MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014392	AGC	2	6	1959811	1959816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_014392	TCC	2	6	1961545	1961550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_014392	TATT	2	8	1961567	1961574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_014392	ATT	2	6	1961605	1961610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_014392	CCT	2	6	1962519	1962524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_014392	TCT	2	6	1962538	1962543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_014392	CTG	2	6	1963491	1963496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_014392	AAT	2	6	1963501	1963506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_014392	AAT	2	6	1963528	1963533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_014392	T	7	7	1963543	1963549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_014392	GAA	2	6	1963594	1963599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_014392	ACA	2	6	1963765	1963770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_014392	CCAAA	2	10	1963788	1963797	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7014	NC_014392	TA	3	6	1963809	1963814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_014392	TAT	2	6	1963853	1963858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_014392	A	7	7	1963878	1963884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_014392	AAAAG	2	10	1963921	1963930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_014392	AGA	2	6	1963954	1963959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_014392	TCT	2	6	1964060	1964065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_014392	AT	3	6	1964071	1964076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_014392	A	6	6	1964090	1964095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_014392	GAA	2	6	1964150	1964155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_014392	AAT	2	6	1964162	1964167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_014392	A	6	6	1964204	1964209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_014392	TGA	2	6	1964227	1964232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_014392	GAAA	2	8	1964236	1964243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_014392	A	6	6	1964241	1964246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_014392	TTG	2	6	1964252	1964257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_014392	TTTG	2	8	1964295	1964302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_014392	CTT	2	6	1964357	1964362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_014392	T	6	6	1964361	1964366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_014392	ATTT	2	8	1964390	1964397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_014392	T	6	6	1964406	1964411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_014392	TAAA	2	8	1964413	1964420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_014392	A	7	7	1970138	1970144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_014392	GAA	2	6	1970165	1970170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_014392	TTA	2	6	1970181	1970186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_014392	A	6	6	1970224	1970229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_014392	CTTTG	2	10	1970239	1970248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7040	NC_014392	AAGTT	2	10	1970258	1970267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_014392	AAAT	2	8	1971181	1971188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_014392	ACCACA	2	12	1971192	1971203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_014392	ATA	2	6	1971257	1971262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_014392	CCT	2	6	1973070	1973075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_014392	ATT	2	6	1973124	1973129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_014392	T	6	6	1973131	1973136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_014392	TAT	2	6	1973140	1973145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_014392	ATT	2	6	1973154	1973159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_014392	T	6	6	1973158	1973163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_014392	TAT	2	6	1975876	1975881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_014392	CAAATT	2	12	1975929	1975940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7052	NC_014392	ATC	2	6	1976817	1976822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_014392	TC	3	6	1976821	1976826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_014392	AT	3	6	1978210	1978215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_014392	TAATC	2	10	1978255	1978264	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_014392	GAG	2	6	1978282	1978287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_014392	GTTT	2	8	1978288	1978295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_014392	A	6	6	1979494	1979499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_014392	ATTTT	2	10	1981100	1981109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_014392	T	6	6	1981151	1981156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_014392	TAT	2	6	1981185	1981190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_014392	A	6	6	1981262	1981267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_014392	TCC	2	6	1981686	1981691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_014392	TCT	2	6	1982137	1982142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_014392	CAA	2	6	1982190	1982195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_014392	TGTCAA	2	12	1982244	1982255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7067	NC_014392	AGG	2	6	1982346	1982351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7070	NC_014392	A	6	6	1983547	1983552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7073	NC_014392	TCT	2	6	1985101	1985106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_014392	CT	3	6	1985143	1985148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_014392	TCT	3	9	1985146	1985154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_014392	TGCA	2	8	1985161	1985168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7077	NC_014392	AGTT	2	8	1985295	1985302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_014392	TCC	2	6	1985487	1985492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7082	NC_014392	TAGCA	2	10	1985513	1985522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7083	NC_014392	TTG	2	6	1985528	1985533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7099	NC_014392	ATC	2	6	1986374	1986379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_014392	GCA	2	6	1986450	1986455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_014392	T	6	6	1986587	1986592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_014392	CAA	2	6	1986619	1986624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7105	NC_014392	GAG	2	6	1986640	1986645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_014392	AC	3	6	1986651	1986656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_014392	CT	3	6	1986746	1986751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_014392	CCA	2	6	1986756	1986761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7109	NC_014392	CAA	2	6	1986809	1986814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7111	NC_014392	A	7	7	1986893	1986899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_014392	CTA	2	6	1986900	1986905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7114	NC_014392	ATA	2	6	1986920	1986925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_014392	TTTTA	2	10	1986942	1986951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_014392	A	8	8	1986953	1986960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_014392	TA	3	6	1986961	1986966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_014392	TA	3	6	1986989	1986994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_014392	AT	4	8	1987047	1987054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7126	NC_014392	T	6	6	1987263	1987268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_014392	A	6	6	1987278	1987283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_014392	AAAATA	2	12	1987345	1987356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_014392	TAT	2	6	1988552	1988557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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