MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile R20291 chromosome

Total Repeats: 24859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013316	GTA	2	6	2465665	2465670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_013316	TAAAT	2	10	2465738	2465747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_013316	ATT	2	6	2468016	2468021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_013316	TCTA	2	8	2470653	2470660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15505	NC_013316	TA	3	6	2471799	2471804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_013316	TACT	2	8	2471819	2471826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15507	NC_013316	CTTT	2	8	2471856	2471863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15508	NC_013316	CCCT	2	8	2473304	2473311	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15509	NC_013316	ATT	2	6	2473333	2473338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_013316	TAA	2	6	2473345	2473350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_013316	TA	3	6	2473351	2473356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_013316	TAATTT	2	12	2473411	2473422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_013316	T	6	6	2473470	2473475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_013316	ACT	2	6	2473476	2473481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_013316	T	6	6	2473522	2473527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_013316	ATT	2	6	2473528	2473533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_013316	TCTTG	2	10	2473535	2473544	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15518	NC_013316	ATT	2	6	2473571	2473576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_013316	AAT	2	6	2473622	2473627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_013316	TAC	2	6	2473646	2473651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_013316	TTTTAT	2	12	2473691	2473702	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_013316	TTACAA	2	12	2473735	2473746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15523	NC_013316	A	6	6	2473745	2473750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_013316	ATT	2	6	2473835	2473840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_013316	TAC	2	6	2473879	2473884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_013316	TA	3	6	2473888	2473893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_013316	AT	3	6	2473896	2473901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_013316	AT	3	6	2473907	2473912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_013316	TA	3	6	2473915	2473920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_013316	TTA	2	6	2473923	2473928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_013316	AG	3	6	2475322	2475327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_013316	TTA	2	6	2476004	2476009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_013316	TA	3	6	2476981	2476986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_013316	ATA	2	6	2477000	2477005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_013316	T	6	6	2477006	2477011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_013316	CCT	2	6	2478186	2478191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15537	NC_013316	TA	3	6	2478198	2478203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_013316	CAC	2	6	2478224	2478229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15539	NC_013316	AT	3	6	2478262	2478267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_013316	TATTTA	2	12	2478290	2478301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_013316	CTTT	2	8	2479695	2479702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15542	NC_013316	ATT	2	6	2479752	2479757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_013316	T	6	6	2479756	2479761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_013316	ATA	2	6	2479767	2479772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_013316	A	7	7	2479805	2479811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_013316	TTA	2	6	2479817	2479822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_013316	TAAG	2	8	2479827	2479834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_013316	ATTT	2	8	2479846	2479853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_013316	T	6	6	2479865	2479870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_013316	AATTA	2	10	2479893	2479902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_013316	TAA	2	6	2479911	2479916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_013316	TAT	2	6	2479917	2479922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_013316	AAT	2	6	2479929	2479934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_013316	ATA	2	6	2479967	2479972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_013316	AAT	2	6	2479973	2479978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_013316	AT	3	6	2479984	2479989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_013316	TTGAT	2	10	2480553	2480562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_013316	T	6	6	2481099	2481104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_013316	TAT	2	6	2481135	2481140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_013316	ATTT	2	8	2481168	2481175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_013316	TTA	2	6	2481176	2481181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_013316	CAAT	2	8	2481237	2481244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15563	NC_013316	TAA	2	6	2481248	2481253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_013316	TAAAT	2	10	2481258	2481267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_013316	AT	3	6	2481266	2481271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_013316	TAA	2	6	2481281	2481286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_013316	T	6	6	2482594	2482599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15569	NC_013316	TTATC	2	10	2482659	2482668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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15571	NC_013316	TAT	2	6	2482692	2482697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_013316	ATT	2	6	2482715	2482720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_013316	TA	3	6	2482731	2482736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_013316	A	6	6	2482736	2482741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15578	NC_013316	A	7	7	2482789	2482795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15581	NC_013316	TTAA	2	8	2482883	2482890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15599	NC_013316	TGCA	2	8	2487952	2487959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15602	NC_013316	A	6	6	2487978	2487983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_013316	TTA	2	6	2488000	2488005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15627	NC_013316	TA	4	8	2489038	2489045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_013316	TTACC	2	10	2489063	2489072	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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15630	NC_013316	T	7	7	2489150	2489156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15631	NC_013316	AT	3	6	2489167	2489172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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