MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014328	TAC	2	6	3324028	3324033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_014328	TAA	2	6	3324050	3324055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_014328	TA	3	6	3324088	3324093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_014328	CTG	2	6	3324114	3324119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_014328	TA	3	6	3324124	3324129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_014328	AAT	2	6	3324174	3324179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_014328	GAT	2	6	3324233	3324238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_014328	AGAA	2	8	3324286	3324293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_014328	A	7	7	3324336	3324342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_014328	TAT	2	6	3326534	3326539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_014328	AAT	2	6	3326547	3326552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_014328	TCC	2	6	3329298	3329303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14513	NC_014328	TATG	2	8	3329329	3329336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_014328	GTTT	2	8	3329377	3329384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_014328	ATT	2	6	3329402	3329407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_014328	TAA	2	6	3329491	3329496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_014328	TAAAC	2	10	3329551	3329560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14518	NC_014328	T	6	6	3329605	3329610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_014328	TAT	2	6	3329614	3329619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_014328	TTG	2	6	3329623	3329628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_014328	TCT	2	6	3329720	3329725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_014328	ATC	2	6	3329758	3329763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_014328	CAT	2	6	3329768	3329773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_014328	ATT	2	6	3329783	3329788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_014328	TATTT	2	10	3329805	3329814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_014328	ACA	2	6	3329820	3329825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_014328	CTA	2	6	3329868	3329873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_014328	AAT	2	6	3330002	3330007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_014328	CTT	2	6	3331897	3331902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_014328	TAA	2	6	3333987	3333992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_014328	TTAA	2	8	3334038	3334045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_014328	ACAA	2	8	3334058	3334065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14533	NC_014328	TATT	2	8	3334088	3334095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_014328	TAT	2	6	3334195	3334200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_014328	AT	4	8	3334209	3334216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_014328	TAA	2	6	3334320	3334325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_014328	TAAA	2	8	3334384	3334391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_014328	CAA	2	6	3335581	3335586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_014328	TCAC	2	8	3335628	3335635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14540	NC_014328	CAT	2	6	3335643	3335648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_014328	ACT	2	6	3335653	3335658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_014328	AT	3	6	3335663	3335668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_014328	ATT	2	6	3335679	3335684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_014328	AT	4	8	3335685	3335692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_014328	A	7	7	3335699	3335705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_014328	CCT	2	6	3335822	3335827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14547	NC_014328	TAA	2	6	3335832	3335837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_014328	ATA	2	6	3335853	3335858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_014328	TA	3	6	3335883	3335888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_014328	TAT	2	6	3335915	3335920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_014328	TAGA	2	8	3335966	3335973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_014328	TTG	2	6	3336007	3336012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_014328	GTT	2	6	3336040	3336045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_014328	CTTGC	2	10	3336072	3336081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14555	NC_014328	A	7	7	3336096	3336102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_014328	TAA	2	6	3336132	3336137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_014328	AATG	2	8	3336897	3336904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_014328	CCA	2	6	3336915	3336920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14559	NC_014328	CTATAT	2	12	3336937	3336948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14560	NC_014328	GAAA	2	8	3337017	3337024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_014328	TAT	2	6	3337084	3337089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_014328	AT	3	6	3337110	3337115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_014328	CAAATA	2	12	3337125	3337136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14564	NC_014328	ATA	2	6	3338468	3338473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_014328	CCTT	2	8	3345746	3345753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14566	NC_014328	AT	3	6	3345775	3345780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_014328	AAT	2	6	3345781	3345786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_014328	ATT	2	6	3345803	3345808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_014328	AT	3	6	3345809	3345814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_014328	T	7	7	3345817	3345823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_014328	TTAAAT	2	12	3345889	3345900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_014328	AAAT	2	8	3345915	3345922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_014328	TAAT	2	8	3345991	3345998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_014328	TGA	2	6	3346020	3346025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14577	NC_014328	TCT	2	6	3348434	3348439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_014328	AAT	3	9	3349560	3349568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_014328	AT	3	6	3349623	3349628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_014328	AAT	2	6	3349653	3349658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_014328	TCA	2	6	3349769	3349774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_014328	TAATA	2	10	3349780	3349789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_014328	ATA	2	6	3351351	3351356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_014328	TTA	2	6	3351404	3351409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_014328	ATA	2	6	3351484	3351489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_014328	TCG	2	6	3355012	3355017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14588	NC_014328	TATT	2	8	3356119	3356126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_014328	TA	3	6	3356679	3356684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_014328	CAT	2	6	3356711	3356716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14592	NC_014328	TTCC	2	8	3356741	3356748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14593	NC_014328	A	6	6	3357790	3357795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_014328	ATATAC	2	12	3357848	3357859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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14596	NC_014328	TAA	2	6	3357889	3357894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_014328	ATT	2	6	3357911	3357916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_014328	TA	5	10	3357963	3357972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_014328	TTTA	2	8	3357989	3357996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_014328	A	8	8	3358092	3358099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_014328	TAA	2	6	3358119	3358124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_014328	ATT	2	6	3358125	3358130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_014328	ATT	2	6	3358132	3358137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_014328	T	7	7	3358136	3358142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_014328	ATA	3	9	3358146	3358154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_014328	T	6	6	3358157	3358162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_014328	TTC	2	6	3358213	3358218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_014328	TA	4	8	3358219	3358226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_014328	GTA	2	6	3358286	3358291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_014328	A	6	6	3358291	3358296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_014328	TAAT	2	8	3358304	3358311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_014328	TGA	2	6	3358333	3358338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_014328	ATA	2	6	3358647	3358652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_014328	TAA	2	6	3361057	3361062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_014328	TAA	2	6	3361070	3361075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_014328	ATTT	2	8	3361096	3361103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_014328	TAA	2	6	3362029	3362034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_014328	TC	3	6	3362038	3362043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14619	NC_014328	TTAAG	2	10	3362064	3362073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_014328	TAT	2	6	3362083	3362088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_014328	ATA	2	6	3362093	3362098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_014328	TAT	2	6	3362124	3362129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_014328	ACATT	2	10	3362179	3362188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14624	NC_014328	CATTT	2	10	3362238	3362247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14625	NC_014328	GTA	2	6	3362265	3362270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14628	NC_014328	T	7	7	3362519	3362525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_014328	TAAT	2	8	3362534	3362541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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