MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	TA	3	6	30	35	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015427	ATA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015427	TCTT	2	8	459	466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015427	T	6	6	465	470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015427	TTA	2	6	477	482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015427	AT	3	6	491	496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015427	TAT	2	6	542	547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015427	TCC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015427	GTTA	2	8	588	595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015427	TA	3	6	597	602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015427	TCTAA	2	10	618	627	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015427	TA	3	6	628	633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015427	A	6	6	668	673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015427	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015427	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015427	AGG	2	6	819	824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015427	AAAAGA	2	12	854	865	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015427	A	7	7	898	904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015427	ATAA	2	8	1022	1029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015427	AC	3	6	1070	1075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015427	CTT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015427	TAG	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015427	TATT	2	8	1104	1111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015427	A	7	7	1153	1159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015427	ACA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015427	GAAG	2	8	1192	1199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015427	ATT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015427	A	7	7	1243	1249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015427	TAA	2	6	1250	1255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015427	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015427	TCC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015427	ATTA	2	8	2364	2371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015427	ATA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015427	GGT	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015427	TGT	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015427	TA	3	6	2443	2448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015427	A	7	7	3443	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015427	CCT	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015427	A	6	6	3503	3508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015427	TA	3	6	3518	3523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015427	TA	4	8	3531	3538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015427	TTAG	2	8	3551	3558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015427	A	6	6	3559	3564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015427	T	6	6	3633	3638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015427	TAATA	2	10	3695	3704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015427	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015427	TG	3	6	3734	3739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015427	T	7	7	3761	3767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015427	ATT	2	6	3803	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015427	ATA	2	6	3814	3819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015427	TA	3	6	3829	3834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015427	TA	3	6	3842	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015427	AT	4	8	3925	3932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015427	AT	3	6	3940	3945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015427	TTATA	2	10	3948	3957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015427	TTAC	2	8	5434	5441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015427	AT	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015427	TTA	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015427	TAA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015427	AAAT	2	8	5571	5578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015427	A	7	7	5610	5616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015427	AG	3	6	5661	5666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015427	GAAAGA	2	12	5673	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015427	TGGT	2	8	5691	5698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015427	A	6	6	5722	5727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015427	CAA	2	6	5785	5790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015427	AT	3	6	5799	5804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015427	TAG	3	9	6180	6188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015427	T	6	6	6366	6371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015427	TCT	2	6	6375	6380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015427	AT	3	6	6390	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015427	A	7	7	6431	6437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015427	ATTT	2	8	6469	6476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015427	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015427	ATT	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015427	TAT	2	6	6671	6676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015427	T	7	7	6692	6698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015427	ATT	2	6	6750	6755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015427	TCT	2	6	6877	6882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015427	TTA	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015427	GCA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015427	GCC	2	6	6963	6968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015427	CAAA	2	8	6970	6977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015427	TAT	2	6	6978	6983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015427	CCA	2	6	7008	7013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015427	T	6	6	7014	7019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015427	T	6	6	7037	7042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015427	TA	3	6	7088	7093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015427	TAT	2	6	7150	7155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015427	TA	3	6	7167	7172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015427	TA	3	6	7216	7221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015427	A	6	6	7221	7226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015427	TA	3	6	7241	7246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015427	TA	3	6	7265	7270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015427	ATTT	2	8	7275	7282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015427	T	6	6	7316	7321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015427	A	7	7	7381	7387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015427	A	6	6	7400	7405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015427	A	6	6	7427	7432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015427	A	7	7	7497	7503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015427	GTT	2	6	7551	7556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015427	A	6	6	7562	7567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015427	ATG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015427	TA	3	6	7704	7709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015427	ATT	2	6	7711	7716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015427	AT	3	6	7774	7779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015427	GATAA	2	10	7795	7804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015427	A	6	6	9005	9010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015427	AAAT	2	8	9018	9025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015427	A	6	6	9028	9033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015427	TAT	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015427	AAAT	2	8	9090	9097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015427	ATT	2	6	9121	9126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015427	T	7	7	9472	9478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015427	AGG	2	6	9489	9494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015427	GTT	2	6	9495	9500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015427	ATTTA	2	10	9814	9823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015427	CCT	2	6	10631	10636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015427	T	6	6	10636	10641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015427	TA	3	6	10656	10661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015427	CCA	2	6	10678	10683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015427	CCTC	2	8	11872	11879	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_015427	T	6	6	11884	11889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015427	ATAAA	2	10	11890	11899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015427	CAA	2	6	11904	11909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015427	T	6	6	12191	12196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015427	TAA	2	6	12218	12223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015427	T	6	6	13924	13929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015427	A	6	6	13930	13935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015427	A	7	7	13942	13948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015427	ATT	2	6	14523	14528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015427	ATT	2	6	14539	14544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015427	GCCA	2	8	14561	14568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015427	TTA	2	6	14608	14613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015427	T	7	7	14650	14656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015427	TAT	2	6	14660	14665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015427	A	6	6	16622	16627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015427	ATC	2	6	16651	16656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015427	TCA	2	6	16664	16669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015427	CTT	2	6	16688	16693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015427	GGAATA	2	12	16727	16738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015427	CCT	2	6	22113	22118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015427	TTC	2	6	22119	22124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015427	A	6	6	22131	22136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015427	TA	3	6	22319	22324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015427	CCT	2	6	22363	22368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_015427	T	6	6	22383	22388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015427	ATC	2	6	22394	22399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015427	TCC	2	6	22670	22675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_015427	T	6	6	23623	23628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015427	AAT	2	6	23670	23675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015427	ATT	2	6	24501	24506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015427	ATATCT	2	12	24507	24518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015427	TAA	2	6	24528	24533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015427	ATT	2	6	24552	24557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015427	AAT	2	6	24560	24565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015427	AAT	2	6	24593	24598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015427	T	6	6	24618	24623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015427	ATC	2	6	24638	24643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_015427	TTG	2	6	29935	29940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_015427	ACC	2	6	30072	30077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_015427	GAA	2	6	30129	30134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015427	ATA	2	6	30159	30164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_015427	GTT	2	6	30317	30322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015427	A	7	7	30972	30978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_015427	CTT	2	6	31708	31713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.