MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile R20291 chromosome

Total Repeats: 24859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_013316	TAAC	2	8	812764	812771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_013316	TATTAA	2	12	812772	812783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_013316	TAA	2	6	813629	813634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_013316	A	6	6	813633	813638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_013316	ATA	2	6	815812	815817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_013316	ATA	2	6	815822	815827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_013316	AAT	2	6	815853	815858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_013316	ATA	2	6	815859	815864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_013316	ATT	2	6	816273	816278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_013316	AAG	2	6	818308	818313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_013316	AT	3	6	820143	820148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_013316	TAA	2	6	820169	820174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_013316	TAA	2	6	821036	821041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_013316	T	7	7	821100	821106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_013316	TAA	2	6	821113	821118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_013316	AGG	2	6	821129	821134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013316	TAAT	2	8	822139	822146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_013316	ATG	2	6	822183	822188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_013316	ATT	2	6	822193	822198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_013316	GATG	2	8	822227	822234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013316	TTG	2	6	822250	822255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_013316	AT	3	6	822267	822272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_013316	A	6	6	822285	822290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013316	TTA	2	6	822357	822362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_013316	ATT	2	6	822372	822377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013316	TA	3	6	822392	822397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_013316	TCA	2	6	822420	822425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_013316	ATTA	2	8	822444	822451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_013316	TA	3	6	822450	822455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_013316	GTTAA	2	10	822487	822496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013316	A	6	6	822495	822500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013316	AGATA	2	10	822533	822542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_013316	ATA	2	6	822579	822584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013316	ATT	2	6	822606	822611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5538	NC_013316	A	6	6	822655	822660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_013316	ATT	2	6	822668	822673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_013316	AT	3	6	823455	823460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_013316	CA	3	6	823462	823467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_013316	AAAT	2	8	823492	823499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_013316	TAAA	2	8	823550	823557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_013316	ATA	3	9	823602	823610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_013316	AAT	2	6	823622	823627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_013316	ATCT	2	8	823642	823649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_013316	TA	3	6	823654	823659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_013316	TA	3	6	823668	823673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_013316	TAT	2	6	823719	823724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_013316	TA	3	6	824693	824698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_013316	TGT	2	6	824741	824746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_013316	A	6	6	824747	824752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_013316	TTTA	2	8	824759	824766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_013316	T	8	8	824771	824778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_013316	AT	3	6	824780	824785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_013316	AT	4	8	824788	824795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_013316	AAT	2	6	824833	824838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_013316	TA	3	6	824851	824856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5560	NC_013316	T	6	6	824911	824916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5563	NC_013316	TTA	2	6	825036	825041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_013316	A	6	6	825062	825067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_013316	ATA	2	6	825108	825113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_013316	TA	3	6	825160	825165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5570	NC_013316	A	6	6	825851	825856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_013316	ACAA	2	8	825871	825878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_013316	CAA	2	6	825922	825927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5580	NC_013316	A	6	6	826173	826178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_013316	A	6	6	827731	827736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_013316	AATT	2	8	833519	833526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_013316	T	6	6	833541	833546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_013316	AT	3	6	833594	833599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_013316	AT	3	6	833610	833615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_013316	ATA	2	6	833625	833630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_013316	TA	3	6	833629	833634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_013316	A	7	7	833644	833650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_013316	AT	3	6	834048	834053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_013316	TAAT	2	8	834068	834075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_013316	TAT	2	6	834104	834109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5639	NC_013316	TTA	2	6	840757	840762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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