MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 7796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	TCC	2	6	8	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015737	CTTG	2	8	28	35	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015737	ACC	2	6	160	165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015737	T	6	6	188	193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015737	T	7	7	206	212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015737	GCA	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015737	TCACC	2	10	4577	4586	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_015737	ATT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015737	ATT	2	6	4664	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015737	A	6	6	4705	4710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015737	GCC	2	6	5456	5461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015737	TCT	2	6	6470	6475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015737	CAG	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015737	TCT	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015737	CCT	2	6	9467	9472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015737	CT	3	6	9810	9815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015737	TCT	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015737	TAC	2	6	9872	9877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015737	A	6	6	9950	9955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015737	CTG	3	9	10688	10696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015737	AACC	2	8	13874	13881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015737	TCC	2	6	15208	15213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015737	GCAG	2	8	15860	15867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015737	CCTG	2	8	15868	15875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015737	CCG	2	6	15876	15881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015737	TCC	2	6	18389	18394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015737	TTG	2	6	18396	18401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015737	CCT	2	6	18754	18759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015737	A	6	6	18779	18784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015737	A	7	7	18814	18820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015737	ATC	2	6	18902	18907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015737	CCA	2	6	18950	18955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015737	AAC	2	6	18961	18966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015737	CAG	2	6	18975	18980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015737	T	6	6	18981	18986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015737	GCT	2	6	19028	19033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015737	A	6	6	19043	19048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015737	TCC	2	6	20838	20843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015737	TTC	2	6	20848	20853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015737	GCT	2	6	20890	20895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015737	T	6	6	20918	20923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015737	A	6	6	20937	20942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015737	T	6	6	20964	20969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015737	GAAA	2	8	20975	20982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015737	CCT	2	6	22661	22666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015737	TGT	2	6	22720	22725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015737	GGC	2	6	22742	22747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015737	TAA	2	6	22826	22831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015737	GCA	2	6	22854	22859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015737	CTG	2	6	22896	22901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015737	TA	4	8	23635	23642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015737	AGAT	2	8	23645	23652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015737	CGG	2	6	23657	23662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015737	GCC	2	6	23686	23691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015737	ATA	2	6	23705	23710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015737	CTG	2	6	24356	24361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015737	TCC	2	6	24982	24987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015737	CCT	2	6	27862	27867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015737	GCC	2	6	27907	27912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015737	TAT	2	6	27963	27968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015737	ATT	2	6	27994	27999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015737	A	6	6	28001	28006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015737	AACA	2	8	28056	28063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015737	T	6	6	28068	28073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015737	CTC	2	6	29117	29122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015737	ATCA	2	8	29140	29147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015737	TTC	2	6	29182	29187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015737	AAT	2	6	29210	29215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015737	TAG	2	6	29260	29265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015737	AATT	2	8	29276	29283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015737	T	6	6	29696	29701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015737	A	7	7	29710	29716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015737	GCT	2	6	29798	29803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015737	TGT	2	6	29834	29839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015737	TTC	2	6	29841	29846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015737	ACA	2	6	29868	29873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015737	CAAA	2	8	29900	29907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015737	A	7	7	29905	29911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015737	CAG	2	6	29934	29939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015737	AAT	2	6	29945	29950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015737	ATTTTA	2	12	29966	29977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015737	AGA	2	6	29982	29987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015737	GAT	2	6	30023	30028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015737	ATC	2	6	30056	30061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015737	CAA	2	6	30074	30079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015737	TGC	2	6	30083	30088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015737	TGC	2	6	30125	30130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015737	TAAAT	2	10	30182	30191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015737	ATT	2	6	30229	30234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015737	CAC	2	6	30238	30243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015737	TCTT	2	8	30267	30274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015737	CCT	2	6	32040	32045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015737	T	6	6	32045	32050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015737	ACG	2	6	32063	32068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015737	CTTCCT	2	12	32090	32101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015737	CTT	2	6	32133	32138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015737	GAAA	2	8	32180	32187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015737	AGC	2	6	32189	32194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015737	AAC	2	6	32200	32205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015737	AACG	2	8	33328	33335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015737	AT	3	6	33344	33349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015737	A	6	6	33413	33418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015737	ATT	2	6	33453	33458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015737	A	7	7	33494	33500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015737	ATT	2	6	33532	33537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015737	A	6	6	33547	33552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015737	CCGT	2	8	33609	33616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015737	TCC	2	6	34641	34646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015737	TCC	2	6	35467	35472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015737	T	7	7	35526	35532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015737	AAC	2	6	35575	35580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015737	ATA	2	6	35606	35611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015737	A	7	7	35670	35676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015737	TGG	2	6	35704	35709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015737	TCT	2	6	35725	35730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015737	T	6	6	35733	35738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015737	TGTTC	2	10	36313	36322	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015737	CCT	2	6	37780	37785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015737	TGC	2	6	37786	37791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015737	TCCT	2	8	38902	38909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015737	T	7	7	39613	39619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015737	ATT	2	6	39642	39647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015737	A	6	6	39663	39668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015737	CTTT	2	8	39880	39887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015737	T	7	7	39967	39973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015737	CTT	2	6	41117	41122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015737	TCT	2	6	42275	42280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015737	TCC	2	6	43900	43905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015737	CCGC	2	8	43924	43931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_015737	ATT	2	6	44020	44025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015737	T	7	7	44123	44129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015737	TCC	2	6	46625	46630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015737	CCG	2	6	46660	46665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015737	TCTG	2	8	46730	46737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015737	TTC	2	6	47540	47545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015737	TGTC	2	8	47552	47559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015737	TTC	2	6	47578	47583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015737	AG	3	6	47621	47626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015737	CATT	2	8	47666	47673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015737	ATTCTT	2	12	47680	47691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_015737	AAG	2	6	47692	47697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015737	T	7	7	48651	48657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015737	AT	3	6	48716	48721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015737	T	7	7	48763	48769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015737	CCG	2	6	48778	48783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_015737	T	6	6	48796	48801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015737	GTT	2	6	48851	48856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015737	AGG	2	6	48903	48908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015737	CCG	2	6	51083	51088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_015737	GGC	2	6	51096	51101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015737	CTGTT	2	10	51102	51111	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015737	CCGTC	2	10	51113	51122	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
155	NC_015737	CCG	2	6	51134	51139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_015737	CTT	2	6	53668	53673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_015737	T	8	8	88807	88814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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