MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyclobacterium marinum DSM 745 chromosome

Total Repeats: 19607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015914	ATTA	2	8	6192016	6192023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19502	NC_015914	T	6	6	6192036	6192041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19503	NC_015914	TAA	2	6	6192062	6192067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19504	NC_015914	CAT	2	6	6192075	6192080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19505	NC_015914	TTAG	2	8	6193255	6193262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_015914	T	6	6	6195254	6195259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_015914	TAAA	2	8	6195277	6195284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19508	NC_015914	A	7	7	6195324	6195330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19509	NC_015914	T	6	6	6195389	6195394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19510	NC_015914	TTAT	2	8	6195406	6195413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_015914	TAA	2	6	6196767	6196772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19512	NC_015914	GCTG	2	8	6196862	6196869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19513	NC_015914	CATTGG	2	12	6197001	6197012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19514	NC_015914	AACC	2	8	6197017	6197024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19515	NC_015914	A	7	7	6197056	6197062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_015914	CA	3	6	6197159	6197164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19517	NC_015914	T	9	9	6197171	6197179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_015914	AAT	2	6	6197269	6197274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_015914	A	7	7	6197292	6197298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_015914	ACC	2	6	6197315	6197320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19521	NC_015914	T	6	6	6198868	6198873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19522	NC_015914	T	6	6	6202206	6202211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19523	NC_015914	TAT	2	6	6202271	6202276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19524	NC_015914	TTAT	2	8	6202278	6202285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19525	NC_015914	AT	3	6	6202287	6202292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_015914	CAT	2	6	6203391	6203396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19527	NC_015914	T	6	6	6203396	6203401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_015914	A	8	8	6203405	6203412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_015914	AATT	2	8	6203416	6203423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_015914	TAG	2	6	6203463	6203468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_015914	A	8	8	6203471	6203478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19532	NC_015914	TAA	2	6	6204107	6204112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19533	NC_015914	TCT	2	6	6204113	6204118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19534	NC_015914	ATT	2	6	6204120	6204125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_015914	A	8	8	6204148	6204155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_015914	A	6	6	6204198	6204203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_015914	AAAG	2	8	6204228	6204235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_015914	A	6	6	6205052	6205057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_015914	T	9	9	6205098	6205106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_015914	TAA	2	6	6205130	6205135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_015914	AGT	2	6	6205149	6205154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_015914	A	6	6	6205163	6205168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_015914	TTG	2	6	6205202	6205207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_015914	AAT	2	6	6205273	6205278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_015914	AGT	2	6	6205796	6205801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_015914	TA	3	6	6205820	6205825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19547	NC_015914	T	8	8	6205834	6205841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19548	NC_015914	A	8	8	6205905	6205912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19549	NC_015914	T	7	7	6205935	6205941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19550	NC_015914	ACA	2	6	6205999	6206004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19551	NC_015914	AAT	2	6	6207477	6207482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19552	NC_015914	T	6	6	6207615	6207620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19553	NC_015914	A	6	6	6207719	6207724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_015914	ATTT	2	8	6207766	6207773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19555	NC_015914	CCT	2	6	6207830	6207835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19556	NC_015914	CAC	2	6	6207839	6207844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19557	NC_015914	TGC	2	6	6207885	6207890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19558	NC_015914	TAA	2	6	6207908	6207913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19559	NC_015914	AT	3	6	6207921	6207926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19560	NC_015914	ATTA	2	8	6207928	6207935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19561	NC_015914	TAA	2	6	6207936	6207941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_015914	TAAAAA	2	12	6207952	6207963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19563	NC_015914	A	7	7	6207959	6207965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19564	NC_015914	A	8	8	6207987	6207994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19565	NC_015914	ATA	2	6	6208005	6208010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_015914	CAA	2	6	6208025	6208030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19567	NC_015914	ATT	2	6	6208117	6208122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19568	NC_015914	T	6	6	6208129	6208134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19569	NC_015914	ATT	2	6	6208150	6208155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19570	NC_015914	ATT	2	6	6208250	6208255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19573	NC_015914	ATT	2	6	6209150	6209155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19574	NC_015914	ATT	3	9	6209159	6209167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_015914	TGTA	2	8	6210449	6210456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19576	NC_015914	T	7	7	6210472	6210478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19583	NC_015914	TAG	2	6	6214216	6214221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19585	NC_015914	TAA	2	6	6214353	6214358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19587	NC_015914	ATT	2	6	6215386	6215391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19588	NC_015914	T	7	7	6215401	6215407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19589	NC_015914	TAAAA	2	10	6215430	6215439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19590	NC_015914	AAAT	2	8	6215447	6215454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19593	NC_015914	ATT	2	6	6217504	6217509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19594	NC_015914	GATT	2	8	6217578	6217585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19595	NC_015914	ACA	2	6	6217594	6217599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19597	NC_015914	TCA	2	6	6217652	6217657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19598	NC_015914	TAG	2	6	6218227	6218232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19599	NC_015914	CCAAG	2	10	6218244	6218253	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19600	NC_015914	ATTT	2	8	6218361	6218368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19602	NC_015914	AATA	2	8	6218945	6218952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19604	NC_015914	ATT	2	6	6221156	6221161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_015914	AAT	2	6	6221197	6221202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19606	NC_015914	A	7	7	6221246	6221252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19607	NC_015914	T	6	6	6221268	6221273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.