MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 3361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	TA	3	6	65	70	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014109	AT	3	6	121	126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014109	AAT	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014109	ATT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014109	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014109	ATGT	2	8	276	283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014109	T	6	6	283	288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014109	A	6	6	296	301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014109	TTATT	2	10	308	317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014109	AACT	2	8	320	327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014109	A	7	7	341	347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014109	T	6	6	361	366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014109	T	6	6	372	377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014109	A	7	7	388	394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014109	T	8	8	533	540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014109	AT	3	6	558	563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	AAATT	2	10	571	580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	A	7	7	598	604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	TCAA	2	8	622	629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014109	ATA	3	9	664	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014109	ATA	2	6	690	695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014109	AT	3	6	1277	1282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014109	ATT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014109	T	8	8	1335	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014109	TAAA	2	8	1349	1356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014109	TA	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014109	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014109	TCAA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014109	TAG	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014109	A	7	7	1613	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014109	T	6	6	1661	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014109	A	6	6	1675	1680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014109	TAT	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014109	A	10	10	1713	1722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014109	TAG	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014109	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014109	AAG	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014109	GATC	2	8	1799	1806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014109	AGAT	2	8	1829	1836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014109	TAGG	2	8	1845	1852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014109	A	6	6	1865	1870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014109	A	6	6	1898	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014109	AAAAT	2	10	1915	1924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014109	T	9	9	1931	1939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014109	A	9	9	1940	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014109	T	6	6	2848	2853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014109	GCT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014109	GATC	2	8	3781	3788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014109	T	6	6	3905	3910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014109	TTGA	2	8	3923	3930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014109	TAA	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014109	TTG	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014109	ATT	3	9	3968	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014109	AAATAG	2	12	4002	4013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014109	AAAT	2	8	4081	4088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014109	GAA	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014109	TAT	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014109	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014109	T	8	8	4161	4168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014109	ATT	2	6	4172	4177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014109	GAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014109	A	6	6	4975	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014109	TCAG	2	8	6812	6819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014109	T	6	6	6821	6826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014109	T	6	6	6835	6840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014109	ACA	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014109	ATA	2	6	7749	7754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014109	TAAA	2	8	7847	7854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014109	ATCA	2	8	7860	7867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014109	A	7	7	7891	7897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014109	CT	3	6	7947	7952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014109	TCT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014109	A	7	7	8563	8569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014109	TAA	2	6	8571	8576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014109	ATT	2	6	8579	8584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014109	A	6	6	8586	8591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014109	TTAAA	2	10	8594	8603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014109	TAT	2	6	8619	8624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014109	AAT	2	6	8625	8630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014109	AT	3	6	8641	8646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014109	AAAT	2	8	8650	8657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014109	A	6	6	8670	8675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014109	A	7	7	8686	8692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014109	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014109	AG	3	6	9690	9695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014109	T	7	7	9745	9751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014109	TGAT	2	8	9775	9782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014109	TTTA	2	8	9788	9795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014109	ATT	2	6	9889	9894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014109	TGT	2	6	10793	10798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014109	A	6	6	10802	10807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014109	A	6	6	10816	10821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014109	CTGA	2	8	10823	10830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014109	T	6	6	12662	12667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014109	TTC	2	6	13348	13353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014109	TAT	2	6	13376	13381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014109	AAT	2	6	13465	13470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014109	A	8	8	13474	13481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014109	TAA	3	9	13511	13519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014109	TTC	2	6	13523	13528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014109	ATTT	2	8	13554	13561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014109	TCTATT	2	12	13628	13639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014109	AAT	3	9	13666	13674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014109	CAA	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014109	TAT	2	6	13701	13706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014109	ATCA	2	8	13711	13718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014109	A	6	6	14790	14795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014109	T	9	9	15695	15703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014109	A	9	9	15704	15712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014109	ATTTT	2	10	15719	15728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014109	T	6	6	15740	15745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014109	T	6	6	15773	15778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014109	CCTA	2	8	15791	15798	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014109	TATC	2	8	15806	15813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014109	GATC	2	8	15837	15844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014109	TCT	2	6	15870	15875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014109	ATT	2	6	15879	15884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014109	ACT	2	6	15904	15909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014109	T	10	10	15921	15930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014109	ATA	2	6	15931	15936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014109	T	6	6	15963	15968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014109	A	6	6	15977	15982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014109	T	7	7	16024	16030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014109	CTA	2	6	16036	16041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014109	TTGA	2	8	16047	16054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014109	GA	3	6	16148	16153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014109	AT	3	6	16166	16171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014109	TTTA	2	8	16287	16294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014109	A	8	8	16301	16308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014109	AT	3	6	16361	16366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014109	ATT	2	6	16975	16980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014109	ATTG	2	8	17016	17023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014109	T	7	7	17042	17048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014109	AATTT	2	10	17066	17075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014109	TA	3	6	17082	17087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014109	A	8	8	17106	17113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014109	T	7	7	17252	17258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014109	A	6	6	17269	17274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014109	A	6	6	17280	17285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014109	T	7	7	17299	17305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014109	AGTT	2	8	17319	17326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014109	AAATA	2	10	17328	17337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014109	T	6	6	17345	17350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014109	A	6	6	17358	17363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014109	CATA	2	8	17364	17371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014109	AAT	2	6	17461	17466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014109	ATT	2	6	17470	17475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014109	TCA	2	6	17476	17481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014109	AT	3	6	17520	17525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014109	TTC	2	6	17558	17563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014109	TA	3	6	17576	17581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014109	ATT	2	6	17652	17657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014109	T	6	6	17951	17956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014109	ATG	2	6	18141	18146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014109	GAAA	2	8	19334	19341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014109	T	8	8	20825	20832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014109	AAGA	3	12	20839	20850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014109	T	6	6	20903	20908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014109	TAAA	2	8	20953	20960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014109	AAT	2	6	20982	20987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014109	T	6	6	20987	20992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_014109	T	6	6	21054	21059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014109	ATT	2	6	21087	21092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_014109	GAA	2	6	22321	22326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_014109	GA	3	6	22547	22552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_014109	AG	3	6	22702	22707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014109	TGA	2	6	22754	22759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_014109	A	6	6	24182	24187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014109	CTT	2	6	24204	24209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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446	NC_014109	AT	3	6	53858	53863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_014109	A	6	6	54150	54155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014109	GATT	2	8	57639	57646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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