MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 9802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015726	GGT	2	6	1624056	1624061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015726	CGC	2	6	1624116	1624121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_015726	CG	3	6	1624149	1624154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_015726	CAA	2	6	1624177	1624182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_015726	GACA	2	8	1624190	1624197	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_015726	GTGC	2	8	1624690	1624697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_015726	CG	3	6	1626153	1626158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_015726	CG	3	6	1626183	1626188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_015726	CGG	2	6	1626195	1626200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_015726	TCC	2	6	1626233	1626238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_015726	GCC	2	6	1626269	1626274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015726	TGC	2	6	1626287	1626292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015726	GCC	2	6	1626332	1626337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_015726	GCA	2	6	1626445	1626450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015726	CGA	2	6	1626487	1626492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015726	GC	3	6	1626498	1626503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_015726	GGGGGA	2	12	1626527	1626538	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015726	GGC	2	6	1626539	1626544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_015726	GCC	2	6	1626547	1626552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015726	GCG	2	6	1626590	1626595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015726	CCAA	2	8	1626604	1626611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_015726	GCC	2	6	1626629	1626634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_015726	CGC	2	6	1626720	1626725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_015726	AGG	2	6	1630135	1630140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015726	TGGC	2	8	1630497	1630504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_015726	GCC	2	6	1635671	1635676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_015726	CTG	2	6	1635679	1635684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015726	CCG	2	6	1635685	1635690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_015726	GC	3	6	1641168	1641173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_015726	TCA	2	6	1641208	1641213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_015726	ATG	2	6	1641258	1641263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015726	GGCA	2	8	1641360	1641367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_015726	GGCGGG	2	12	1644282	1644293	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
4034	NC_015726	TGGC	2	8	1644363	1644370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_015726	GCC	2	6	1648950	1648955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_015726	TTG	2	6	1649027	1649032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015726	CAG	2	6	1649064	1649069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015726	TGC	2	6	1649178	1649183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015726	AGC	2	6	1649231	1649236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_015726	GCG	2	6	1649256	1649261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015726	CG	3	6	1649299	1649304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_015726	GTC	2	6	1649315	1649320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015726	AGC	3	9	1649358	1649366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_015726	ATC	2	6	1649685	1649690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_015726	GCT	2	6	1649695	1649700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015726	GCA	2	6	1649702	1649707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015726	GGC	2	6	1649730	1649735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015726	CG	3	6	1650333	1650338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_015726	TTGG	2	8	1651030	1651037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015726	AT	3	6	1651147	1651152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015726	GAC	2	6	1651190	1651195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015726	GCC	2	6	1653963	1653968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015726	CATC	2	8	1656067	1656074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_015726	CCG	2	6	1656176	1656181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_015726	TGCC	2	8	1656193	1656200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_015726	GCC	2	6	1656202	1656207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_015726	G	7	7	1656224	1656230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015726	CGC	2	6	1656680	1656685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_015726	CGG	2	6	1656728	1656733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015726	CTC	2	6	1656760	1656765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_015726	GCAG	2	8	1656835	1656842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_015726	CGA	2	6	1656887	1656892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_015726	TCC	2	6	1656923	1656928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_015726	GCAT	2	8	1656971	1656978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_015726	GATC	2	8	1658464	1658471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_015726	ATC	2	6	1661745	1661750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_015726	CTGG	2	8	1661754	1661761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_015726	TAC	2	6	1669069	1669074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015726	CAG	2	6	1669101	1669106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015726	TGCG	2	8	1669118	1669125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_015726	CTG	2	6	1669135	1669140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_015726	GCG	2	6	1669164	1669169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_015726	GGA	2	6	1669206	1669211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015726	CG	3	6	1669323	1669328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_015726	GCA	2	6	1669370	1669375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_015726	AGG	2	6	1669383	1669388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015726	CTGA	2	8	1670570	1670577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_015726	CGGT	2	8	1672082	1672089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_015726	TGGT	2	8	1673374	1673381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015726	GGA	2	6	1675503	1675508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015726	GGC	2	6	1675561	1675566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_015726	GC	3	6	1676490	1676495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_015726	GCG	2	6	1676715	1676720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015726	GC	3	6	1676788	1676793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_015726	GCC	2	6	1678274	1678279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_015726	AGG	2	6	1678293	1678298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015726	GCC	2	6	1679329	1679334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_015726	CAGA	2	8	1679353	1679360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_015726	CCGG	2	8	1685515	1685522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_015726	CGC	2	6	1685531	1685536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_015726	CGC	2	6	1685554	1685559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_015726	AGC	2	6	1686152	1686157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_015726	GCC	2	6	1687384	1687389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_015726	CCG	2	6	1687393	1687398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_015726	CGC	2	6	1687439	1687444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_015726	GCCGG	2	10	1687556	1687565	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4097	NC_015726	CCG	2	6	1687609	1687614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_015726	TGGCC	2	10	1687675	1687684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4099	NC_015726	CTTG	2	8	1687690	1687697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_015726	GGA	2	6	1687736	1687741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015726	CG	3	6	1688127	1688132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_015726	GGAT	2	8	1688223	1688230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015726	CGT	2	6	1688308	1688313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015726	GGGC	2	8	1688415	1688422	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_015726	CCT	2	6	1690734	1690739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_015726	GC	3	6	1690741	1690746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_015726	CG	3	6	1694804	1694809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_015726	GAA	2	6	1694876	1694881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015726	GCG	2	6	1696286	1696291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015726	G	6	6	1697235	1697240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015726	TGA	2	6	1697247	1697252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015726	TCA	2	6	1697260	1697265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015726	TGA	2	6	1697300	1697305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015726	GCC	2	6	1697328	1697333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_015726	TCT	2	6	1697334	1697339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015726	ACG	2	6	1699645	1699650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_015726	CGG	2	6	1699669	1699674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015726	CTG	2	6	1699683	1699688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015726	AGG	2	6	1699717	1699722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015726	GCAT	2	8	1702933	1702940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_015726	GAAG	2	8	1702956	1702963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015726	GGC	2	6	1703872	1703877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015726	GA	3	6	1704543	1704548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015726	TTC	2	6	1707393	1707398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_015726	TCT	2	6	1707426	1707431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_015726	TGGCGC	2	12	1707437	1707448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_015726	CGG	2	6	1707451	1707456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_015726	GC	3	6	1708709	1708714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_015726	GGC	2	6	1713369	1713374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_015726	CGGT	2	8	1713408	1713415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4393	NC_015726	AGG	2	6	1807843	1807848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_015726	GGC	2	6	1808725	1808730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_015726	GGC	2	6	1810130	1810135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_015726	AATA	2	8	1810194	1810201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_015726	GTA	2	6	1810202	1810207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4398	NC_015726	TGCG	2	8	1810218	1810225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4399	NC_015726	GCAG	2	8	1810247	1810254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4400	NC_015726	TCA	2	6	1810264	1810269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_015726	CGG	2	6	1810375	1810380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_015726	TGC	2	6	1810445	1810450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4403	NC_015726	GA	3	6	1810454	1810459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4404	NC_015726	GC	3	6	1810510	1810515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4405	NC_015726	TGA	2	6	1810520	1810525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_015726	CTTC	2	8	1811231	1811238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4407	NC_015726	GT	3	6	1811271	1811276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_015726	GTGA	2	8	1811329	1811336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_015726	AAAAT	2	10	1811393	1811402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_015726	CATT	2	8	1811405	1811412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4413	NC_015726	GGA	2	6	1815769	1815774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4415	NC_015726	GTC	2	6	1818274	1818279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4417	NC_015726	TGC	2	6	1820116	1820121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4418	NC_015726	AC	3	6	1820287	1820292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4419	NC_015726	CGT	2	6	1820319	1820324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4420	NC_015726	CGC	2	6	1820339	1820344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4421	NC_015726	GCG	2	6	1820441	1820446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4422	NC_015726	CGG	2	6	1820520	1820525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4423	NC_015726	GAC	2	6	1820544	1820549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4424	NC_015726	GTTG	2	8	1820605	1820612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4425	NC_015726	GACGTC	2	12	1820624	1820635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4426	NC_015726	AGG	2	6	1821687	1821692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4427	NC_015726	TCC	2	6	1821721	1821726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4428	NC_015726	CAT	2	6	1821832	1821837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4430	NC_015726	TATT	2	8	1821958	1821965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4431	NC_015726	GAC	2	6	1821973	1821978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4432	NC_015726	TCA	2	6	1821983	1821988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4433	NC_015726	TTC	2	6	1826327	1826332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4434	NC_015726	CGCC	2	8	1827040	1827047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4435	NC_015726	GGC	2	6	1827052	1827057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4436	NC_015726	C	7	7	1827064	1827070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4437	NC_015726	GCCTT	2	10	1827088	1827097	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4443	NC_015726	CTG	2	6	1829974	1829979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4446	NC_015726	C	6	6	1830136	1830141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4462	NC_015726	AAG	2	6	1846790	1846795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4467	NC_015726	GCA	2	6	1847803	1847808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4478	NC_015726	GC	3	6	1850611	1850616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4479	NC_015726	GC	3	6	1850634	1850639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4480	NC_015726	TTA	2	6	1850656	1850661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4482	NC_015726	CCA	2	6	1850738	1850743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4483	NC_015726	CGG	2	6	1850746	1850751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4491	NC_015726	CGG	2	6	1851460	1851465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4493	NC_015726	CCG	2	6	1851539	1851544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4494	NC_015726	ACA	2	6	1853586	1853591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4495	NC_015726	GAG	2	6	1856675	1856680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4500	NC_015726	GCT	2	6	1860844	1860849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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