MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	GTT	2	6	43	48	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014657	TG	3	6	1499	1504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014657	TTA	2	6	1604	1609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014657	ATT	3	9	1624	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014657	TAC	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014657	AAG	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014657	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014657	A	6	6	1682	1687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014657	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014657	T	9	9	6663	6671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014657	GAGG	2	8	6672	6679	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014657	A	6	6	6682	6687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014657	GTG	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014657	GTT	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014657	C	6	6	10115	10120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_014657	TTA	2	6	10131	10136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014657	TAT	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014657	ATATA	2	10	10143	10152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014657	ATG	2	6	11278	11283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014657	AT	3	6	11320	11325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014657	TAA	2	6	11328	11333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014657	TTC	2	6	13380	13385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014657	AT	3	6	13405	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014657	T	6	6	13410	13415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014657	TACT	2	8	13455	13462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014657	T	6	6	13462	13467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014657	AGA	2	6	13472	13477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014657	T	6	6	13504	13509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014657	ATTT	2	8	13526	13533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014657	T	6	6	13576	13581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014657	TAA	2	6	13586	13591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014657	AAG	2	6	13612	13617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014657	ATT	2	6	14203	14208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014657	TTG	2	6	14228	14233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014657	T	6	6	15292	15297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014657	T	6	6	15343	15348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014657	ACA	2	6	15361	15366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014657	CAAT	2	8	15380	15387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014657	AAATT	2	10	15408	15417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014657	AAAT	2	8	15424	15431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014657	TAA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014657	ATTT	2	8	16186	16193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014657	CCT	2	6	16196	16201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014657	A	6	6	16225	16230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014657	AGT	2	6	17817	17822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014657	A	6	6	17853	17858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014657	AAT	2	6	17907	17912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014657	TA	4	8	17961	17968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014657	A	6	6	17980	17985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014657	GAA	2	6	18004	18009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014657	CAT	2	6	19636	19641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014657	TTTA	2	8	19683	19690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014657	TTC	2	6	19740	19745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014657	T	6	6	20433	20438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014657	TAA	2	6	20451	20456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014657	A	6	6	20496	20501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014657	ATA	2	6	20518	20523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014657	TA	3	6	20566	20571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014657	A	6	6	20571	20576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014657	TAAT	2	8	21903	21910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014657	TGA	3	9	21934	21942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014657	T	7	7	21951	21957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014657	TAACT	2	10	21965	21974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014657	T	7	7	21974	21980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014657	ATA	2	6	21993	21998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014657	T	6	6	23796	23801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014657	A	6	6	25643	25648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014657	TG	3	6	25678	25683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014657	TAA	2	6	25761	25766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014657	A	6	6	25765	25770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014657	TTC	2	6	26466	26471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014657	CAA	2	6	26494	26499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014657	A	6	6	26517	26522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014657	T	7	7	26523	26529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014657	TTAA	2	8	26539	26546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014657	TA	3	6	26564	26569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014657	ATT	2	6	26570	26575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014657	AGG	2	6	26592	26597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014657	TA	3	6	26598	26603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014657	GGA	2	6	29510	29515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014657	TTA	3	9	30603	30611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014657	GAA	2	6	35292	35297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014657	GAT	2	6	35326	35331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014657	T	7	7	36721	36727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014657	A	6	6	36776	36781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014657	TAA	2	6	37520	37525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014657	A	6	6	37540	37545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014657	TAA	2	6	37548	37553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014657	A	6	6	37552	37557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014657	TGC	2	6	37558	37563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014657	GCA	2	6	37582	37587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014657	TTAT	2	8	37604	37611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014657	ATT	2	6	38574	38579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014657	CCT	2	6	38638	38643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014657	T	6	6	39074	39079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014657	CAA	2	6	39192	39197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014657	GA	4	8	44562	44569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014657	TC	3	6	44574	44579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014657	TTTG	2	8	44588	44595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014657	A	6	6	44623	44628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014657	AT	3	6	44726	44731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014657	AAT	2	6	46409	46414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014657	TAT	2	6	46920	46925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014657	T	6	6	46963	46968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014657	AGC	2	6	46969	46974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014657	ACT	2	6	46997	47002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014657	GAAAA	2	10	47081	47090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014657	A	6	6	47087	47092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014657	GGA	2	6	47093	47098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014657	CTTG	2	8	49551	49558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014657	GAT	2	6	49598	49603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014657	TGA	2	6	49617	49622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014657	A	6	6	49630	49635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014657	A	6	6	52202	52207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014657	T	6	6	52231	52236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014657	T	6	6	52246	52251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014657	AAGA	2	8	52275	52282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014657	A	6	6	52333	52338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014657	TAA	2	6	52400	52405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014657	AGA	2	6	52420	52425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014657	A	7	7	52425	52431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014657	TAA	2	6	52432	52437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014657	TGA	2	6	52522	52527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014657	TA	3	6	53282	53287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014657	ATAA	2	8	53304	53311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014657	A	7	7	53332	53338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014657	TGA	2	6	53375	53380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014657	CAA	2	6	53401	53406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014657	A	6	6	54542	54547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014657	TG	3	6	54563	54568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014657	CT	3	6	54575	54580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014657	T	7	7	54582	54588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014657	T	10	10	54635	54644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014657	GT	3	6	54649	54654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014657	ATAA	3	12	54689	54700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014657	CAA	2	6	54780	54785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014657	AAT	2	6	54811	54816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014657	AT	4	8	54821	54828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014657	GTT	2	6	54835	54840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014657	AATA	2	8	54842	54849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014657	TA	3	6	54869	54874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014657	ATT	2	6	54884	54889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014657	T	6	6	54925	54930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014657	AAT	2	6	55044	55049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014657	TA	3	6	55072	55077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014657	TCCT	2	8	55085	55092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014657	CTT	2	6	55095	55100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014657	T	6	6	55113	55118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014657	T	6	6	55131	55136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014657	CCG	2	6	55171	55176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_014657	CTA	2	6	55287	55292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014657	ACC	2	6	55323	55328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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