MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 8922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014355	GGAA	2	8	2919809	2919816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014355	AGG	2	6	2919829	2919834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_014355	GGT	2	6	2920499	2920504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_014355	CGG	2	6	2920524	2920529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014355	AGC	2	6	2921775	2921780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_014355	CGG	2	6	2921831	2921836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014355	CCT	2	6	2922913	2922918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_014355	CT	3	6	2922917	2922922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_014355	CGGA	2	8	2922934	2922941	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_014355	CGGA	2	8	2924511	2924518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_014355	ATC	2	6	2925452	2925457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014355	CAAC	2	8	2925462	2925469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_014355	ACG	2	6	2926509	2926514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014355	TCCG	2	8	2926587	2926594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_014355	AGGC	2	8	2926608	2926615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_014355	GAG	2	6	2930332	2930337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014355	CGGT	2	8	2930987	2930994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_014355	ACGG	2	8	2930996	2931003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_014355	ATTTC	2	10	2933620	2933629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6020	NC_014355	CCG	2	6	2933645	2933650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_014355	ACA	2	6	2933700	2933705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_014355	TCA	2	6	2933726	2933731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014355	CTCTC	2	10	2934844	2934853	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6024	NC_014355	TCT	2	6	2936004	2936009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014355	CTAC	2	8	2936843	2936850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_014355	GAC	2	6	2936862	2936867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014355	GCC	2	6	2936936	2936941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_014355	GCG	2	6	2940328	2940333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_014355	GAC	2	6	2943502	2943507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_014355	GC	3	6	2945243	2945248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_014355	CG	3	6	2951491	2951496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_014355	ACG	2	6	2953979	2953984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014355	CGA	2	6	2955258	2955263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014355	CG	4	8	2955274	2955281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_014355	GCC	2	6	2955286	2955291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_014355	CTG	2	6	2955295	2955300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_014355	GCAT	2	8	2955357	2955364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_014355	AC	3	6	2955407	2955412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_014355	CAG	2	6	2957454	2957459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_014355	GAG	4	12	2959608	2959619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014355	CGG	2	6	2959621	2959626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_014355	GCA	2	6	2959774	2959779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_014355	CGC	2	6	2959836	2959841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_014355	CTG	2	6	2959862	2959867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014355	CGA	2	6	2961797	2961802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014355	GAA	2	6	2961825	2961830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014355	GCC	2	6	2961874	2961879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_014355	GATC	2	8	2963960	2963967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_014355	AGCAC	2	10	2963983	2963992	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6050	NC_014355	CGC	2	6	2964027	2964032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_014355	AGA	2	6	2965295	2965300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014355	CG	3	6	2965321	2965326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_014355	CGG	2	6	2965355	2965360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_014355	GCG	2	6	2965361	2965366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014355	CATT	2	8	2965376	2965383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_014355	AACG	2	8	2965416	2965423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_014355	AGCA	2	8	2965563	2965570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_014355	CA	3	6	2965573	2965578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_014355	CTGA	2	8	2965687	2965694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_014355	ATC	2	6	2968357	2968362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014355	CGG	2	6	2968368	2968373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_014355	AG	3	6	2968390	2968395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014355	TGC	2	6	2969921	2969926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_014355	GGA	2	6	2971065	2971070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014355	ACGA	2	8	2971107	2971114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_014355	GAA	2	6	2971134	2971139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014355	CGCA	2	8	2971145	2971152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_014355	CGG	2	6	2971155	2971160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014355	GCA	2	6	2971224	2971229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014355	TGA	2	6	2973224	2973229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014355	AAC	2	6	2978283	2978288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_014355	CCA	2	6	2982603	2982608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_014355	TATTC	2	10	2991424	2991433	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6074	NC_014355	CCT	2	6	2993161	2993166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_014355	CGAC	2	8	2993199	2993206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_014355	CCT	2	6	2993683	2993688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_014355	ACTC	2	8	2994863	2994870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_014355	ACC	2	6	2997266	2997271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_014355	TGT	2	6	2997331	2997336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_014355	GCA	2	6	2997367	2997372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014355	ACG	2	6	2997447	2997452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_014355	GCCGA	2	10	2997458	2997467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6083	NC_014355	GGA	2	6	2997475	2997480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014355	CAG	3	9	2998528	2998536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_014355	ATC	2	6	3002599	3002604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_014355	CTT	2	6	3004110	3004115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_014355	TAG	2	6	3004187	3004192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014355	TA	3	6	3004248	3004253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014355	TCT	2	6	3010956	3010961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_014355	GA	3	6	3012355	3012360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014355	TC	3	6	3012379	3012384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_014355	CGG	2	6	3012396	3012401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_014355	ACCG	2	8	3012441	3012448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_014355	TCA	2	6	3017334	3017339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_014355	GGT	2	6	3017372	3017377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_014355	CAG	3	9	3017381	3017389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014355	TG	3	6	3017416	3017421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_014355	GCCT	2	8	3017423	3017430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_014355	TGAA	2	8	3018093	3018100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_014355	CAC	2	6	3018140	3018145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_014355	CA	3	6	3018147	3018152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_014355	ATT	2	6	3019208	3019213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_014355	ATC	2	6	3019217	3019222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_014355	TCCT	2	8	3021151	3021158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_014355	AGC	2	6	3023932	3023937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014355	CCGGA	2	10	3023940	3023949	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6107	NC_014355	CGC	2	6	3023967	3023972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_014355	AC	3	6	3023981	3023986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_014355	TCC	2	6	3025560	3025565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_014355	CCT	2	6	3027204	3027209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_014355	CT	3	6	3027256	3027261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_014355	ACT	2	6	3028868	3028873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_014355	TC	3	6	3028883	3028888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_014355	AGA	2	6	3028940	3028945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_014355	GCAT	2	8	3028987	3028994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_014355	CAT	2	6	3029003	3029008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_014355	GA	3	6	3029068	3029073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014355	GCC	2	6	3029370	3029375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_014355	GTG	2	6	3031412	3031417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_014355	ATC	2	6	3031436	3031441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014355	GC	3	6	3034066	3034071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_014355	AAG	2	6	3034195	3034200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_014355	AGC	2	6	3034936	3034941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014355	GCCGT	2	10	3034978	3034987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6125	NC_014355	GGGCTG	2	12	3035728	3035739	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6126	NC_014355	AGC	2	6	3035782	3035787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_014355	TAC	2	6	3037233	3037238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014355	TGG	2	6	3037241	3037246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_014355	CAT	2	6	3037249	3037254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_014355	T	6	6	3037273	3037278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_014355	TGC	2	6	3037328	3037333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_014355	AGAC	2	8	3037341	3037348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_014355	ACG	2	6	3038325	3038330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_014355	ATG	2	6	3038358	3038363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_014355	TGAAC	2	10	3038402	3038411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6136	NC_014355	GAA	2	6	3038420	3038425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_014355	GCTC	2	8	3039248	3039255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6149	NC_014355	TTCTC	2	10	3047069	3047078	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6152	NC_014355	CAT	2	6	3047157	3047162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6154	NC_014355	CA	3	6	3047274	3047279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6155	NC_014355	ACG	2	6	3047280	3047285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6157	NC_014355	AAC	2	6	3047344	3047349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6158	NC_014355	GC	3	6	3048150	3048155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6159	NC_014355	TCC	2	6	3050635	3050640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6161	NC_014355	CCT	2	6	3051959	3051964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6162	NC_014355	CT	3	6	3051963	3051968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6163	NC_014355	GAC	2	6	3052018	3052023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6164	NC_014355	CCAT	2	8	3052036	3052043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6165	NC_014355	CTT	2	6	3053875	3053880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6166	NC_014355	TGA	2	6	3053912	3053917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6173	NC_014355	TCT	2	6	3054165	3054170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6227	NC_014355	T	7	7	3106976	3106982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6228	NC_014355	TTGA	2	8	3107001	3107008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6240	NC_014355	ATG	2	6	3113819	3113824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6242	NC_014355	TGAAT	2	10	3113847	3113856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_014355	ACT	2	6	3114533	3114538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6244	NC_014355	TACA	2	8	3116651	3116658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6245	NC_014355	TTG	2	6	3116672	3116677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_014355	TAA	2	6	3116729	3116734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6248	NC_014355	GCC	2	6	3121550	3121555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6249	NC_014355	CAC	2	6	3121588	3121593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6250	NC_014355	CG	3	6	3127734	3127739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6251	NC_014355	GGTCC	2	10	3127935	3127944	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6252	NC_014355	CTC	2	6	3129871	3129876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6253	NC_014355	AGA	2	6	3129902	3129907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_014355	CGA	2	6	3129910	3129915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6256	NC_014355	CAA	2	6	3130983	3130988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_014355	TGT	2	6	3132140	3132145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_014355	CCGGT	2	10	3132222	3132231	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6259	NC_014355	CCG	2	6	3132290	3132295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6260	NC_014355	CCG	2	6	3133319	3133324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6262	NC_014355	CCGG	2	8	3134422	3134429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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