MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014328	CTC	2	6	3201801	3201806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14002	NC_014328	AC	3	6	3201822	3201827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14003	NC_014328	CCA	2	6	3201843	3201848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_014328	CT	3	6	3201856	3201861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14005	NC_014328	TAA	2	6	3201869	3201874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_014328	CTA	2	6	3201880	3201885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_014328	ATTT	2	8	3201900	3201907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_014328	TTC	3	9	3201934	3201942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_014328	TTTTA	2	10	3202422	3202431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_014328	ATT	2	6	3202494	3202499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_014328	AAG	2	6	3202506	3202511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_014328	ATA	2	6	3202514	3202519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_014328	TAA	2	6	3202718	3202723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_014328	T	6	6	3202744	3202749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_014328	AT	3	6	3202781	3202786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_014328	GA	3	6	3202821	3202826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_014328	A	6	6	3202838	3202843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_014328	TAA	2	6	3202854	3202859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_014328	TACT	2	8	3202874	3202881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14020	NC_014328	ATTAT	2	10	3203347	3203356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_014328	TAT	2	6	3203367	3203372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_014328	TAT	4	12	3203379	3203390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_014328	A	6	6	3203419	3203424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_014328	TAT	2	6	3203461	3203466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_014328	AT	3	6	3204989	3204994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_014328	TCA	2	6	3204997	3205002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_014328	TAAT	2	8	3205018	3205025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_014328	AT	3	6	3207074	3207079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_014328	ATTT	2	8	3207083	3207090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_014328	AAT	2	6	3207104	3207109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_014328	TA	3	6	3207117	3207122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_014328	AT	3	6	3207123	3207128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_014328	ATT	2	6	3207140	3207145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_014328	ATA	2	6	3207183	3207188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_014328	TTC	2	6	3208715	3208720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_014328	TAAA	2	8	3208754	3208761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_014328	AT	4	8	3208787	3208794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_014328	ATTA	2	8	3208860	3208867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_014328	TA	3	6	3208866	3208871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_014328	CTA	2	6	3208919	3208924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_014328	TTC	2	6	3208982	3208987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_014328	TAA	2	6	3209036	3209041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_014328	ATG	2	6	3209149	3209154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_014328	A	7	7	3209258	3209264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_014328	GCA	2	6	3209380	3209385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_014328	ATGTTT	2	12	3211640	3211651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_014328	TAATT	2	10	3211658	3211667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_014328	CTT	2	6	3211672	3211677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_014328	CAA	2	6	3211680	3211685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_014328	CCTA	2	8	3211699	3211706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14051	NC_014328	TAA	2	6	3211727	3211732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_014328	A	6	6	3211753	3211758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_014328	T	6	6	3211770	3211775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_014328	CAC	2	6	3212565	3212570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14055	NC_014328	TATTT	2	10	3212589	3212598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_014328	T	6	6	3212605	3212610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_014328	AT	4	8	3212614	3212621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_014328	TTAT	2	8	3212624	3212631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_014328	T	6	6	3212636	3212641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_014328	AT	3	6	3212651	3212656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_014328	CTAC	2	8	3212672	3212679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_014328	A	6	6	3212755	3212760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_014328	CA	3	6	3212799	3212804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_014328	TAAG	2	8	3212856	3212863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_014328	ATC	2	6	3213530	3213535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_014328	GTA	2	6	3213547	3213552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_014328	TAT	2	6	3213557	3213562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_014328	TA	3	6	3214070	3214075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_014328	GAC	2	6	3214131	3214136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_014328	TAC	2	6	3214161	3214166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_014328	AT	3	6	3214173	3214178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_014328	ATTT	2	8	3214194	3214201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_014328	CCT	2	6	3215559	3215564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14074	NC_014328	TTTA	2	8	3215566	3215573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_014328	TG	3	6	3222097	3222102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_014328	ATA	2	6	3222115	3222120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_014328	CCT	2	6	3222138	3222143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14078	NC_014328	TAAT	2	8	3222200	3222207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_014328	A	6	6	3222213	3222218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_014328	ATT	2	6	3222276	3222281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_014328	AAT	2	6	3222464	3222469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_014328	AATT	2	8	3222485	3222492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_014328	TATT	2	8	3222557	3222564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_014328	ATT	2	6	3222608	3222613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_014328	AATTA	2	10	3222628	3222637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_014328	T	7	7	3222642	3222648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_014328	ATT	2	6	3222652	3222657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_014328	ATTAT	2	10	3222665	3222674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_014328	AGG	2	6	3222725	3222730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14092	NC_014328	GAA	2	6	3224166	3224171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_014328	ATAAA	2	10	3224253	3224262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_014328	A	7	7	3224260	3224266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_014328	ATT	2	6	3224295	3224300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_014328	T	7	7	3224299	3224305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_014328	ATT	2	6	3225162	3225167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_014328	TTA	2	6	3225201	3225206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_014328	AATT	2	8	3225208	3225215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_014328	ACT	3	9	3225239	3225247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_014328	ATT	2	6	3225248	3225253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_014328	TCCT	2	8	3226039	3226046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_014328	TCC	2	6	3228151	3228156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14104	NC_014328	TA	3	6	3228159	3228164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_014328	TTTTA	2	10	3228184	3228193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_014328	TGT	2	6	3228211	3228216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14108	NC_014328	AAT	2	6	3228285	3228290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_014328	AT	3	6	3228289	3228294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_014328	T	6	6	3228305	3228310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_014328	AAT	2	6	3228351	3228356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_014328	TTA	2	6	3228377	3228382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_014328	GA	3	6	3228395	3228400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_014328	ATT	2	6	3228483	3228488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_014328	TTAA	2	8	3228492	3228499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_014328	TAATT	2	10	3228533	3228542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_014328	T	9	9	3228548	3228556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_014328	TAA	2	6	3228565	3228570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_014328	GAGTT	2	10	3228891	3228900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_014328	AT	3	6	3230282	3230287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_014328	TAAA	2	8	3230321	3230328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14124	NC_014328	TAA	2	6	3231550	3231555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_014328	ATA	2	6	3231572	3231577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_014328	TA	3	6	3231598	3231603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_014328	TAT	2	6	3231612	3231617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_014328	TAT	2	6	3231648	3231653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_014328	TA	3	6	3231659	3231664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_014328	AGG	2	6	3231669	3231674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_014328	TAT	2	6	3231676	3231681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14133	NC_014328	CT	3	6	3232797	3232802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14134	NC_014328	AT	3	6	3232804	3232809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_014328	A	7	7	3232828	3232834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_014328	CCT	2	6	3233435	3233440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14137	NC_014328	ATTTT	2	10	3233494	3233503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14138	NC_014328	T	7	7	3233500	3233506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_014328	GTA	2	6	3233549	3233554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14141	NC_014328	A	6	6	3233604	3233609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_014328	TAT	2	6	3234457	3234462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_014328	TA	3	6	3236259	3236264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_014328	T	6	6	3236318	3236323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14145	NC_014328	TA	4	8	3236326	3236333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14146	NC_014328	ATTAT	2	10	3236342	3236351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14147	NC_014328	A	7	7	3236357	3236363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14151	NC_014328	T	7	7	3237733	3237739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_014328	A	6	6	3237752	3237757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14155	NC_014328	T	6	6	3237826	3237831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14160	NC_014328	TTAT	2	8	3237937	3237944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14164	NC_014328	T	7	7	3238006	3238012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14165	NC_014328	TA	3	6	3238026	3238031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14166	NC_014328	AT	3	6	3238068	3238073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14167	NC_014328	A	7	7	3238108	3238114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14168	NC_014328	T	6	6	3238125	3238130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14177	NC_014328	ATT	2	6	3238450	3238455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14178	NC_014328	AGG	2	6	3238461	3238466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14191	NC_014328	TAA	2	6	3242482	3242487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14200	NC_014328	TAATA	2	10	3245998	3246007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14231	NC_014328	TA	4	8	3254772	3254779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14232	NC_014328	TAAAT	2	10	3256033	3256042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14239	NC_014328	ATAA	2	8	3256569	3256576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14244	NC_014328	ATT	2	6	3259252	3259257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_014328	AT	3	6	3259264	3259269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_014328	AAT	2	6	3259293	3259298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14247	NC_014328	TTAT	2	8	3259908	3259915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14248	NC_014328	ATT	2	6	3260067	3260072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_014328	T	6	6	3260071	3260076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14250	NC_014328	TTA	2	6	3260179	3260184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_014328	CCGC	2	8	3260195	3260202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14252	NC_014328	CTTT	2	8	3260231	3260238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14253	NC_014328	TTATAT	2	12	3260256	3260267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_014328	ATT	2	6	3260273	3260278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_014328	T	6	6	3260277	3260282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_014328	ATA	2	6	3260320	3260325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_014328	A	7	7	3260329	3260335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_014328	TAA	2	6	3260721	3260726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_014328	AT	3	6	3260727	3260732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_014328	TA	3	6	3260744	3260749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14261	NC_014328	ATTTT	2	10	3260766	3260775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_014328	T	6	6	3261182	3261187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_014328	TTC	2	6	3261230	3261235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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