MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015736	TGC	2	6	68358	68363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015736	GCT	2	6	68364	68369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015736	GCA	2	6	68405	68410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015736	TTG	2	6	68411	68416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015736	TAC	2	6	68433	68438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015736	ACTGG	2	10	68487	68496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
507	NC_015736	AGC	2	6	68651	68656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015736	TAAG	2	8	68669	68676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015736	CT	3	6	68722	68727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015736	C	6	6	68735	68740	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
511	NC_015736	TAC	2	6	68742	68747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015736	CCG	2	6	68824	68829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_015736	TGC	2	6	68859	68864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015736	CTC	2	6	68868	68873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015736	GCTTA	2	10	68879	68888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
516	NC_015736	AAGC	2	8	68967	68974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_015736	GAAAG	2	10	69048	69057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015736	TGC	2	6	69194	69199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015736	CAC	2	6	69237	69242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_015736	GCG	2	6	69287	69292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015736	ACT	2	6	69323	69328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015736	GCA	2	6	69349	69354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015736	GGC	2	6	69423	69428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015736	CTG	2	6	69450	69455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015736	AAG	2	6	69552	69557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015736	GCT	2	6	69617	69622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015736	GCG	2	6	69715	69720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015736	TTA	2	6	69747	69752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015736	ATG	2	6	70801	70806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015736	C	6	6	70848	70853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
531	NC_015736	ATC	2	6	70968	70973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015736	AGC	2	6	70975	70980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015736	ATT	2	6	71008	71013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015736	TGGC	2	8	71045	71052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_015736	AGG	2	6	71090	71095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015736	GGCA	2	8	71125	71132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_015736	CTGG	2	8	71172	71179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_015736	CAC	2	6	72347	72352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_015736	TGC	2	6	72435	72440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015736	CTG	2	6	72467	72472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015736	CT	3	6	72523	72528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_015736	CGC	2	6	72602	72607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_015736	TGG	2	6	72661	72666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015736	GCAG	2	8	72697	72704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_015736	GCT	2	6	72743	72748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015736	TAG	2	6	72771	72776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015736	GCA	2	6	72784	72789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015736	CTG	2	6	72864	72869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015736	TTG	2	6	73170	73175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015736	AGG	2	6	73178	73183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015736	AC	3	6	73195	73200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015736	GC	3	6	73223	73228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_015736	GCG	2	6	73252	73257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015736	GCA	2	6	73304	73309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015736	AGC	3	9	73323	73331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015736	CTG	2	6	73340	73345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015736	CAG	2	6	73397	73402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015736	TAT	2	6	73414	73419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015736	TGC	2	6	73448	73453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015736	CCA	2	6	73456	73461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015736	CG	3	6	73496	73501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015736	TAGC	2	8	73555	73562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_015736	TGCA	2	8	74246	74253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_015736	GCAC	2	8	74298	74305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_015736	CG	3	6	74308	74313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_015736	TGT	2	6	74379	74384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015736	AGC	2	6	75259	75264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_015736	GCC	2	6	75288	75293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_015736	GCA	2	6	75398	75403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015736	GCA	2	6	75444	75449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015736	GTC	2	6	75504	75509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015736	TAG	2	6	76884	76889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015736	GCCAT	2	10	76926	76935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
574	NC_015736	CTG	2	6	76942	76947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015736	GCG	2	6	77065	77070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015736	ATT	2	6	77075	77080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015736	GCA	2	6	77203	77208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015736	CCA	2	6	77209	77214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_015736	AGG	2	6	77309	77314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015736	GCA	2	6	77381	77386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015736	AGG	2	6	77423	77428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015736	CG	3	6	77465	77470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_015736	AGC	2	6	77560	77565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015736	GTG	2	6	77597	77602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015736	CGG	2	6	77637	77642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015736	TG	3	6	77678	77683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015736	TGG	2	6	77775	77780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015736	GAC	2	6	77796	77801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015736	AGC	2	6	77887	77892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015736	AGCC	2	8	77962	77969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_015736	GC	3	6	78004	78009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_015736	AAG	2	6	78016	78021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015736	GCG	2	6	78033	78038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015736	GTG	2	6	78084	78089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015736	AACA	2	8	78123	78130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_015736	CG	3	6	78206	78211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_015736	AGCGA	2	10	78223	78232	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
598	NC_015736	GC	3	6	78317	78322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015736	CGG	2	6	78346	78351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015736	CTG	2	6	78389	78394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015736	CGC	2	6	78395	78400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015736	GA	3	6	78409	78414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015736	CATC	2	8	78475	78482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_015736	ACT	2	6	80302	80307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015736	GCT	2	6	80332	80337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015736	GTT	2	6	80432	80437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015736	GCT	2	6	80438	80443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015736	CAA	2	6	80465	80470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015736	GCC	2	6	80523	80528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015736	CGT	2	6	80567	80572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015736	ATGTA	2	10	80624	80633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015736	GTG	3	9	80655	80663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015736	GC	4	8	80684	80691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_015736	TTG	2	6	80694	80699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015736	TGG	2	6	80732	80737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015736	CAG	2	6	80769	80774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015736	TGGA	2	8	80837	80844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015736	GCG	2	6	80920	80925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015736	ACG	2	6	80996	81001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015736	CTG	2	6	82551	82556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015736	CTAC	2	8	82627	82634	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_015736	CGT	2	6	82699	82704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015736	CTGC	2	8	82869	82876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_015736	CGC	2	6	82892	82897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015736	TGC	2	6	82911	82916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015736	GC	3	6	82937	82942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_015736	GAC	2	6	82980	82985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015736	GC	3	6	83000	83005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_015736	AGC	2	6	83014	83019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015736	GCAG	2	8	83068	83075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_015736	GCA	2	6	83177	83182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015736	CTC	2	6	83207	83212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015736	ACA	2	6	83351	83356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015736	AGG	2	6	83373	83378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015736	ACA	2	6	83382	83387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015736	AC	3	6	83741	83746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_015736	ATG	2	6	83762	83767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015736	ATA	2	6	83802	83807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015736	GCAT	2	8	83828	83835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
640	NC_015736	GCA	2	6	83880	83885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_015736	CAG	2	6	83997	84002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_015736	GCC	2	6	84059	84064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_015736	ACC	2	6	84065	84070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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647	NC_015736	GGC	2	6	84226	84231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_015736	GCA	2	6	84260	84265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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652	NC_015736	CCG	2	6	84524	84529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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659	NC_015736	CGA	2	6	86264	86269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_015736	GC	3	6	86333	86338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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663	NC_015736	GC	3	6	86348	86353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
664	NC_015736	AGC	2	6	86395	86400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_015736	TGC	2	6	86724	86729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
677	NC_015736	GCA	2	6	86805	86810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_015736	CAG	2	6	86965	86970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
682	NC_015736	GCA	2	6	87053	87058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_015736	GCA	2	6	87071	87076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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725	NC_015736	AAGG	2	8	88899	88906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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763	NC_015736	CG	3	6	106371	106376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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766	NC_015736	GCA	2	6	107743	107748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_015736	ATA	2	6	123854	123859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_015736	GGAC	2	8	124093	124100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
773	NC_015736	AAG	2	6	124165	124170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
774	NC_015736	CCT	2	6	124184	124189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
775	NC_015736	TGT	2	6	124237	124242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
776	NC_015736	ATC	2	6	124331	124336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_015736	CAT	2	6	124388	124393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_015736	AC	3	6	124475	124480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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932	NC_015736	TGG	2	6	135429	135434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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951	NC_015736	GCT	2	6	137383	137388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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