MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	TGT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014328	ATT	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014328	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014328	CAA	2	6	1458	1463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014328	ATT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014328	TAA	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014328	A	6	6	1497	1502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014328	T	9	9	1511	1519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014328	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014328	T	7	7	1578	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014328	CTA	3	9	1630	1638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014328	TTA	2	6	1639	1644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014328	TAAT	2	8	1652	1659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014328	TA	3	6	1671	1676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014328	AGG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014328	A	7	7	2818	2824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014328	ATA	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014328	TA	3	6	3080	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014328	AGG	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014328	AG	3	6	6433	6438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014328	TAAA	2	8	8954	8961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014328	TATT	2	8	8993	9000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014328	A	6	6	9011	9016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014328	GT	3	6	9030	9035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014328	TAT	2	6	9062	9067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014328	GTAT	2	8	9071	9078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014328	TA	3	6	9092	9097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014328	GTC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014328	A	7	7	9222	9228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014328	GAT	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014328	AGC	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014328	A	6	6	9376	9381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014328	TAA	2	6	9391	9396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014328	GGC	2	6	9454	9459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014328	GCG	2	6	9510	9515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014328	ACCT	2	8	9539	9546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014328	ATA	2	6	9588	9593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014328	CGA	2	6	9690	9695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014328	GA	3	6	9737	9742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014328	GCA	2	6	9764	9769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014328	GCA	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014328	CGC	2	6	9811	9816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014328	GTGA	2	8	9817	9824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014328	AGG	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014328	CAG	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014328	GAG	2	6	10052	10057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014328	GAA	2	6	10099	10104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014328	AGG	2	6	10222	10227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014328	AGC	2	6	10327	10332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014328	GAA	2	6	10362	10367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014328	GGT	2	6	10435	10440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014328	GTC	2	6	10449	10454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014328	TCGTG	2	10	10458	10467	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014328	TGT	2	6	10504	10509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014328	GGA	2	6	10561	10566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014328	ATC	2	6	10585	10590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014328	AC	3	6	10612	10617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014328	AG	3	6	10637	10642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014328	AC	3	6	10780	10785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014328	AGG	2	6	10837	10842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014328	CCT	2	6	10919	10924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014328	ATCT	2	8	10952	10959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014328	TAAG	2	8	10975	10982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014328	AGAT	2	8	11017	11024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014328	TCT	2	6	11025	11030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014328	TAAAG	2	10	11101	11110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014328	TATAA	2	10	11118	11127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014328	GAT	2	6	11168	11173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014328	GGA	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014328	AAG	2	6	11259	11264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014328	GGA	2	6	11421	11426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014328	AGAA	2	8	11429	11436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014328	GCG	2	6	11455	11460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014328	AG	3	6	11541	11546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014328	CCG	2	6	11557	11562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014328	ACC	2	6	11657	11662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014328	TAC	2	6	11676	11681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014328	GGGAG	2	10	11733	11742	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014328	GT	3	6	11762	11767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014328	ACG	2	6	11794	11799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014328	GCA	2	6	11838	11843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014328	TGT	2	6	11907	11912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014328	GGA	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014328	ACA	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014328	ACC	2	6	12234	12239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014328	TAAGT	2	10	12258	12267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014328	TG	3	6	12277	12282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014328	AGC	2	6	12314	12319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014328	ACC	2	6	12393	12398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014328	GGAA	2	8	12457	12464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014328	GA	4	8	12480	12487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014328	AGG	2	6	12670	12675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014328	ATGT	2	8	12697	12704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014328	ATG	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014328	AGGT	2	8	12850	12857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014328	GAG	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014328	GAA	2	6	12882	12887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014328	TTG	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014328	CGG	2	6	13103	13108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014328	ACA	2	6	13199	13204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014328	TGCT	2	8	13235	13242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014328	AGT	2	6	13336	13341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014328	GCCA	2	8	13345	13352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014328	ACC	2	6	13374	13379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014328	CCT	2	6	13462	13467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014328	TTC	2	6	13514	13519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014328	GGT	2	6	13598	13603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014328	TCG	2	6	13713	13718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014328	CGT	2	6	13793	13798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014328	GAG	2	6	13842	13847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014328	GACC	2	8	13876	13883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014328	GTT	2	6	13896	13901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014328	AAGAT	2	10	13977	13986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014328	GAA	2	6	14017	14022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014328	GAG	2	6	14026	14031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014328	CTGA	2	8	14067	14074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014328	GAAA	2	8	14109	14116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014328	A	7	7	14114	14120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014328	AT	4	8	14172	14179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014328	GAG	2	6	14221	14226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014328	GAT	2	6	14300	14305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014328	TGG	2	6	14310	14315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014328	TAA	2	6	14424	14429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014328	CCA	2	6	14501	14506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014328	T	6	6	14542	14547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014328	TAT	2	6	14553	14558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014328	GGA	2	6	14585	14590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014328	T	6	6	15117	15122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014328	TAAT	2	8	15172	15179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014328	GGT	2	6	15771	15776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014328	AG	3	6	18511	18516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014328	ATT	2	6	18538	18543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014328	TAT	2	6	20349	20354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014328	TAA	2	6	20372	20377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014328	AT	3	6	20387	20392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014328	TA	3	6	20397	20402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014328	A	7	7	20420	20426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014328	TA	3	6	20427	20432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014328	TTAA	2	8	20434	20441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014328	TGA	2	6	20450	20455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014328	TAG	2	6	20462	20467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014328	AG	3	6	20483	20488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014328	ATA	2	6	20515	20520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014328	AG	3	6	20577	20582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014328	TTAA	2	8	20599	20606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014328	TAT	2	6	20663	20668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014328	TA	3	6	20676	20681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014328	GAT	2	6	20682	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014328	GGA	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014328	GA	3	6	22050	22055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014328	AGT	2	6	22141	22146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014328	T	6	6	22156	22161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014328	A	7	7	22186	22192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014328	AT	3	6	22200	22205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014328	TGT	2	6	22212	22217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014328	TAA	2	6	22220	22225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014328	CTTT	2	8	22322	22329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_014328	ATA	2	6	22337	22342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014328	TAA	2	6	22465	22470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014328	CTT	2	6	22517	22522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014328	T	7	7	22521	22527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014328	TA	3	6	22543	22548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014328	CTC	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_014328	T	6	6	22725	22730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014328	TA	3	6	24115	24120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014328	TTTTA	2	10	24128	24137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014328	ATA	2	6	24167	24172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014328	AATT	2	8	24199	24206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014328	ATA	2	6	24223	24228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014328	AT	3	6	24242	24247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014328	T	6	6	24253	24258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014328	TATCT	2	10	24307	24316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_014328	TAAG	2	8	24318	24325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014328	ATT	2	6	24346	24351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014328	AGTAC	2	10	24397	24406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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178	NC_014328	GT	4	8	24426	24433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014328	TCC	2	6	24463	24468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_014328	AATAT	2	10	24559	24568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014328	AGA	2	6	24602	24607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014328	CTT	2	6	25270	25275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_014328	TAT	3	9	25278	25286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014328	AAT	2	6	25311	25316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014328	TAATA	2	10	25354	25363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014328	ACA	2	6	25364	25369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_014328	CAA	2	6	26571	26576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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190	NC_014328	T	6	6	26631	26636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014328	TGT	2	6	26698	26703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_014328	AG	3	6	26711	26716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014328	AG	3	6	27403	27408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014328	A	6	6	27494	27499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014328	CAA	2	6	27520	27525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_014328	TA	6	12	27588	27599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014328	TACT	2	8	27605	27612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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277	NC_014328	AAAT	2	8	40220	40227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014328	T	6	6	40242	40247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014328	A	6	6	40280	40285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014328	T	6	6	40305	40310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014328	TA	3	6	40325	40330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014328	A	6	6	40376	40381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_014328	ATTAA	2	10	40733	40742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_014328	TGT	2	6	40762	40767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014328	A	6	6	40826	40831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014328	GGA	2	6	40837	40842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014328	AAAT	2	8	40858	40865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014328	TTA	2	6	40892	40897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_014328	ATT	2	6	58799	58804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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