MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 26566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	TA	3	6	33	38	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016627	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016627	ATT	2	6	132	137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016627	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016627	CAA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016627	TTG	2	6	199	204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016627	ATT	2	6	216	221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016627	A	6	6	222	227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016627	TG	3	6	243	248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016627	TAA	3	9	261	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016627	ACA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016627	TAA	2	6	291	296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016627	TAAT	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016627	T	8	8	318	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016627	ATT	3	9	369	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016627	TAT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016627	AT	3	6	422	427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016627	TTAA	2	8	432	439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016627	ATC	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016627	TTAC	2	8	540	547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016627	AT	3	6	548	553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016627	GGA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016627	TA	4	8	1910	1917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016627	AT	3	6	1959	1964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016627	CAA	3	9	1965	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016627	AT	3	6	1990	1995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016627	CAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016627	T	7	7	2039	2045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016627	T	6	6	2047	2052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016627	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016627	TAA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016627	TTA	2	6	2240	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016627	TAT	2	6	2247	2252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016627	A	6	6	2257	2262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016627	AT	3	6	2269	2274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016627	TAT	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016627	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016627	TA	3	6	4899	4904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016627	AAATAA	2	12	4917	4928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016627	AGG	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016627	TA	3	6	5284	5289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016627	TAAA	2	8	5305	5312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016627	TAA	2	6	5316	5321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016627	TTA	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016627	A	8	8	5373	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016627	ATTT	2	8	5404	5411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016627	AGG	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016627	T	6	6	7395	7400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016627	GTATA	2	10	7421	7430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016627	ATTTT	2	10	7506	7515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016627	ATTT	2	8	7525	7532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016627	A	6	6	7542	7547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016627	A	6	6	7561	7566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016627	AT	3	6	7579	7584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016627	AT	4	8	7586	7593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016627	TA	3	6	7619	7624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016627	ATTA	2	8	7645	7652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016627	TA	3	6	7662	7667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016627	A	7	7	7687	7693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016627	T	6	6	7716	7721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016627	AT	4	8	7745	7752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016627	T	7	7	7774	7780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016627	GAGT	2	8	7807	7814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016627	T	6	6	9477	9482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016627	AAC	2	6	9515	9520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016627	TAAA	3	12	9542	9553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016627	AAAT	2	8	9571	9578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016627	TAA	2	6	9592	9597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016627	A	6	6	9596	9601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016627	TAA	2	6	9602	9607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016627	TAT	2	6	9629	9634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016627	TGTT	2	8	10199	10206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016627	ATTA	2	8	10219	10226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016627	TAA	2	6	10252	10257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016627	TAAT	2	8	10264	10271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016627	ATA	2	6	10296	10301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016627	ATT	2	6	10303	10308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016627	TTA	2	6	10339	10344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016627	TCAT	2	8	10388	10395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016627	A	8	8	10401	10408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016627	TAT	2	6	10416	10421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016627	A	6	6	10422	10427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016627	AT	4	8	10486	10493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016627	TCA	2	6	10495	10500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016627	ATAA	2	8	11278	11285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016627	GTA	2	6	11292	11297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016627	GTAAAG	2	12	11316	11327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016627	T	6	6	11377	11382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016627	ATT	2	6	11391	11396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016627	ATA	2	6	11402	11407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016627	TGAT	2	8	11468	11475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016627	TA	3	6	11476	11481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016627	TTA	2	6	11488	11493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016627	A	6	6	11512	11517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016627	A	7	7	11522	11528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016627	GTAT	2	8	12832	12839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016627	ATA	2	6	12845	12850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016627	A	7	7	12850	12856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016627	ATATA	2	10	12859	12868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016627	TTTA	2	8	12928	12935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016627	TTTATT	2	12	12979	12990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016627	TAT	2	6	12993	12998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016627	AATT	2	8	13002	13009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016627	AAT	2	6	13043	13048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016627	TA	3	6	13052	13057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016627	AT	3	6	13079	13084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016627	A	7	7	13121	13127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016627	TGC	2	6	13176	13181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016627	TAT	2	6	13189	13194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016627	TTG	2	6	13195	13200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016627	GA	3	6	13213	13218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016627	CT	3	6	13291	13296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016627	TGT	2	6	13304	13309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016627	TAA	2	6	13318	13323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016627	CCT	2	6	13418	13423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016627	A	6	6	13434	13439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016627	T	7	7	13469	13475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016627	AATT	2	8	13501	13508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016627	TAA	2	6	13510	13515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016627	ATA	2	6	13530	13535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016627	TA	3	6	14952	14957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016627	TTACC	2	10	14961	14970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_016627	TCTTAA	2	12	14974	14985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016627	AT	3	6	15053	15058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016627	AAT	2	6	15059	15064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016627	AAT	2	6	15075	15080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016627	TA	3	6	15107	15112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016627	TAATT	2	10	15139	15148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016627	T	6	6	15150	15155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016627	TA	4	8	15173	15180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016627	CTT	2	6	15197	15202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016627	AAT	2	6	15209	15214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016627	ATTA	2	8	15249	15256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016627	A	6	6	15260	15265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016627	AATT	2	8	15291	15298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016627	TCC	2	6	16805	16810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016627	T	6	6	21422	21427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016627	ATTA	2	8	21445	21452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016627	A	7	7	21479	21485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016627	CAT	2	6	21548	21553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016627	AT	3	6	21584	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016627	TAT	2	6	21602	21607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016627	A	7	7	21643	21649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016627	A	6	6	21655	21660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016627	A	8	8	21686	21693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016627	ATTG	2	8	21740	21747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016627	AT	3	6	21756	21761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016627	ATC	2	6	21829	21834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016627	AAT	2	6	21870	21875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016627	AT	3	6	22423	22428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016627	AT	3	6	22461	22466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016627	AGC	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016627	T	6	6	22478	22483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016627	ACA	2	6	22488	22493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_016627	TTA	2	6	23117	23122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_016627	TAA	2	6	23143	23148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016627	AATT	2	8	23204	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_016627	AT	4	8	39185	39192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_016627	GATT	2	8	39213	39220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_016627	TAA	2	6	39249	39254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_016627	TA	3	6	78907	78912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_016627	A	7	7	78912	78918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016627	TA	3	6	78919	78924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_016627	A	7	7	78924	78930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_016627	TTA	2	6	83139	83144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_016627	T	6	6	83997	84002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_016627	ATT	2	6	84008	84013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_016627	A	6	6	85261	85266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_016627	TA	4	8	85281	85288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_016627	A	6	6	85294	85299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_016627	AAT	4	12	85304	85315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_016627	TAAA	2	8	85387	85394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_016627	GA	3	6	85502	85507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_016627	CCT	2	6	89517	89522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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485	NC_016627	CAA	2	6	89949	89954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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490	NC_016627	TA	3	6	90067	90072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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