MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile R20291 chromosome

Total Repeats: 24859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013316	A	6	6	2022735	2022740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_013316	GAT	2	6	2023740	2023745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_013316	TAAA	2	8	2023793	2023800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_013316	A	7	7	2023798	2023804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_013316	ATT	2	6	2023862	2023867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_013316	AAG	2	6	2023872	2023877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_013316	AAT	2	6	2023878	2023883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_013316	GGA	2	6	2023897	2023902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_013316	ATT	2	6	2024080	2024085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_013316	TA	3	6	2024087	2024092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_013316	TA	3	6	2024095	2024100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_013316	ATT	2	6	2024119	2024124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_013316	T	6	6	2024150	2024155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_013316	GTA	2	6	2024186	2024191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_013316	ATA	2	6	2029864	2029869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_013316	ATTTA	2	10	2029879	2029888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_013316	ATT	2	6	2029891	2029896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_013316	AGG	2	6	2029897	2029902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_013316	TA	4	8	2032141	2032148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_013316	TAA	2	6	2032188	2032193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_013316	AT	3	6	2032226	2032231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_013316	ATGATA	2	12	2032261	2032272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_013316	TTTA	2	8	2032273	2032280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_013316	TTA	2	6	2032289	2032294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_013316	A	6	6	2032317	2032322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_013316	TTA	2	6	2032326	2032331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_013316	ATTAT	2	10	2032353	2032362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_013316	GGT	2	6	2033894	2033899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_013316	T	6	6	2038367	2038372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_013316	ATAA	2	8	2038416	2038423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_013316	ATATT	2	10	2038467	2038476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_013316	ATT	2	6	2038478	2038483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_013316	TA	4	8	2038490	2038497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_013316	ATA	2	6	2038524	2038529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_013316	ATT	2	6	2038548	2038553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_013316	TTGAT	2	10	2038601	2038610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_013316	A	7	7	2038634	2038640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_013316	ATAAAA	2	12	2038712	2038723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_013316	A	6	6	2038727	2038732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_013316	TGA	2	6	2038786	2038791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_013316	TATAA	2	10	2038794	2038803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_013316	TCT	2	6	2038818	2038823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_013316	A	6	6	2038839	2038844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_013316	A	7	7	2038849	2038855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_013316	TTA	2	6	2038889	2038894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_013316	ATT	2	6	2038916	2038921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_013316	ATA	2	6	2038937	2038942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_013316	T	6	6	2038996	2039001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_013316	A	7	7	2039021	2039027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_013316	A	8	8	2039042	2039049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_013316	A	7	7	2039069	2039075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_013316	AAT	2	6	2039119	2039124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_013316	AT	3	6	2039123	2039128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_013316	ATA	2	6	2039162	2039167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_013316	ATAGAA	2	12	2039198	2039209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_013316	AGG	2	6	2039376	2039381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_013316	TAG	2	6	2039414	2039419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12559	NC_013316	CAA	2	6	2039480	2039485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_013316	ACA	2	6	2039497	2039502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_013316	AC	3	6	2039507	2039512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_013316	TAA	2	6	2039516	2039521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_013316	ATA	2	6	2039539	2039544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_013316	AT	3	6	2039552	2039557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_013316	AT	3	6	2039591	2039596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_013316	TTA	2	6	2039630	2039635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12575	NC_013316	ATT	2	6	2039951	2039956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12579	NC_013316	ATA	2	6	2040137	2040142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12582	NC_013316	ATA	2	6	2040314	2040319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_013316	T	6	6	2040346	2040351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12585	NC_013316	GTAT	2	8	2040522	2040529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12592	NC_013316	A	7	7	2041066	2041072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_013316	TGA	2	6	2041085	2041090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12596	NC_013316	TTA	2	6	2042199	2042204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12599	NC_013316	AAG	2	6	2042218	2042223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_013316	GGA	2	6	2042235	2042240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12602	NC_013316	GAA	2	6	2042325	2042330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_013316	A	6	6	2042349	2042354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_013316	TGA	2	6	2042386	2042391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12607	NC_013316	GATA	2	8	2042602	2042609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12610	NC_013316	TTC	2	6	2042796	2042801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_013316	GTA	2	6	2042837	2042842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_013316	TA	3	6	2042865	2042870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_013316	A	6	6	2042936	2042941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_013316	AT	3	6	2042953	2042958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_013316	TG	3	6	2043137	2043142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_013316	AGGGAG	2	12	2043321	2043332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12618	NC_013316	TCT	2	6	2043399	2043404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12621	NC_013316	AGA	2	6	2043472	2043477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_013316	GATA	2	8	2043499	2043506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_013316	GAA	2	6	2043526	2043531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_013316	AC	3	6	2043539	2043544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12625	NC_013316	AT	3	6	2043588	2043593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_013316	CTT	2	6	2043605	2043610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12629	NC_013316	AGG	2	6	2046269	2046274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12631	NC_013316	GCC	2	6	2046818	2046823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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