MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 9802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015726	ACT	2	6	1207090	1207095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_015726	ATT	2	6	1207102	1207107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015726	CCCGC	2	10	1211351	1211360	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3004	NC_015726	CAC	2	6	1213467	1213472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_015726	GCG	2	6	1213485	1213490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015726	GCCC	2	8	1216449	1216456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3007	NC_015726	CGG	2	6	1217180	1217185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_015726	GAG	2	6	1217212	1217217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015726	GC	3	6	1217237	1217242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_015726	CCCG	2	8	1218997	1219004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3011	NC_015726	GC	3	6	1219009	1219014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_015726	CAA	2	6	1224142	1224147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015726	ATG	2	6	1226392	1226397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015726	CGA	2	6	1226418	1226423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_015726	GCTG	2	8	1226513	1226520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_015726	GAG	2	6	1226530	1226535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015726	TGT	2	6	1226544	1226549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015726	GCC	2	6	1227524	1227529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_015726	T	6	6	1227540	1227545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015726	GCT	2	6	1230429	1230434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015726	CG	4	8	1230574	1230581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_015726	GAAA	3	12	1230821	1230832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015726	GGC	2	6	1230837	1230842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015726	GCCT	2	8	1231695	1231702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_015726	TGC	2	6	1231705	1231710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015726	CCGCT	2	10	1231711	1231720	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3027	NC_015726	CGC	2	6	1231726	1231731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_015726	GGC	2	6	1231748	1231753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015726	CG	3	6	1231754	1231759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_015726	CGG	2	6	1231779	1231784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015726	GCCGC	2	10	1231852	1231861	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3032	NC_015726	CGG	3	9	1231879	1231887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015726	GCG	3	9	1231890	1231898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015726	TCC	2	6	1232780	1232785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_015726	CTG	2	6	1233013	1233018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015726	CG	3	6	1233023	1233028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_015726	TGCAG	2	10	1233119	1233128	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3038	NC_015726	CGCC	2	8	1233162	1233169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3039	NC_015726	GCG	2	6	1233175	1233180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_015726	TC	3	6	1234048	1234053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_015726	GGCC	2	8	1234056	1234063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_015726	GAC	2	6	1234066	1234071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_015726	GCG	2	6	1234072	1234077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_015726	ACA	2	6	1234116	1234121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015726	AGA	2	6	1234133	1234138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015726	CTG	2	6	1234158	1234163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_015726	GCA	2	6	1235084	1235089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_015726	GC	3	6	1235134	1235139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_015726	GTC	2	6	1235145	1235150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_015726	GCA	2	6	1235191	1235196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015726	CGC	2	6	1235198	1235203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_015726	GGCGC	2	10	1235335	1235344	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3053	NC_015726	ACACG	2	10	1235356	1235365	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3054	NC_015726	GCCGG	2	10	1236127	1236136	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3055	NC_015726	GGCA	2	8	1236997	1237004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_015726	GC	3	6	1238154	1238159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_015726	GGC	2	6	1238963	1238968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_015726	GCC	2	6	1239074	1239079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_015726	GGC	2	6	1239080	1239085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_015726	CTGC	2	8	1239122	1239129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_015726	CAC	2	6	1239155	1239160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_015726	AGAA	2	8	1241405	1241412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015726	TGT	2	6	1242542	1242547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015726	GGC	3	9	1242552	1242560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015726	GCG	2	6	1242567	1242572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_015726	CGC	2	6	1243913	1243918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_015726	AAG	2	6	1244019	1244024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015726	GCG	2	6	1245348	1245353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_015726	TG	3	6	1245375	1245380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015726	CA	3	6	1245388	1245393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_015726	GGC	2	6	1245504	1245509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_015726	GTTTT	2	10	1245538	1245547	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015726	T	6	6	1245544	1245549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015726	CTG	2	6	1245564	1245569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_015726	GCT	3	9	1245596	1245604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_015726	GCG	2	6	1245621	1245626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_015726	CGA	2	6	1245665	1245670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015726	C	6	6	1245806	1245811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3079	NC_015726	GC	4	8	1249401	1249408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_015726	CGGG	2	8	1250124	1250131	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_015726	GTC	2	6	1250133	1250138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015726	TGC	2	6	1250190	1250195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015726	ATGAA	2	10	1250219	1250228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015726	ATTTC	2	10	1250231	1250240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3085	NC_015726	GAA	2	6	1250264	1250269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015726	TCC	2	6	1250272	1250277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_015726	CTT	2	6	1250318	1250323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_015726	GCA	2	6	1250327	1250332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015726	TGGA	2	8	1250602	1250609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015726	TGC	2	6	1250665	1250670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015726	GCTG	2	8	1254238	1254245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_015726	GCAGGC	2	12	1254246	1254257	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015726	CCA	2	6	1254294	1254299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_015726	CAGA	2	8	1254307	1254314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_015726	TC	3	6	1254677	1254682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_015726	GGCT	2	8	1254731	1254738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_015726	CAT	2	6	1254747	1254752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_015726	TTC	2	6	1254796	1254801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015726	GCAG	2	8	1254834	1254841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_015726	CATTG	2	10	1254842	1254851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_015726	CTT	2	6	1254910	1254915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015726	CGG	2	6	1254925	1254930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015726	GGC	2	6	1254931	1254936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_015726	C	6	6	1254969	1254974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3105	NC_015726	AAG	2	6	1258162	1258167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015726	CCG	2	6	1258168	1258173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_015726	CG	3	6	1258172	1258177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_015726	TGT	2	6	1258179	1258184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015726	TGA	2	6	1258190	1258195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015726	CGG	2	6	1258217	1258222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_015726	TGC	2	6	1258241	1258246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015726	TGT	2	6	1259230	1259235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015726	CTC	2	6	1259236	1259241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_015726	GCG	2	6	1262951	1262956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_015726	CTG	2	6	1266192	1266197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015726	ACT	2	6	1266238	1266243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_015726	TA	3	6	1266260	1266265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015726	TTG	2	6	1266271	1266276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015726	TGT	2	6	1266317	1266322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015726	GCA	2	6	1267195	1267200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015726	GA	3	6	1267212	1267217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015726	ACA	2	6	1267230	1267235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015726	GATA	2	8	1268221	1268228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015726	GCGCC	2	10	1269054	1269063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3125	NC_015726	GCG	2	6	1269082	1269087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015726	CA	3	6	1269093	1269098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_015726	GAG	2	6	1272132	1272137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015726	TTGC	2	8	1273233	1273240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_015726	GCA	2	6	1273246	1273251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015726	GAG	2	6	1274104	1274109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015726	GGA	2	6	1275702	1275707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015726	TCC	2	6	1277006	1277011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_015726	GGC	2	6	1277082	1277087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_015726	TAC	2	6	1277211	1277216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_015726	TCC	2	6	1277285	1277290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_015726	GAG	2	6	1277341	1277346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_015726	GCC	2	6	1280072	1280077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3140	NC_015726	GCC	2	6	1280081	1280086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3142	NC_015726	GTT	2	6	1280174	1280179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3145	NC_015726	CCGA	2	8	1280293	1280300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3146	NC_015726	GCA	2	6	1280303	1280308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3149	NC_015726	CGGC	2	8	1280423	1280430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3153	NC_015726	GATCC	2	10	1288456	1288465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3154	NC_015726	A	8	8	1288531	1288538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_015726	TGCC	2	8	1288564	1288571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3158	NC_015726	TCCGG	2	10	1288723	1288732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3162	NC_015726	GGTCA	2	10	1288867	1288876	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3163	NC_015726	GCC	2	6	1288893	1288898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3166	NC_015726	AAC	2	6	1289270	1289275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3233	NC_015726	GGCCA	2	10	1295956	1295965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3246	NC_015726	GTG	2	6	1296350	1296355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_015726	CG	3	6	1296399	1296404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3248	NC_015726	CCT	2	6	1297274	1297279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3252	NC_015726	GGC	2	6	1298089	1298094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_015726	TGCC	2	8	1298185	1298192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_015726	CGGC	2	8	1298198	1298205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3255	NC_015726	CTG	2	6	1299103	1299108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_015726	GTC	2	6	1300303	1300308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_015726	GTG	2	6	1300378	1300383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_015726	CCT	2	6	1300392	1300397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_015726	TGCCG	2	10	1300425	1300434	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3260	NC_015726	GAT	2	6	1300439	1300444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_015726	A	7	7	1300496	1300502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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