MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile R20291 chromosome

Total Repeats: 24859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18504	NC_013316	CTG	2	6	3022841	3022846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_013316	CCA	2	6	3022849	3022854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18506	NC_013316	TAT	2	6	3022857	3022862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_013316	TAC	2	6	3022863	3022868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_013316	CTT	2	6	3022869	3022874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18509	NC_013316	AAT	2	6	3022877	3022882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_013316	T	7	7	3022902	3022908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_013316	TA	3	6	3023897	3023902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_013316	TCC	2	6	3024494	3024499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18513	NC_013316	TA	3	6	3024519	3024524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18516	NC_013316	TTTAT	2	10	3025802	3025811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_013316	T	7	7	3025814	3025820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18519	NC_013316	ATT	2	6	3025867	3025872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18526	NC_013316	A	8	8	3027221	3027228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18531	NC_013316	A	7	7	3028778	3028784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_013316	TA	3	6	3028796	3028801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18544	NC_013316	TAA	2	6	3030467	3030472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18563	NC_013316	TAT	2	6	3033279	3033284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18584	NC_013316	ATTAA	2	10	3037011	3037020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18617	NC_013316	T	7	7	3042527	3042533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18633	NC_013316	TAT	2	6	3046092	3046097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18634	NC_013316	T	6	6	3046120	3046125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18635	NC_013316	TCC	2	6	3047024	3047029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18636	NC_013316	ATTT	2	8	3047082	3047089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18637	NC_013316	TCCT	2	8	3049025	3049032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18638	NC_013316	TAT	2	6	3049059	3049064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18639	NC_013316	TATAT	2	10	3049082	3049091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18640	NC_013316	TAAT	2	8	3049975	3049982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18641	NC_013316	CTA	2	6	3050013	3050018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18642	NC_013316	GTA	2	6	3050019	3050024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18643	NC_013316	T	6	6	3050050	3050055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18644	NC_013316	TAA	2	6	3050106	3050111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18645	NC_013316	TTTA	2	8	3050156	3050163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18646	NC_013316	AT	3	6	3050201	3050206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18647	NC_013316	A	6	6	3050225	3050230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18648	NC_013316	T	7	7	3050238	3050244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18649	NC_013316	AT	3	6	3050272	3050277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18650	NC_013316	AT	3	6	3050318	3050323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18651	NC_013316	TAA	2	6	3051244	3051249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18652	NC_013316	TAAAA	2	10	3051287	3051296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18653	NC_013316	A	7	7	3051293	3051299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18654	NC_013316	ACA	2	6	3051367	3051372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18655	NC_013316	T	7	7	3051422	3051428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18656	NC_013316	TA	3	6	3052353	3052358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18657	NC_013316	ACTTAA	2	12	3052359	3052370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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18659	NC_013316	ATTG	2	8	3052412	3052419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18660	NC_013316	AATTAT	2	12	3052433	3052444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18661	NC_013316	AT	4	8	3052451	3052458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18663	NC_013316	GTAT	2	8	3054501	3054508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18664	NC_013316	TAT	2	6	3056499	3056504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18665	NC_013316	ATA	2	6	3056526	3056531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18666	NC_013316	ATTGT	2	10	3056576	3056585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18667	NC_013316	CAC	2	6	3058922	3058927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18668	NC_013316	ATA	2	6	3058980	3058985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18669	NC_013316	T	7	7	3058986	3058992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18670	NC_013316	T	6	6	3059024	3059029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18671	NC_013316	ATT	2	6	3061593	3061598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18672	NC_013316	ATT	2	6	3061654	3061659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18673	NC_013316	TATCA	2	10	3061681	3061690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18674	NC_013316	TAT	2	6	3061691	3061696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18675	NC_013316	CAT	2	6	3061700	3061705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18678	NC_013316	TAT	2	6	3061734	3061739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18686	NC_013316	ATTT	2	8	3062196	3062203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18688	NC_013316	AT	3	6	3062292	3062297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18689	NC_013316	AAT	2	6	3063026	3063031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18690	NC_013316	A	6	6	3063119	3063124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18691	NC_013316	A	7	7	3063129	3063135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18696	NC_013316	AATG	2	8	3063309	3063316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18712	NC_013316	TGT	2	6	3064225	3064230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18730	NC_013316	CTCCC	2	10	3065697	3065706	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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18750	NC_013316	ATG	2	6	3066755	3066760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18752	NC_013316	TC	3	6	3066803	3066808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18753	NC_013316	ATG	2	6	3066825	3066830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18754	NC_013316	CACGA	2	10	3066880	3066889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18755	NC_013316	GAC	2	6	3066893	3066898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18757	NC_013316	TTC	2	6	3066983	3066988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18759	NC_013316	TCC	2	6	3067243	3067248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18760	NC_013316	CTCTC	2	10	3067287	3067296	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18761	NC_013316	TAC	2	6	3067327	3067332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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