MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014328	TAA	2	6	3422189	3422194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_014328	ATA	3	9	3422211	3422219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_014328	TAT	2	6	3422232	3422237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_014328	TA	3	6	3422257	3422262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_014328	ACTC	2	8	3422462	3422469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15006	NC_014328	AAGT	2	8	3422566	3422573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_014328	GGTAT	2	10	3422581	3422590	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_014328	AGA	2	6	3422632	3422637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_014328	TAT	2	6	3422644	3422649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_014328	ATT	3	9	3422650	3422658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_014328	A	7	7	3422722	3422728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_014328	TTA	2	6	3422743	3422748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_014328	ATA	2	6	3422763	3422768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_014328	TAA	2	6	3422798	3422803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_014328	TCA	2	6	3423960	3423965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_014328	ATT	2	6	3423969	3423974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_014328	ATT	2	6	3423979	3423984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_014328	TAG	2	6	3423995	3424000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_014328	TAT	2	6	3424020	3424025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_014328	AAT	2	6	3424082	3424087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_014328	TCT	2	6	3424092	3424097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_014328	CCT	2	6	3424698	3424703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15023	NC_014328	ATA	2	6	3424713	3424718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_014328	AT	3	6	3424734	3424739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_014328	AGAT	2	8	3424755	3424762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_014328	ATA	2	6	3424805	3424810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_014328	CAG	2	6	3424890	3424895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_014328	A	7	7	3424927	3424933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_014328	AT	3	6	3424951	3424956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_014328	ACT	2	6	3425019	3425024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_014328	A	6	6	3425064	3425069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_014328	TA	3	6	3425073	3425078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_014328	CTGG	2	8	3425110	3425117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15034	NC_014328	TACTA	2	10	3425235	3425244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15035	NC_014328	TTAA	2	8	3425248	3425255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_014328	TA	3	6	3425606	3425611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_014328	AAAT	2	8	3425627	3425634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_014328	TTAA	2	8	3425641	3425648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_014328	AAG	2	6	3425660	3425665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_014328	AGG	2	6	3425696	3425701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_014328	AT	3	6	3427215	3427220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_014328	CGT	2	6	3427236	3427241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_014328	AAATA	2	10	3427288	3427297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_014328	TAT	2	6	3427819	3427824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_014328	TAA	2	6	3427840	3427845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_014328	T	6	6	3427863	3427868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_014328	AAT	2	6	3427892	3427897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_014328	AGCAA	2	10	3427912	3427921	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15049	NC_014328	TAAT	2	8	3427936	3427943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_014328	ATT	2	6	3429184	3429189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_014328	TAGA	2	8	3429190	3429197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_014328	AGA	2	6	3429290	3429295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_014328	GCA	2	6	3429297	3429302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_014328	CTAT	2	8	3429350	3429357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_014328	TTA	2	6	3429384	3429389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_014328	TA	3	6	3429399	3429404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_014328	TA	3	6	3429431	3429436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_014328	TAT	2	6	3429461	3429466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_014328	CCCAT	2	10	3429709	3429718	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15060	NC_014328	ATTA	2	8	3429732	3429739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_014328	A	6	6	3429755	3429760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_014328	CTT	2	6	3429770	3429775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_014328	ATT	2	6	3429781	3429786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_014328	T	6	6	3429802	3429807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_014328	AAT	2	6	3429822	3429827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_014328	AAAAC	2	10	3429863	3429872	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15067	NC_014328	TCATTA	2	12	3429885	3429896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15068	NC_014328	ATT	3	9	3429907	3429915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_014328	TGTATT	2	12	3429920	3429931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_014328	TA	3	6	3429933	3429938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_014328	ATA	2	6	3429972	3429977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_014328	ACT	2	6	3430032	3430037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_014328	ACC	2	6	3430081	3430086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15074	NC_014328	TAT	2	6	3430101	3430106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_014328	A	6	6	3430113	3430118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_014328	CAC	2	6	3430138	3430143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15077	NC_014328	TAT	2	6	3430841	3430846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_014328	TTA	2	6	3430850	3430855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_014328	TAT	2	6	3430857	3430862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_014328	T	7	7	3430889	3430895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_014328	AATA	2	8	3430939	3430946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_014328	AT	3	6	3430953	3430958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_014328	T	7	7	3431457	3431463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_014328	CCT	2	6	3431464	3431469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15085	NC_014328	TTTA	2	8	3431475	3431482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_014328	CAT	2	6	3432330	3432335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15087	NC_014328	CTTC	2	8	3436119	3436126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15088	NC_014328	GCA	2	6	3436132	3436137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_014328	ATG	2	6	3436156	3436161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_014328	TACT	2	8	3436206	3436213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15091	NC_014328	GAT	2	6	3436266	3436271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_014328	TAA	2	6	3436306	3436311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_014328	ACT	2	6	3436312	3436317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_014328	AAT	2	6	3436342	3436347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_014328	CCA	3	9	3436378	3436386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15096	NC_014328	CCTT	2	8	3436421	3436428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15097	NC_014328	ATA	2	6	3444652	3444657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_014328	TTC	2	6	3444679	3444684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_014328	ATT	2	6	3444704	3444709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_014328	ATA	2	6	3445342	3445347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_014328	AT	3	6	3445361	3445366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_014328	TAA	2	6	3445382	3445387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_014328	TTTG	2	8	3445388	3445395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_014328	TAT	2	6	3445429	3445434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_014328	TCA	2	6	3445438	3445443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_014328	CAT	2	6	3445474	3445479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_014328	TTC	2	6	3445484	3445489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_014328	TAA	2	6	3445523	3445528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_014328	TCA	2	6	3445554	3445559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_014328	CAT	2	6	3445570	3445575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_014328	CTTT	2	8	3448740	3448747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15112	NC_014328	ATA	2	6	3448752	3448757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_014328	TCC	2	6	3449824	3449829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15114	NC_014328	CTA	2	6	3451148	3451153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_014328	TGA	2	6	3455447	3455452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_014328	TAACCA	2	12	3455456	3455467	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_014328	CAA	2	6	3455469	3455474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_014328	AAAAT	2	10	3455476	3455485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_014328	A	6	6	3455504	3455509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_014328	ACC	2	6	3456111	3456116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15121	NC_014328	CAC	2	6	3457048	3457053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15122	NC_014328	GTTTT	2	10	3457064	3457073	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_014328	A	6	6	3457081	3457086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_014328	AT	3	6	3458023	3458028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_014328	AGG	2	6	3458059	3458064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_014328	TTAA	2	8	3458673	3458680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_014328	TA	3	6	3458695	3458700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_014328	ATT	2	6	3458704	3458709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15130	NC_014328	AGG	2	6	3458747	3458752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15393	NC_014328	ATATA	2	10	3530097	3530106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15394	NC_014328	AT	3	6	3530108	3530113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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