MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014328	TGT	2	6	2328428	2328433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_014328	AT	5	10	2328447	2328456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_014328	T	7	7	2328469	2328475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_014328	A	6	6	2328501	2328506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_014328	TCA	2	6	2329182	2329187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_014328	ACA	2	6	2329236	2329241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_014328	CA	3	6	2329240	2329245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_014328	TTTA	2	8	2330134	2330141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_014328	TAT	2	6	2330181	2330186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_014328	TTA	2	6	2330202	2330207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_014328	TAA	2	6	2330246	2330251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_014328	TATT	2	8	2330252	2330259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_014328	TA	3	6	2330308	2330313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_014328	ATT	2	6	2330346	2330351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_014328	CCT	2	6	2331794	2331799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_014328	ATTT	2	8	2331826	2331833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014328	T	6	6	2331831	2331836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_014328	T	7	7	2331859	2331865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_014328	ATA	2	6	2331873	2331878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_014328	A	7	7	2331928	2331934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014328	TTCA	2	8	2331935	2331942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_014328	A	7	7	2331951	2331957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014328	TA	3	6	2331958	2331963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_014328	AT	5	10	2331970	2331979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_014328	CTA	2	6	2331981	2331986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_014328	TA	3	6	2331985	2331990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_014328	ATT	2	6	2335112	2335117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_014328	TAC	2	6	2335200	2335205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_014328	CAT	2	6	2335210	2335215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_014328	TTAAA	2	10	2335224	2335233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_014328	T	6	6	2335876	2335881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_014328	CCT	2	6	2335882	2335887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_014328	A	7	7	2335892	2335898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_014328	T	6	6	2335899	2335904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_014328	ATTCA	2	10	2335965	2335974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10036	NC_014328	TTAT	2	8	2335975	2335982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_014328	ATT	2	6	2336029	2336034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_014328	TA	3	6	2336040	2336045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_014328	C	6	6	2337493	2337498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10040	NC_014328	TTAGT	2	10	2337505	2337514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_014328	TAA	3	9	2337584	2337592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_014328	AATTT	2	10	2337690	2337699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_014328	GCCA	2	8	2337786	2337793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_014328	ATT	2	6	2337797	2337802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_014328	CTA	2	6	2337826	2337831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_014328	CCT	2	6	2339406	2339411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_014328	T	6	6	2339449	2339454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_014328	TCCC	2	8	2340726	2340733	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10049	NC_014328	CA	3	6	2340778	2340783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_014328	AGC	2	6	2340848	2340853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_014328	TCC	2	6	2342971	2342976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_014328	ATA	2	6	2342987	2342992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_014328	A	6	6	2343023	2343028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_014328	TA	3	6	2343051	2343056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_014328	A	8	8	2343101	2343108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_014328	T	6	6	2343146	2343151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_014328	TAT	2	6	2343220	2343225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_014328	AATAT	2	10	2343226	2343235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_014328	CCT	2	6	2347311	2347316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_014328	ATT	2	6	2347331	2347336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_014328	TAAAT	2	10	2347358	2347367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_014328	AATA	2	8	2347392	2347399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_014328	TA	3	6	2347409	2347414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_014328	TGAT	2	8	2347479	2347486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_014328	TGC	2	6	2347502	2347507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_014328	AAT	2	6	2347513	2347518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_014328	CAG	2	6	2347523	2347528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_014328	T	6	6	2348717	2348722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_014328	TAA	2	6	2349605	2349610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014328	TCC	2	6	2350848	2350853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_014328	AT	3	6	2350865	2350870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_014328	T	6	6	2350924	2350929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_014328	TTA	2	6	2352037	2352042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014328	TAAA	2	8	2352053	2352060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_014328	T	6	6	2352070	2352075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_014328	AT	3	6	2352086	2352091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_014328	T	8	8	2352091	2352098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_014328	T	6	6	2352176	2352181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_014328	TAAATT	2	12	2355479	2355490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_014328	TAT	2	6	2355503	2355508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_014328	ATAA	2	8	2355512	2355519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_014328	A	7	7	2355539	2355545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_014328	CA	3	6	2355579	2355584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_014328	AGATG	2	10	2355628	2355637	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_014328	CTC	2	6	2355661	2355666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_014328	TAA	2	6	2355699	2355704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014328	TTATAC	2	12	2356310	2356321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10088	NC_014328	TAT	2	6	2356322	2356327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_014328	T	6	6	2356338	2356343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_014328	A	6	6	2356437	2356442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_014328	GCA	2	6	2356475	2356480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_014328	TCC	2	6	2357946	2357951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_014328	TCC	2	6	2359182	2359187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_014328	CTTA	2	8	2359213	2359220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10095	NC_014328	GTAG	2	8	2359365	2359372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_014328	TAT	2	6	2363062	2363067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_014328	TAA	2	6	2363145	2363150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014328	AATT	2	8	2363155	2363162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_014328	TGT	2	6	2363169	2363174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_014328	TTA	2	6	2363263	2363268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_014328	TAA	2	6	2363273	2363278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_014328	TATTT	2	10	2363285	2363294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014328	T	7	7	2363306	2363312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_014328	TCA	2	6	2363317	2363322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_014328	TAT	2	6	2365522	2365527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_014328	A	6	6	2365531	2365536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_014328	AT	3	6	2365542	2365547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_014328	TTA	2	6	2365549	2365554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_014328	ACAT	2	8	2365560	2365567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_014328	A	8	8	2365588	2365595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_014328	AATGAT	2	12	2365641	2365652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_014328	ATT	2	6	2365918	2365923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_014328	AAT	2	6	2365924	2365929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_014328	GAG	2	6	2365944	2365949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_014328	CCT	2	6	2368292	2368297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_014328	AATTT	2	10	2368347	2368356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_014328	CTG	2	6	2369202	2369207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_014328	AAATAC	2	12	2369222	2369233	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10119	NC_014328	TAAA	2	8	2370944	2370951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_014328	TATT	2	8	2370956	2370963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_014328	CTC	2	6	2370977	2370982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_014328	TGA	2	6	2372019	2372024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014328	CTAC	2	8	2372025	2372032	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_014328	TAAG	2	8	2372125	2372132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_014328	CTA	2	6	2372194	2372199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_014328	TA	3	6	2372217	2372222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_014328	A	6	6	2372248	2372253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_014328	A	7	7	2372280	2372286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_014328	T	8	8	2372310	2372317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_014328	C	6	6	2374839	2374844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10131	NC_014328	A	6	6	2377771	2377776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10133	NC_014328	ATT	2	6	2377866	2377871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10399	NC_014328	ATT	2	6	2432071	2432076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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