MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014328	CACT	2	8	70283	70290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_014328	T	7	7	70355	70361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014328	ATT	2	6	70375	70380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014328	TTA	2	6	70392	70397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014328	A	6	6	70401	70406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014328	TAT	2	6	70417	70422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014328	TCACC	2	10	70425	70434	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
508	NC_014328	TTA	2	6	70438	70443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014328	TAATA	2	10	70484	70493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014328	AAATA	2	10	70558	70567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014328	TTTA	2	8	71486	71493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014328	AAT	2	6	71527	71532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014328	AAT	2	6	71542	71547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014328	AAC	2	6	71573	71578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014328	TA	3	6	71625	71630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014328	TC	3	6	72233	72238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_014328	AT	3	6	73827	73832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014328	TCC	2	6	74184	74189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_014328	AT	3	6	74214	74219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014328	ATT	2	6	74231	74236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014328	A	8	8	74241	74248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014328	ATT	2	6	74255	74260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014328	TAA	2	6	74269	74274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014328	TA	4	8	74292	74299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014328	AGC	2	6	74324	74329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014328	CTC	2	6	74360	74365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_014328	ATATT	2	10	74390	74399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014328	TTTAT	2	10	74409	74418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014328	T	6	6	74433	74438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014328	TATATT	2	12	74456	74467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014328	TTAT	2	8	74468	74475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014328	AATA	2	8	74499	74506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014328	GA	3	6	74970	74975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014328	CT	3	6	75050	75055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_014328	CCA	2	6	75059	75064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_014328	GTA	2	6	75131	75136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014328	TA	3	6	79572	79577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014328	T	6	6	79710	79715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014328	ATT	2	6	79733	79738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014328	TTG	2	6	79760	79765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014328	TGG	2	6	79766	79771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014328	ATTT	2	8	79798	79805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014328	GA	3	6	79822	79827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014328	GT	3	6	79862	79867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014328	CT	3	6	79899	79904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_014328	GGAA	2	8	80080	80087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014328	TAA	2	6	80191	80196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014328	T	6	6	80229	80234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014328	AT	3	6	80260	80265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014328	GAAG	2	8	80266	80273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014328	GAG	2	6	82009	82014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014328	TAA	2	6	83048	83053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014328	ATT	2	6	83079	83084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014328	AGG	2	6	83102	83107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014328	TTA	2	6	83431	83436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014328	T	6	6	83440	83445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014328	T	6	6	83484	83489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014328	GAG	2	6	83517	83522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014328	TTA	2	6	83812	83817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014328	T	6	6	83833	83838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014328	GGT	2	6	83844	83849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014328	A	7	7	84589	84595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014328	TAT	2	6	84596	84601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014328	AT	4	8	84606	84613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014328	TAAT	2	8	84643	84650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014328	AT	3	6	84649	84654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014328	TATT	2	8	84671	84678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014328	AGG	2	6	84686	84691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014328	GCT	2	6	84696	84701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014328	GT	3	6	84712	84717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014328	AGG	2	6	85277	85282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014328	TAT	2	6	85986	85991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014328	GAG	2	6	85997	86002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014328	ACT	2	6	86005	86010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014328	ATT	2	6	86020	86025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014328	TAT	2	6	86064	86069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014328	T	6	6	86900	86905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014328	AAT	2	6	86914	86919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014328	GAGT	2	8	86940	86947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014328	TTA	2	6	87352	87357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014328	ATT	2	6	87361	87366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014328	T	6	6	87365	87370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014328	TA	3	6	87410	87415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014328	ATA	3	9	87413	87421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014328	ATT	2	6	87453	87458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014328	AG	3	6	87492	87497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014328	ATT	2	6	87550	87555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014328	ATG	2	6	87556	87561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014328	AAT	2	6	87562	87567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014328	GA	3	6	87590	87595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014328	TTATA	2	10	87597	87606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014328	TA	4	8	87603	87610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014328	TAA	2	6	87613	87618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014328	T	6	6	87666	87671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014328	ATT	2	6	87728	87733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014328	TAG	2	6	87746	87751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014328	GTA	2	6	87762	87767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014328	ATT	2	6	87825	87830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014328	ATG	2	6	87831	87836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014328	AAT	2	6	87837	87842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014328	TAT	3	9	87875	87883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014328	CAA	2	6	87887	87892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014328	T	6	6	87942	87947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014328	ACA	2	6	87948	87953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_014328	ATT	2	6	87998	88003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014328	TAAA	2	8	88007	88014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014328	ATA	2	6	91403	91408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014328	TAAA	2	8	91410	91417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014328	TTTA	2	8	91442	91449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014328	ATT	2	6	91458	91463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014328	GAA	2	6	91479	91484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014328	ATA	2	6	91505	91510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014328	T	6	6	91515	91520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014328	TAAT	2	8	91527	91534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014328	AATT	2	8	91577	91584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014328	GA	3	6	91621	91626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014328	TA	3	6	92656	92661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014328	A	6	6	92661	92666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014328	AAAT	2	8	92672	92679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014328	ATT	2	6	92721	92726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014328	TAT	2	6	92730	92735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014328	TAA	2	6	92755	92760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014328	A	6	6	92777	92782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014328	TA	3	6	92802	92807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014328	A	7	7	92821	92827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014328	GAT	2	6	92850	92855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014328	AGC	2	6	92968	92973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014328	A	6	6	92975	92980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014328	TAA	2	6	92990	92995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014328	GGC	2	6	93053	93058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_014328	GCG	2	6	93109	93114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014328	ACCT	2	8	93138	93145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_014328	ATA	2	6	93187	93192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014328	CGA	2	6	93289	93294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_014328	GA	3	6	93336	93341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014328	GCA	2	6	93363	93368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_014328	GCA	2	6	93403	93408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_014328	CGC	2	6	93410	93415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_014328	GTGA	2	8	93416	93423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014328	AGG	2	6	93479	93484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014328	CAG	2	6	93506	93511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014328	GAG	2	6	93651	93656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
643	NC_014328	GAA	2	6	93698	93703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_014328	AGG	2	6	93821	93826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_014328	GAA	2	6	93961	93966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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924	NC_014328	ATA	2	6	130657	130662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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962	NC_014328	GGA	2	6	132624	132629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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