MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014328	AAT	2	6	3033387	3033392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_014328	ACT	2	6	3033408	3033413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_014328	AAT	2	6	3033482	3033487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_014328	TTTA	2	8	3033491	3033498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_014328	TAT	2	6	3033509	3033514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_014328	TTAC	2	8	3033541	3033548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13007	NC_014328	TTAA	2	8	3033602	3033609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_014328	ATT	3	9	3033648	3033656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_014328	CTT	2	6	3033894	3033899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_014328	ATT	2	6	3033936	3033941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_014328	TA	3	6	3033948	3033953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_014328	TAAT	2	8	3033978	3033985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_014328	CAA	2	6	3033998	3034003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_014328	TTTA	2	8	3034006	3034013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_014328	TAT	2	6	3034044	3034049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_014328	TTATT	2	10	3034050	3034059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_014328	AT	3	6	3034065	3034070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_014328	ATCA	2	8	3034088	3034095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13019	NC_014328	CTT	2	6	3034109	3034114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_014328	AAT	2	6	3034174	3034179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_014328	AT	3	6	3034178	3034183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_014328	T	6	6	3034226	3034231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_014328	AT	3	6	3034850	3034855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_014328	TA	3	6	3034882	3034887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_014328	CA	3	6	3035024	3035029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_014328	A	6	6	3035029	3035034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_014328	TAT	2	6	3035062	3035067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_014328	GCTAT	2	10	3035072	3035081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13029	NC_014328	GAT	2	6	3035132	3035137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13031	NC_014328	AGT	2	6	3035226	3035231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_014328	AATT	2	8	3035243	3035250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_014328	AC	3	6	3035261	3035266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13034	NC_014328	TTCAAT	2	12	3035755	3035766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13035	NC_014328	ATTAT	2	10	3035796	3035805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_014328	AAT	2	6	3035830	3035835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_014328	ATT	2	6	3035849	3035854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_014328	TCTA	2	8	3035867	3035874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13039	NC_014328	AAC	2	6	3035916	3035921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_014328	TAT	2	6	3035942	3035947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_014328	ACA	2	6	3035948	3035953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_014328	TAT	3	9	3035954	3035962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_014328	ATCA	2	8	3035974	3035981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_014328	A	6	6	3035981	3035986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_014328	ATT	2	6	3036036	3036041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_014328	TGTT	2	8	3036060	3036067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_014328	ATA	2	6	3036071	3036076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_014328	TCCA	2	8	3036191	3036198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_014328	TTAA	2	8	3037333	3037340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_014328	CATTTT	2	12	3037376	3037387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13052	NC_014328	CTTA	2	8	3037445	3037452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13053	NC_014328	A	6	6	3037513	3037518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_014328	GAA	2	6	3037519	3037524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_014328	AAT	2	6	3037541	3037546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_014328	CAC	2	6	3037576	3037581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_014328	GCA	2	6	3037625	3037630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_014328	ATT	2	6	3037673	3037678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_014328	CTCA	2	8	3037712	3037719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13060	NC_014328	CTTT	2	8	3037720	3037727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13061	NC_014328	ATT	2	6	3037731	3037736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_014328	ATT	2	6	3037752	3037757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_014328	ATTT	2	8	3037770	3037777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_014328	TTA	2	6	3037797	3037802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_014328	AT	3	6	3037819	3037824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_014328	A	8	8	3037825	3037832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_014328	TCTTT	2	10	3037833	3037842	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13068	NC_014328	ATA	2	6	3037877	3037882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_014328	ATT	2	6	3037940	3037945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_014328	TCGT	2	8	3037962	3037969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13071	NC_014328	AAT	2	6	3038055	3038060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13073	NC_014328	TTA	2	6	3038077	3038082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_014328	T	7	7	3038084	3038090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_014328	ATT	3	9	3038092	3038100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_014328	TA	3	6	3040068	3040073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13078	NC_014328	A	6	6	3040085	3040090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_014328	T	6	6	3040101	3040106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_014328	TTA	2	6	3040112	3040117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_014328	ATT	2	6	3040132	3040137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_014328	T	6	6	3040152	3040157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_014328	TAT	2	6	3040195	3040200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_014328	ATGA	2	8	3040218	3040225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13092	NC_014328	A	7	7	3040561	3040567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_014328	TA	3	6	3040633	3040638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_014328	A	6	6	3040651	3040656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_014328	ATTTG	2	10	3040664	3040673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_014328	AAT	2	6	3040674	3040679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13099	NC_014328	TA	3	6	3040771	3040776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13103	NC_014328	T	18	18	3040935	3040952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13111	NC_014328	TGT	2	6	3041200	3041205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_014328	CAT	2	6	3041238	3041243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_014328	A	6	6	3041248	3041253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_014328	AG	3	6	3043235	3043240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_014328	TCC	2	6	3044300	3044305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13117	NC_014328	TAA	2	6	3044332	3044337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_014328	ATC	2	6	3044404	3044409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_014328	CAA	2	6	3044465	3044470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_014328	TA	3	6	3044493	3044498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_014328	TTG	2	6	3044502	3044507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_014328	CTTTTT	2	12	3044533	3044544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13123	NC_014328	T	7	7	3044540	3044546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_014328	ATTTT	2	10	3044559	3044568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_014328	ATAA	2	8	3044597	3044604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_014328	TA	3	6	3044627	3044632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_014328	TCCA	2	8	3044646	3044653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_014328	A	6	6	3044679	3044684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_014328	GTA	2	6	3044685	3044690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_014328	TGA	2	6	3044704	3044709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13132	NC_014328	TCT	2	6	3046038	3046043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13133	NC_014328	ATA	2	6	3046078	3046083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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