MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p5BKT015925

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015419	TTTA	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015419	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015419	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015419	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015419	AGG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015419	AAT	2	6	536	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015419	AAG	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015419	AGCAA	2	10	574	583	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015419	ATTAT	2	10	604	613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015419	CTA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015419	CATTT	2	10	646	655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015419	AT	3	6	703	708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015419	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015419	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015419	TAT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015419	ACA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015419	TGT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015419	TCT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015419	TTG	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015419	T	6	6	862	867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015419	TG	3	6	873	878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015419	CCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015419	AAT	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015419	TG	4	8	932	939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015419	AT	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015419	TCT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015419	CTTA	2	8	1017	1024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015419	TAAA	2	8	1054	1061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015419	CT	3	6	1074	1079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015419	TA	3	6	1097	1102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015419	TAAT	2	8	1136	1143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015419	ACAA	2	8	1208	1215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015419	TA	4	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015419	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015419	TA	3	6	2608	2613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015419	TA	3	6	2618	2623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015419	T	6	6	2663	2668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015419	ATTT	2	8	2691	2698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015419	A	6	6	2724	2729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015419	GTAT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015419	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015419	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015419	ATT	2	6	2838	2843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015419	ATA	3	9	2844	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015419	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015419	TAT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015419	ATACA	2	10	3365	3374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015419	GTT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015419	AAC	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015419	TACA	2	8	3416	3423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015419	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015419	T	6	6	4133	4138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015419	AT	3	6	4140	4145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015419	GAT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015419	TA	3	6	4188	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015419	ATA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015419	ATTT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015419	TA	3	6	4250	4255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015419	AT	3	6	4714	4719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015419	TA	3	6	4725	4730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015419	TA	3	6	4737	4742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015419	ATA	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015419	TA	3	6	4834	4839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015419	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015419	TAAC	2	8	4915	4922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015419	A	6	6	4975	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015419	TAG	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015419	TTTA	2	8	5136	5143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015419	CCA	2	6	5158	5163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015419	CTA	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015419	TA	3	6	5181	5186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015419	ATT	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015419	AT	3	6	5330	5335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015419	GTA	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015419	T	6	6	5388	5393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015419	TA	3	6	5472	5477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015419	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015419	TAC	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015419	TTCT	2	8	5586	5593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015419	TA	3	6	5634	5639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015419	TA	4	8	5655	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015419	T	9	9	5731	5739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015419	TTA	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015419	AAC	2	6	5791	5796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015419	AAAAT	2	10	5818	5827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015419	TTA	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015419	TA	3	6	5919	5924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015419	A	6	6	5937	5942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015419	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015419	ATTA	2	8	5988	5995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015419	TCTAT	2	10	6003	6012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015419	TAAT	2	8	6023	6030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015419	T	7	7	6178	6184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015419	ATTTTT	2	12	6197	6208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015419	T	6	6	6223	6228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015419	ATAAA	2	10	6231	6240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015419	ATT	2	6	6295	6300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015419	TTTAA	2	10	6400	6409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015419	TAT	2	6	6476	6481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015419	AT	3	6	6490	6495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015419	TAT	2	6	6503	6508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015419	CAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015419	ATA	3	9	7099	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015419	AAT	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015419	T	6	6	7133	7138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015419	TCC	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015419	AGT	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015419	TA	3	6	7184	7189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015419	TA	3	6	7203	7208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015419	TA	4	8	7210	7217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015419	TCA	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015419	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015419	AT	3	6	7235	7240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015419	ATATA	2	10	7246	7255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015419	ATT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015419	AGTA	2	8	7910	7917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015419	C	6	6	7918	7923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_015419	TGTA	2	8	7924	7931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015419	A	7	7	7942	7948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015419	TAT	2	6	7954	7959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015419	TA	3	6	7974	7979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015419	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015419	GAATA	2	10	8577	8586	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015419	GTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015419	TTG	2	6	8671	8676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015419	TAAT	2	8	8694	8701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015419	TTG	2	6	8705	8710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015419	TTTA	2	8	8731	8738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015419	T	6	6	8770	8775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015419	ATAA	2	8	8787	8794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015419	CTT	2	6	8809	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015419	A	7	7	9697	9703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015419	ATTAA	2	10	9712	9721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015419	A	7	7	10564	10570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015419	AT	3	6	10583	10588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015419	TAAC	2	8	10589	10596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015419	AT	3	6	10623	10628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015419	TATT	2	8	10631	10638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015419	CAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015419	T	8	8	10679	10686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015419	TTAA	2	8	10723	10730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015419	AT	3	6	10772	10777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015419	AAT	2	6	10779	10784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015419	TA	3	6	10820	10825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015419	T	6	6	10848	10853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015419	AGT	2	6	10929	10934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015419	AT	3	6	10988	10993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015419	TAAAAA	2	12	11011	11022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015419	ATTT	2	8	11033	11040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015419	AT	3	6	11163	11168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015419	TA	3	6	11191	11196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015419	TTAT	2	8	11202	11209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015419	TA	4	8	11213	11220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015419	A	6	6	11223	11228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015419	TTG	2	6	12370	12375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.