MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19503	NC_013315	T	6	6	3287559	3287564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19504	NC_013315	TCC	2	6	3288891	3288896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19505	NC_013315	TTATT	2	10	3288897	3288906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19510	NC_013315	TTTA	2	8	3289372	3289379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_013315	AAAC	2	8	3289387	3289394	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19512	NC_013315	AT	3	6	3289405	3289410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19513	NC_013315	TTA	2	6	3289411	3289416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19515	NC_013315	TAT	2	6	3289456	3289461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_013315	AT	3	6	3289460	3289465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_013315	TAAT	2	8	3289497	3289504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_013315	AT	3	6	3289503	3289508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_013315	T	6	6	3289539	3289544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19521	NC_013315	TAT	2	6	3289599	3289604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19522	NC_013315	TA	4	8	3289612	3289619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19523	NC_013315	TAATA	2	10	3289629	3289638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19535	NC_013315	TATT	2	8	3297481	3297488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_013315	TAAA	2	8	3297489	3297496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_013315	TA	3	6	3297503	3297508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19541	NC_013315	AT	3	6	3298196	3298201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_013315	TAA	2	6	3298234	3298239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_013315	CCT	2	6	3299182	3299187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19544	NC_013315	ATT	2	6	3299198	3299203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_013315	TCTT	2	8	3299253	3299260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19547	NC_013315	TATT	2	8	3299336	3299343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19556	NC_013315	TA	3	6	3302074	3302079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19559	NC_013315	ATT	2	6	3302173	3302178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19574	NC_013315	TTA	2	6	3306956	3306961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_013315	ATTTTT	2	12	3306973	3306984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19597	NC_013315	A	7	7	3312327	3312333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19604	NC_013315	TCA	2	6	3312455	3312460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19613	NC_013315	TA	3	6	3312691	3312696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_013315	AATTA	2	10	3312697	3312706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19615	NC_013315	T	7	7	3312709	3312715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19620	NC_013315	ATT	2	6	3312766	3312771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19621	NC_013315	T	7	7	3312804	3312810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19622	NC_013315	TA	3	6	3312816	3312821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19631	NC_013315	ACATA	2	10	3313111	3313120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19632	NC_013315	T	6	6	3313152	3313157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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