MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 6489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016781	TCC	2	6	1570105	1570110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_016781	CAT	2	6	1570112	1570117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016781	ATG	2	6	1570127	1570132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016781	GGA	2	6	1570134	1570139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016781	CCA	2	6	1570163	1570168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_016781	TAT	2	6	1570176	1570181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016781	TG	3	6	1570605	1570610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016781	CTTA	2	8	1570667	1570674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_016781	GTC	2	6	1570689	1570694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_016781	AAG	2	6	1570701	1570706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016781	CT	3	6	1570727	1570732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_016781	ATC	2	6	1570839	1570844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_016781	CA	3	6	1570868	1570873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_016781	TGAG	2	8	1570879	1570886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016781	T	6	6	1570917	1570922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016781	CAA	2	6	1572331	1572336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_016781	GTT	2	6	1573417	1573422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016781	CCTC	2	8	1573463	1573470	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4019	NC_016781	A	6	6	1574407	1574412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016781	GTT	2	6	1574424	1574429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016781	ATAA	2	8	1575577	1575584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016781	CTT	2	6	1577156	1577161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_016781	TCT	2	6	1577207	1577212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016781	TA	3	6	1577257	1577262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016781	ACATC	2	10	1577706	1577715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4026	NC_016781	GAG	2	6	1577773	1577778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016781	GGC	2	6	1579821	1579826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4029	NC_016781	TTC	2	6	1579866	1579871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016781	TCC	2	6	1580073	1580078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_016781	TTC	2	6	1582992	1582997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016781	CGC	2	6	1583006	1583011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_016781	CAG	2	6	1583018	1583023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_016781	AT	3	6	1583031	1583036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016781	AAC	2	6	1584673	1584678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_016781	CCA	2	6	1584680	1584685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_016781	TGG	2	6	1584705	1584710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4039	NC_016781	AG	3	6	1585263	1585268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016781	ACA	2	6	1586046	1586051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_016781	GCC	2	6	1586066	1586071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_016781	AGT	2	6	1586142	1586147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016781	AGAA	2	8	1587223	1587230	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016781	TCT	2	6	1587249	1587254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_016781	T	7	7	1587254	1587260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016781	CAT	2	6	1587266	1587271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_016781	ATCT	2	8	1587435	1587442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_016781	T	6	6	1588340	1588345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016781	CGCTG	2	10	1588633	1588642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_016781	CGC	2	6	1588682	1588687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_016781	GCGG	2	8	1588747	1588754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_016781	ACT	2	6	1588826	1588831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_016781	TC	3	6	1588901	1588906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_016781	AGC	2	6	1590516	1590521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4056	NC_016781	GCA	2	6	1590881	1590886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_016781	GAA	2	6	1590897	1590902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016781	GGA	2	6	1591341	1591346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016781	TCC	2	6	1591374	1591379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_016781	TCT	2	6	1592030	1592035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_016781	CAG	2	6	1592124	1592129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_016781	GAG	2	6	1592149	1592154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016781	CTT	2	6	1592167	1592172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_016781	TGCT	2	8	1592176	1592183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_016781	GTG	2	6	1592192	1592197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016781	GTCGTA	2	12	1592215	1592226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4067	NC_016781	TCG	2	6	1592273	1592278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_016781	CGA	2	6	1592304	1592309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_016781	CCAGG	2	10	1592318	1592327	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4070	NC_016781	CGG	2	6	1592439	1592444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_016781	GCG	2	6	1592445	1592450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_016781	TTC	2	6	1592477	1592482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4075	NC_016781	GAT	2	6	1592699	1592704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016781	AGG	2	6	1592709	1592714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016781	GAT	2	6	1592723	1592728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016781	ACCC	2	8	1592749	1592756	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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4080	NC_016781	GCT	2	6	1592782	1592787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_016781	CA	3	6	1592809	1592814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_016781	CAT	2	6	1592920	1592925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4085	NC_016781	GAG	2	6	1592991	1592996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016781	CAGCC	2	10	1593005	1593014	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4087	NC_016781	ACC	2	6	1593043	1593048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4089	NC_016781	CAG	2	6	1593068	1593073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4093	NC_016781	GTG	2	6	1594713	1594718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016781	GAG	2	6	1594825	1594830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016781	GCTG	2	8	1594850	1594857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_016781	CG	3	6	1594889	1594894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_016781	CAC	2	6	1594928	1594933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_016781	AAG	2	6	1595031	1595036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016781	GCG	2	6	1595270	1595275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_016781	CAA	2	6	1600140	1600145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_016781	GAT	2	6	1600326	1600331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016781	GAT	2	6	1600394	1600399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016781	TCAT	2	8	1600479	1600486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_016781	CGA	2	6	1600514	1600519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_016781	TGG	2	6	1600526	1600531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016781	AGCTGG	2	12	1600540	1600551	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4107	NC_016781	GTT	2	6	1600657	1600662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016781	CGA	2	6	1600692	1600697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016781	CTAT	2	8	1600704	1600711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_016781	GGC	2	6	1600756	1600761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_016781	GGT	2	6	1600771	1600776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016781	ATT	2	6	1600778	1600783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016781	CCG	2	6	1600801	1600806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_016781	GAA	2	6	1600882	1600887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016781	ACA	2	6	1600911	1600916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4118	NC_016781	GC	3	6	1601329	1601334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_016781	TCGA	2	8	1601372	1601379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_016781	GTG	2	6	1601388	1601393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016781	GCTG	2	8	1601434	1601441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_016781	AGG	2	6	1601451	1601456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016781	AACG	2	8	1601542	1601549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_016781	CTG	2	6	1601562	1601567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_016781	TCG	2	6	1601750	1601755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_016781	TGA	2	6	1601833	1601838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016781	ACCT	2	8	1601852	1601859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_016781	CTG	2	6	1601948	1601953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_016781	ACT	2	6	1602004	1602009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_016781	AAAG	2	8	1602129	1602136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016781	TAC	2	6	1602205	1602210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_016781	CGA	2	6	1602255	1602260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016781	GAC	2	6	1602342	1602347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_016781	TCG	2	6	1602352	1602357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4138	NC_016781	GACC	2	8	1602618	1602625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4139	NC_016781	ACC	2	6	1602682	1602687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4140	NC_016781	ACG	2	6	1602713	1602718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_016781	TCG	2	6	1602902	1602907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4160	NC_016781	CAA	2	6	1607276	1607281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4161	NC_016781	AGA	2	6	1607290	1607295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_016781	CGG	2	6	1607644	1607649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4166	NC_016781	CT	3	6	1607739	1607744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4253	NC_016781	CAAG	2	8	1637291	1637298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4254	NC_016781	GAA	2	6	1637328	1637333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_016781	TTGTGT	2	12	1640394	1640405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_016781	T	7	7	1642821	1642827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_016781	GCG	2	6	1642886	1642891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_016781	GCC	2	6	1642909	1642914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4261	NC_016781	CTG	2	6	1642954	1642959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_016781	GCT	2	6	1642971	1642976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_016781	CTG	2	6	1643019	1643024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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