2446289	2446296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_016787	CAA	2	6	2446316	2446321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_016787	CCA	2	6	2446342	2446347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_016787	ACA	2	6	2446383	2446388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_016787	ATG	2	6	2452462	2452467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016787	CCG	2	6	2452475	2452480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_016787	AG	3	6	2452497	2452502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016787	AGT	2	6	2454540	2454545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016787	ACT	2	6	2454569	2454574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_016787	ACG	2	6	2454595	2454600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_016787	GGT	2	6	2454621	2454626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016787	CGCC	2	8	2454653	2454660	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5518	NC_016787	GAT	2	6	2454703	2454708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_016787	TGG	2	6	2454728	2454733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016787	TG	3	6	2454758	2454763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016787	CAC	2	6	2454770	2454775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_016787	T	6	6	2454813	2454818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016787	CAAC	2	8	2454841	2454848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_016787	TG	3	6	2456954	2456959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_016787	CA	3	6	2458679	2458684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_016787	CAC	2	6	2458694	2458699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_016787	A	6	6	2458702	2458707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016787	ACA	2	6	2458722	2458727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_016787	CAC	2	6	2458761	2458766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_016787	TTC	2	6	2461970	2461975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016787	CTT	2	6	2462067	2462072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_016787	GCT	2	6	2469129	2469134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_016787	GCA	2	6	2469139	2469144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016787	TG	3	6	2469176	2469181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_016787	GCC	2	6	2469219	2469224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_016787	TGT	2	6	2469241	2469246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_016787	G	6	6	2469268	2469273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016787	GAAT	2	8	2469923	2469930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_016787	CAC	2	6	2469933	2469938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_016787	ACT	2	6	2469965	2469970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016787	AAGGA	2	10	2471334	2471343	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016787	GCACA	2	10	2472544	2472553	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5543	NC_016787	CCT	2	6	2472566	2472571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_016787	AGG	2	6	2472572	2472577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016787	T	6	6	2472584	2472589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016787	T	6	6	2474756	2474761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016787	TA	3	6	2474771	2474776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016787	GT	3	6	2474793	2474798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_016787	ACT	2	6	2475517	2475522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_016787	CAG	2	6	2475579	2475584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_016787	GCC	2	6	2475591	2475596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_016787	GGC	2	6	2475613	2475618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_016787	TGG	2	6	2476612	2476617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016787	TCG	2	6	2476643	2476648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_016787	GCC	2	6	2476667	2476672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_016787	ACCGC	2	10	2476831	2476840	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5557	NC_016787	CGT	2	6	2477247	2477252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_016787	CTC	2	6	2477430	2477435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_016787	GAT	2	6	2477495	2477500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016787	AG	3	6	2477512	2477517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016787	CGC	2	6	2477523	2477528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_016787	CAA	2	6	2477567	2477572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_016787	GGC	2	6	2477619	2477624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_016787	GACA	2	8	2477675	2477682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_016787	CAA	2	6	2477713	2477718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_016787	CGA	2	6	2477803	2477808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_016787	A	6	6	2477932	2477937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_016787	T	6	6	2477972	2477977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_016787	ATTAC	2	10	2478004	2478013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5570	NC_016787	AAAAT	2	10	2478063	2478072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_016787	T	6	6	2478105	2478110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016787	TCG	2	6	2478307	2478312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.