MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 5509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015727	CCT	2	6	250906	250911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_015727	CT	3	6	250924	250929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_015727	GA	3	6	250962	250967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015727	CATC	2	8	251725	251732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_015727	GGA	2	6	251740	251745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015727	CTA	2	6	257672	257677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015727	GCC	2	6	257735	257740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_015727	GACT	2	8	257754	257761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_015727	TTAC	2	8	257773	257780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_015727	ACA	2	6	257800	257805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015727	CTT	2	6	257852	257857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015727	GGCCG	2	10	258592	258601	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_015727	ACC	2	6	258620	258625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015727	ACCGA	2	10	258705	258714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_015727	GAG	2	6	258743	258748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015727	ACT	2	6	258749	258754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015727	CGTT	2	8	258776	258783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_015727	CTGT	2	8	258788	258795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_015727	GCC	2	6	258803	258808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_015727	GCG	2	6	258831	258836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015727	CGA	2	6	258841	258846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015727	CCG	2	6	258869	258874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_015727	ACT	2	6	258914	258919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015727	G	6	6	258943	258948	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015727	TCG	2	6	258968	258973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015727	CGCC	2	8	259120	259127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1027	NC_015727	CGA	3	9	259142	259150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015727	GGCC	2	8	259180	259187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_015727	AGC	2	6	259203	259208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015727	CGCC	2	8	259231	259238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1031	NC_015727	GC	3	6	259312	259317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_015727	CA	3	6	259330	259335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_015727	TGAA	2	8	260704	260711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015727	GC	4	8	260743	260750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_015727	GCAGT	2	10	260761	260770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_015727	CGA	2	6	260803	260808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015727	CGT	2	6	260874	260879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_015727	CG	3	6	260917	260922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_015727	AGCA	2	8	260975	260982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_015727	CGC	2	6	260998	261003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_015727	GCC	2	6	261048	261053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015727	TGC	2	6	261119	261124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015727	GTGAG	2	10	263241	263250	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015727	CG	3	6	266362	266367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_015727	ATC	2	6	266424	266429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015727	AGC	3	9	270762	270770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015727	T	9	9	270771	270779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015727	CGA	2	6	271123	271128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015727	GCG	2	6	271377	271382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015727	TGTC	2	8	271670	271677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_015727	TGT	2	6	271681	271686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015727	CTG	2	6	271715	271720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015727	TGG	2	6	271721	271726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015727	TGTC	2	8	273461	273468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_015727	TG	4	8	273475	273482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015727	CGCT	2	8	273492	273499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_015727	TTG	2	6	274910	274915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015727	TGA	2	6	275020	275025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015727	TCG	2	6	275035	275040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015727	CT	3	6	275041	275046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_015727	GCA	2	6	275077	275082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015727	GCG	2	6	276053	276058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015727	GCG	2	6	276091	276096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015727	GCC	2	6	276145	276150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_015727	CTG	2	6	277250	277255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015727	TCT	2	6	277350	277355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015727	ATG	2	6	277436	277441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015727	GC	4	8	277466	277473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_015727	TGG	2	6	277486	277491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015727	GAT	2	6	277508	277513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015727	CTG	2	6	277555	277560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015727	GAT	2	6	279765	279770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015727	CGATGG	2	12	279821	279832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1074	NC_015727	CGAC	2	8	279849	279856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_015727	CCG	2	6	279861	279866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_015727	GCAC	2	8	279933	279940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_015727	TGG	2	6	280222	280227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015727	ACTG	2	8	280228	280235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_015727	GAT	2	6	280238	280243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015727	GCT	2	6	280276	280281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015727	ATTGC	2	10	280289	280298	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_015727	CTC	2	6	280368	280373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_015727	G	6	6	280375	280380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015727	TCG	2	6	280397	280402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015727	GC	4	8	280495	280502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_015727	TTGA	2	8	280608	280615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015727	GGC	2	6	280623	280628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_015727	GAT	2	6	281513	281518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015727	AATA	2	8	281522	281529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015727	TCC	2	6	281603	281608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_015727	GCC	2	6	281614	281619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015727	CCA	2	6	281629	281634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_015727	TGG	2	6	282703	282708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015727	GC	3	6	282736	282741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_015727	GCC	2	6	282766	282771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_015727	TGC	2	6	282772	282777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015727	CGT	2	6	282822	282827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015727	TGG	2	6	282912	282917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015727	CAGT	2	8	282949	282956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_015727	AAG	2	6	282965	282970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015727	GCC	2	6	284023	284028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_015727	CGA	2	6	284054	284059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015727	AGCTTG	2	12	284104	284115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1104	NC_015727	CCGG	2	8	284143	284150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_015727	AGC	2	6	284276	284281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015727	GGC	2	6	284286	284291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015727	CGG	2	6	284310	284315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015727	GTG	2	6	284543	284548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015727	GCA	2	6	284610	284615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015727	ACC	2	6	284924	284929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015727	CGC	2	6	285019	285024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_015727	CCAT	2	8	285037	285044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_015727	CGCC	2	8	285103	285110	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1114	NC_015727	GCCT	2	8	285194	285201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_015727	TGC	2	6	285293	285298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015727	GC	3	6	285315	285320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_015727	CGG	2	6	285573	285578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015727	GCC	2	6	285626	285631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015727	CG	4	8	285642	285649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015727	GCC	2	6	285660	285665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_015727	CTTC	2	8	285676	285683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_015727	GC	3	6	285697	285702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_015727	AGC	2	6	285705	285710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015727	AGT	2	6	286907	286912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015727	GGC	2	6	286936	286941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015727	CCTGTC	2	12	286956	286967	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_015727	GAA	2	6	288620	288625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015727	CGC	2	6	288816	288821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_015727	TGT	2	6	288909	288914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015727	ATGC	2	8	288935	288942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_015727	CTTGG	2	10	288963	288972	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_015727	GCG	3	9	288977	288985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015727	GGC	2	6	288988	288993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015727	GC	3	6	289017	289022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_015727	GAG	2	6	289133	289138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_015727	GCA	2	6	320227	320232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_015727	AGGC	2	8	320257	320264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1272	NC_015727	GGC	2	6	320313	320318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_015727	GAC	2	6	320364	320369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_015727	GGC	2	6	320401	320406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NC_015727	GGGC	2	8	320433	320440	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1276	NC_015727	TCG	2	6	320452	320457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1312	NC_015727	AGG	2	6	334758	334763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_015727	CGA	2	6	357727	357732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1404	NC_015727	GC	3	6	358042	358047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_015727	CCG	2	6	358082	358087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1442	NC_015727	TGG	2	6	361933	361938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_015727	GGCAG	2	10	361953	361962	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1444	NC_015727	TGTC	2	8	362076	362083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_015727	A	8	8	362122	362129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_015727	GATGGG	2	12	364856	364867	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_015727	G	6	6	365070	365075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_015727	TTG	2	6	365088	365093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_015727	AGGC	2	8	365135	365142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1454	NC_015727	CTA	2	6	365223	365228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_015727	CAG	2	6	365311	365316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1457	NC_015727	ATC	2	6	365346	365351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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