MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 2621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015744	ACC	2	6	552483	552488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_015744	A	6	6	552514	552519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015744	ACT	2	6	552578	552583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_015744	TGT	2	6	556383	556388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015744	TC	3	6	556403	556408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_015744	AG	3	6	556429	556434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015744	CAT	2	6	556498	556503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_015744	T	8	8	556505	556512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015744	A	6	6	559601	559606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015744	AC	3	6	561352	561357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_015744	TCT	2	6	561438	561443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015744	AAAT	2	8	561502	561509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015744	AAGA	2	8	561521	561528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015744	T	6	6	561581	561586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015744	AAG	2	6	564112	564117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015744	TTTC	2	8	564122	564129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_015744	TAAA	2	8	564956	564963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015744	ATA	2	6	564978	564983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015744	TTA	2	6	564999	565004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015744	T	6	6	565956	565961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015744	TACAA	2	10	565985	565994	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_015744	ATA	2	6	566017	566022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015744	GA	3	6	568438	568443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015744	ACT	2	6	568498	568503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_015744	TG	3	6	568548	568553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015744	AATA	2	8	568615	568622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015744	T	6	6	568638	568643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015744	T	7	7	568657	568663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015744	A	6	6	568665	568670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015744	TTG	2	6	568842	568847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015744	CTC	2	6	569259	569264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_015744	CAA	2	6	569303	569308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015744	AG	3	6	569348	569353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015744	A	8	8	569354	569361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015744	AAG	2	6	569372	569377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015744	TCC	2	6	570206	570211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_015744	GA	3	6	570227	570232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015744	T	7	7	570248	570254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015744	A	6	6	570264	570269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015744	GCAG	2	8	570277	570284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_015744	AG	3	6	570352	570357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015744	TAT	2	6	570375	570380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015744	ACA	2	6	570416	570421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015744	A	6	6	570465	570470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015744	AAC	2	6	571541	571546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_015744	A	6	6	571555	571560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015744	TAA	2	6	571606	571611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015744	A	6	6	572126	572131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015744	TA	3	6	572173	572178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015744	CCAA	2	8	572208	572215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_015744	A	7	7	572232	572238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015744	A	7	7	572673	572679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015744	ATA	2	6	572687	572692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015744	CCT	2	6	572742	572747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_015744	AAAC	2	8	572816	572823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_015744	TTTTTA	2	12	573538	573549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015744	GAG	2	6	573665	573670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015744	ATA	2	6	574378	574383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015744	AAT	2	6	574402	574407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015744	AG	3	6	574464	574469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015744	A	8	8	574482	574489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015744	TC	3	6	574490	574495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_015744	TTG	2	6	575867	575872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015744	TTG	2	6	575928	575933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015744	ACT	2	6	575959	575964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_015744	TCT	2	6	577512	577517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015744	GTC	2	6	577907	577912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015744	CAG	2	6	577916	577921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_015744	TAG	2	6	581375	581380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015744	TTG	2	6	581852	581857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015744	TTTCA	2	10	582114	582123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1572	NC_015744	A	8	8	582208	582215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015744	TAAA	2	8	582224	582231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015744	CTA	2	6	582314	582319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_015744	TA	3	6	582331	582336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015744	AG	3	6	582411	582416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015744	A	6	6	582429	582434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_015744	CA	3	6	584138	584143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_015744	CAAA	2	8	585159	585166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_015744	A	6	6	585170	585175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015744	A	7	7	585907	585913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015744	AGT	2	6	586118	586123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015744	GAG	2	6	589233	589238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015744	CA	3	6	591386	591391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_015744	T	7	7	591418	591424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015744	CAA	2	6	591438	591443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015744	T	9	9	591554	591562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015744	CAG	2	6	591582	591587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_015744	TA	3	6	591588	591593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015744	ATTT	2	8	591669	591676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015744	CTT	2	6	595036	595041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_015744	GTTT	2	8	597511	597518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015744	ATATTA	2	12	597534	597545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015744	AAAG	2	8	597546	597553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015744	A	6	6	597601	597606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015744	T	6	6	597625	597630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015744	AGG	2	6	597636	597641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015744	AGG	2	6	598019	598024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015744	TGCC	2	8	598034	598041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_015744	A	6	6	599464	599469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015744	TAC	2	6	599473	599478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015744	GGGA	2	8	601882	601889	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015744	A	7	7	601928	601934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015744	C	6	6	602089	602094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1605	NC_015744	AT	4	8	602148	602155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015744	CT	3	6	603000	603005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_015744	TAAA	2	8	603024	603031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015744	A	6	6	603029	603034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015744	T	6	6	603049	603054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015744	A	6	6	603069	603074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015744	TC	4	8	603091	603098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_015744	T	6	6	603219	603224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015744	TTG	2	6	603918	603923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015744	T	6	6	603950	603955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015744	GATA	2	8	604685	604692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015744	A	6	6	604699	604704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015744	GCT	2	6	604748	604753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_015744	TC	3	6	604782	604787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_015744	TC	3	6	604839	604844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_015744	A	7	7	605267	605273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015744	GTG	2	6	605277	605282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015744	TAA	2	6	605290	605295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015744	A	7	7	605294	605300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015744	CT	3	6	605312	605317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_015744	TTC	2	6	605376	605381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_015744	T	6	6	605387	605392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015744	AAT	2	6	605405	605410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015744	TAA	2	6	610058	610063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015744	CTT	2	6	615550	615555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_015744	A	6	6	615558	615563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015744	ACAA	2	8	615577	615584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_015744	AAC	2	6	615593	615598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_015744	TAA	2	6	616854	616859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015744	A	6	6	616876	616881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015744	GCTT	2	8	616907	616914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_015744	AAAGC	2	10	616940	616949	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1637	NC_015744	GAA	2	6	616960	616965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_015744	TTG	2	6	617277	617282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_015744	CCT	2	6	617283	617288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1641	NC_015744	T	7	7	617367	617373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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