MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA plasmid pPAN

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013962	TCT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013962	GAA	2	6	22	27	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013962	GAAA	2	8	33	40	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013962	T	11	11	66	76	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013962	A	9	9	78	86	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013962	GGAT	2	8	2431	2438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013962	GAA	3	9	2442	2450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013962	TCCCT	2	10	2453	2462	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013962	CATC	2	8	2464	2471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013962	C	6	6	2471	2476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_013962	CTC	3	9	2486	2494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013962	ACT	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013962	AG	3	6	2594	2599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013962	TCCT	2	8	2672	2679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013962	TGA	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013962	ACT	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013962	AG	3	6	3772	3777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013962	TCCT	2	8	3850	3857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013962	TGA	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013962	ACT	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013962	AG	3	6	4950	4955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013962	TCCT	2	8	5028	5035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013962	TAA	2	6	5982	5987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013962	T	6	6	6014	6019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013962	T	8	8	6173	6180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013962	T	8	8	6192	6199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013962	A	7	7	6201	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013962	GTTT	2	8	6208	6215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013962	T	8	8	6213	6220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013962	GA	3	6	6223	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013962	A	7	7	6238	6244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013962	A	9	9	6250	6258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013962	T	7	7	6282	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013962	T	6	6	6294	6299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013962	A	6	6	6305	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013962	T	9	9	6316	6324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013962	A	7	7	6350	6356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013962	T	8	8	6384	6391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013962	AT	3	6	6394	6399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013962	A	7	7	6410	6416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013962	T	6	6	6417	6422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013962	T	15	15	6425	6439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013962	T	6	6	6536	6541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013962	A	12	12	6570	6581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013962	A	6	6	6594	6599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013962	TA	5	10	6608	6617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013962	A	6	6	6671	6676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013962	CTTA	2	8	6875	6882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013962	A	6	6	6891	6896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013962	TAAAT	2	10	6912	6921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013962	ACT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013962	ATTA	2	8	6945	6952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013962	ATA	2	6	6961	6966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013962	GTAAT	2	10	7008	7017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013962	CAG	2	6	7024	7029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013962	TGT	2	6	7038	7043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013962	GAAT	2	8	7059	7066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013962	ATA	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013962	TTA	2	6	7246	7251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013962	T	6	6	7590	7595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013962	A	7	7	7597	7603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013962	TCT	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013962	GAA	2	6	7650	7655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013962	GAAA	2	8	7661	7668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013962	T	11	11	7694	7704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013962	A	9	9	7706	7714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.