MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015686	AGG	2	6	29	34	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015686	TA	3	6	822	827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015686	TTA	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015686	ATT	2	6	899	904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015686	A	7	7	921	927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015686	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015686	A	7	7	948	954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015686	ATT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015686	T	6	6	1004	1009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015686	A	6	6	1020	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015686	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015686	AAT	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015686	T	6	6	1061	1066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015686	TAT	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015686	TAA	2	6	1139	1144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015686	TAA	2	6	1162	1167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015686	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015686	A	6	6	1184	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015686	TTA	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015686	ACGA	2	8	1290	1297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015686	T	6	6	1308	1313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015686	TAAA	2	8	1332	1339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015686	TA	4	8	3977	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015686	TA	3	6	4012	4017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015686	TA	3	6	4040	4045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015686	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015686	GGA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015686	AAG	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015686	TTA	2	6	6722	6727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015686	AAT	2	6	6748	6753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015686	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015686	A	6	6	6783	6788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015686	TAA	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015686	A	6	6	6893	6898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015686	A	7	7	6900	6906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015686	T	7	7	6969	6975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015686	TG	3	6	7961	7966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015686	CTC	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015686	T	6	6	8001	8006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015686	TTA	2	6	8020	8025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015686	TA	4	8	8387	8394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015686	AATGT	2	10	8401	8410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015686	ATATTA	2	12	8413	8424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015686	AGGGTT	2	12	8445	8456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015686	AAT	2	6	8457	8462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015686	TAACCC	2	12	8469	8480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015686	CAT	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015686	AATA	2	8	9533	9540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015686	T	6	6	9569	9574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015686	TATTAA	2	12	9607	9618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015686	TCT	2	6	9711	9716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015686	AT	3	6	9800	9805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015686	TTCAT	2	10	9822	9831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015686	T	7	7	9858	9864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015686	T	6	6	9895	9900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015686	AGAA	2	8	9901	9908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015686	TGG	2	6	10003	10008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015686	T	6	6	12599	12604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015686	TG	3	6	12621	12626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015686	AT	3	6	12633	12638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015686	ATA	2	6	12648	12653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015686	GGA	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015686	A	6	6	12695	12700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015686	TAT	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015686	T	6	6	12815	12820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015686	T	6	6	12827	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015686	TGG	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015686	TTA	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015686	T	7	7	12901	12907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015686	AAG	2	6	13379	13384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015686	ACG	2	6	13410	13415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015686	CCT	2	6	14548	14553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015686	TA	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015686	TCC	2	6	15534	15539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015686	A	7	7	15578	15584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015686	TA	3	6	15623	15628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015686	TTAA	2	8	15655	15662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015686	TAA	2	6	15711	15716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015686	TAT	2	6	15752	15757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015686	ATTA	2	8	15762	15769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015686	ATA	2	6	15787	15792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015686	GAG	2	6	15806	15811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015686	T	7	7	17216	17222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015686	ATA	2	6	17264	17269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015686	TACAG	2	10	17284	17293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015686	ATG	2	6	17378	17383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015686	A	6	6	17453	17458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015686	A	7	7	17463	17469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015686	TAG	2	6	17470	17475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015686	CTA	2	6	17495	17500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015686	T	6	6	17501	17506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015686	ATT	2	6	17509	17514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015686	T	6	6	17582	17587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015686	TTATAT	2	12	17593	17604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015686	TAAAA	2	10	17616	17625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015686	T	6	6	17636	17641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015686	CTT	2	6	21862	21867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015686	A	6	6	22094	22099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015686	CCT	2	6	22100	22105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015686	ATA	2	6	22112	22117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015686	A	6	6	22129	22134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015686	TAT	2	6	22136	22141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015686	GTAG	2	8	22197	22204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015686	TTA	2	6	22205	22210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015686	CTGG	2	8	22261	22268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015686	TG	3	6	23383	23388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015686	TAT	2	6	23412	23417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015686	ATT	3	9	23435	23443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015686	TAT	2	6	23995	24000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015686	TA	3	6	24012	24017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015686	ATT	2	6	24052	24057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015686	T	6	6	24056	24061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015686	ATATT	2	10	24097	24106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015686	TTG	2	6	24109	24114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015686	ATT	2	6	24119	24124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015686	AT	3	6	24142	24147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015686	GTA	2	6	24152	24157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015686	TAAA	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015686	T	7	7	24203	24209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015686	TA	3	6	24221	24226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015686	T	6	6	24790	24795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015686	ATA	2	6	24904	24909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015686	ATCT	2	8	26699	26706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015686	TAT	2	6	26713	26718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015686	T	6	6	26720	26725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015686	TAG	2	6	26749	26754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015686	ATA	2	6	27389	27394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015686	AAG	2	6	27406	27411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015686	TATT	2	8	27418	27425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015686	A	6	6	27426	27431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015686	TAAA	2	8	27460	27467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015686	TAA	2	6	27478	27483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015686	GGA	2	6	27504	27509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015686	A	7	7	29366	29372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015686	T	7	7	29391	29397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015686	TA	3	6	29407	29412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015686	T	7	7	30030	30036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015686	AGAA	2	8	30093	30100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015686	ATT	2	6	31954	31959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015686	TA	3	6	31972	31977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015686	AGG	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015686	TA	3	6	32363	32368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015686	AGA	2	6	32369	32374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015686	GGA	2	6	32389	32394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015686	AAATA	2	10	32739	32748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015686	GGA	2	6	32771	32776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015686	T	6	6	33176	33181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015686	AT	3	6	33188	33193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015686	GTA	2	6	33268	33273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015686	TAT	2	6	33289	33294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015686	AGG	2	6	33303	33308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015686	TA	3	6	36300	36305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015686	TAT	2	6	36323	36328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015686	TAT	2	6	36370	36375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_015686	ATT	2	6	36423	36428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015686	ATT	2	6	36518	36523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_015686	GTA	2	6	62257	62262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_015686	TTG	2	6	62832	62837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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