MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 26566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016627	AAG	2	6	2653529	2653534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_016627	ATC	2	6	2653546	2653551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_016627	T	7	7	2653562	2653568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_016627	TCC	2	6	2653572	2653577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_016627	CCT	2	6	2655597	2655602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_016627	T	7	7	2655614	2655620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_016627	AAG	2	6	2655664	2655669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_016627	TCT	3	9	2655683	2655691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_016627	A	6	6	2655763	2655768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_016627	A	8	8	2655772	2655779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_016627	A	6	6	2655795	2655800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_016627	CCA	2	6	2655864	2655869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_016627	GCCT	2	8	2655919	2655926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_016627	A	6	6	2655971	2655976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_016627	T	6	6	2655978	2655983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_016627	TAC	2	6	2655997	2656002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_016627	ATAAA	2	10	2656019	2656028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_016627	T	7	7	2656835	2656841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_016627	TA	3	6	2658334	2658339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_016627	TTTC	2	8	2658390	2658397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14021	NC_016627	TAATT	2	10	2658409	2658418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_016627	T	6	6	2659025	2659030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_016627	TGA	2	6	2659068	2659073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_016627	CAAA	2	8	2659152	2659159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14025	NC_016627	CTTA	2	8	2659193	2659200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14026	NC_016627	GTA	2	6	2659202	2659207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_016627	CTA	2	6	2659278	2659283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_016627	ACC	2	6	2659284	2659289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14029	NC_016627	ACC	2	6	2660073	2660078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_016627	ATC	2	6	2660085	2660090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_016627	ATGAA	2	10	2660092	2660101	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_016627	GCT	2	6	2660123	2660128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_016627	CAG	4	12	2660144	2660155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_016627	AT	3	6	2660195	2660200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_016627	AT	3	6	2660215	2660220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_016627	TCC	2	6	2660235	2660240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14037	NC_016627	ATT	2	6	2660259	2660264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_016627	TA	3	6	2660277	2660282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_016627	TGCT	2	8	2660290	2660297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14040	NC_016627	A	7	7	2660310	2660316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_016627	TA	3	6	2660324	2660329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_016627	T	7	7	2660348	2660354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_016627	T	6	6	2661731	2661736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_016627	TAATT	2	10	2661772	2661781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_016627	TAC	2	6	2661813	2661818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14047	NC_016627	GGT	2	6	2661857	2661862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_016627	TTA	2	6	2661973	2661978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_016627	CCTTT	2	10	2662447	2662456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14050	NC_016627	TTA	2	6	2662459	2662464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_016627	TAG	2	6	2662465	2662470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_016627	AAC	2	6	2662475	2662480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_016627	TAT	2	6	2662483	2662488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_016627	T	7	7	2662502	2662508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_016627	T	6	6	2662544	2662549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_016627	AAT	2	6	2662586	2662591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_016627	AGA	2	6	2662596	2662601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_016627	TTTGG	2	10	2662652	2662661	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_016627	A	6	6	2662675	2662680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_016627	AAG	2	6	2662686	2662691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_016627	ATT	2	6	2662705	2662710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_016627	TG	3	6	2662713	2662718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_016627	AAT	2	6	2662761	2662766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_016627	A	7	7	2662811	2662817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_016627	A	6	6	2662819	2662824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_016627	TAT	2	6	2663141	2663146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_016627	TTTA	2	8	2663182	2663189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_016627	AGTA	2	8	2663193	2663200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_016627	TCT	2	6	2663313	2663318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_016627	GAA	2	6	2663379	2663384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_016627	GTT	2	6	2663387	2663392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_016627	GAT	2	6	2663409	2663414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14074	NC_016627	TTG	2	6	2663500	2663505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14077	NC_016627	GAA	2	6	2663615	2663620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_016627	TA	3	6	2663717	2663722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_016627	TGA	2	6	2663743	2663748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_016627	TTTGT	2	10	2663998	2664007	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_016627	TA	3	6	2664012	2664017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_016627	AGA	2	6	2664473	2664478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_016627	T	6	6	2664620	2664625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_016627	TGT	2	6	2664641	2664646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_016627	CTA	2	6	2664675	2664680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_016627	TTC	2	6	2664723	2664728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_016627	TA	3	6	2664772	2664777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_016627	TTA	2	6	2664843	2664848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14092	NC_016627	AT	4	8	2665127	2665134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_016627	TCT	2	6	2665239	2665244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_016627	TC	3	6	2665320	2665325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14095	NC_016627	T	6	6	2665397	2665402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_016627	ATTC	2	8	2665439	2665446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14097	NC_016627	CTT	2	6	2665448	2665453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_016627	AAT	2	6	2665512	2665517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_016627	ACCTT	2	10	2665533	2665542	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14100	NC_016627	AT	4	8	2665546	2665553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_016627	ACT	2	6	2665572	2665577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_016627	CTG	2	6	2665582	2665587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_016627	TGC	3	9	2665592	2665600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_016627	GCT	2	6	2665602	2665607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14106	NC_016627	TGC	2	6	2665628	2665633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_016627	TC	3	6	2665680	2665685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_016627	TTA	2	6	2665692	2665697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_016627	TCC	2	6	2665751	2665756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_016627	ATC	2	6	2665799	2665804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_016627	GTAT	2	8	2665829	2665836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_016627	AAAT	2	8	2665888	2665895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_016627	ATA	2	6	2665913	2665918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_016627	TAA	2	6	2665932	2665937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_016627	TCA	2	6	2665950	2665955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_016627	ATA	2	6	2666005	2666010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_016627	AT	3	6	2666020	2666025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_016627	ACA	2	6	2666073	2666078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_016627	ATA	2	6	2666099	2666104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_016627	CTT	2	6	2666181	2666186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_016627	GTA	2	6	2666213	2666218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_016627	T	6	6	2666245	2666250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_016627	CAT	2	6	2666269	2666274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_016627	TTA	2	6	2666353	2666358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_016627	AGT	2	6	2666420	2666425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_016627	CAT	2	6	2666506	2666511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_016627	GTT	3	9	2666568	2666576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_016627	TCC	2	6	2666579	2666584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14129	NC_016627	ACT	2	6	2666592	2666597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_016627	TCA	2	6	2666676	2666681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14131	NC_016627	TACTCA	2	12	2666682	2666693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_016627	TTGA	2	8	2666717	2666724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_016627	T	6	6	2666730	2666735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_016627	ATT	2	6	2666778	2666783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14136	NC_016627	ATTAT	2	10	2666849	2666858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14139	NC_016627	T	6	6	2666883	2666888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14148	NC_016627	T	6	6	2669968	2669973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14157	NC_016627	T	6	6	2672923	2672928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14161	NC_016627	TTCT	2	8	2673242	2673249	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14164	NC_016627	CACT	2	8	2673768	2673775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14165	NC_016627	TAAA	2	8	2673795	2673802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14245	NC_016627	TTG	2	6	2676967	2676972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14259	NC_016627	CAT	2	6	2677360	2677365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14260	NC_016627	TTA	2	6	2677369	2677374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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