MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_013315	ATCTTA	2	12	3180054	3180065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19002	NC_013315	TATT	2	8	3180076	3180083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_013315	T	7	7	3180101	3180107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_013315	CCT	2	6	3182185	3182190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19005	NC_013315	TAA	2	6	3182210	3182215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_013315	A	6	6	3182239	3182244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_013315	TAT	2	6	3182282	3182287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_013315	ATA	2	6	3182293	3182298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_013315	AAT	2	6	3182300	3182305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_013315	T	6	6	3182316	3182321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_013315	TAATT	2	10	3182328	3182337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_013315	ATT	2	6	3182358	3182363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_013315	AT	3	6	3182398	3182403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_013315	AT	3	6	3182453	3182458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_013315	AAT	2	6	3182459	3182464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_013315	A	6	6	3182514	3182519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_013315	CAT	2	6	3182520	3182525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_013315	ATA	2	6	3182550	3182555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_013315	ATA	2	6	3182574	3182579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_013315	AT	3	6	3182582	3182587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_013315	ATG	2	6	3183427	3183432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_013315	TA	4	8	3183440	3183447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_013315	ATG	2	6	3183456	3183461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_013315	TCC	2	6	3184021	3184026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19025	NC_013315	ATA	2	6	3184084	3184089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_013315	TAT	2	6	3184095	3184100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_013315	ATT	2	6	3184101	3184106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_013315	TAT	2	6	3184110	3184115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_013315	TCC	2	6	3186973	3186978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19030	NC_013315	CCT	2	6	3187384	3187389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19031	NC_013315	AT	3	6	3187424	3187429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_013315	AGC	2	6	3187475	3187480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_013315	CAT	2	6	3189141	3189146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_013315	ATA	2	6	3189173	3189178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_013315	GTAA	2	8	3189216	3189223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_013315	AT	3	6	3189235	3189240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_013315	CCT	2	6	3192014	3192019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19038	NC_013315	TTAA	2	8	3192031	3192038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_013315	AACA	2	8	3192064	3192071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19040	NC_013315	TA	3	6	3192073	3192078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_013315	AT	3	6	3192108	3192113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_013315	ATT	2	6	3192193	3192198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_013315	ATA	2	6	3192210	3192215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_013315	CATA	2	8	3192220	3192227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19045	NC_013315	TTTA	2	8	3193559	3193566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19046	NC_013315	ATA	2	6	3193621	3193626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_013315	ATA	2	6	3195557	3195562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_013315	TA	4	8	3195569	3195576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_013315	TTTAAT	2	12	3195592	3195603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_013315	A	6	6	3195630	3195635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19051	NC_013315	TCA	2	6	3195676	3195681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_013315	ATT	2	6	3195723	3195728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_013315	AAT	2	6	3195732	3195737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_013315	TA	3	6	3195762	3195767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_013315	TA	3	6	3195796	3195801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_013315	AGG	2	6	3196806	3196811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19057	NC_013315	ATA	2	6	3198298	3198303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_013315	TTCT	2	8	3198329	3198336	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19059	NC_013315	ATT	2	6	3198380	3198385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_013315	T	6	6	3198400	3198405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_013315	AAG	2	6	3198471	3198476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_013315	ATAA	2	8	3198479	3198486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_013315	ATAA	2	8	3198505	3198512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_013315	GA	3	6	3198557	3198562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_013315	GGA	2	6	3198590	3198595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19066	NC_013315	A	6	6	3200895	3200900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19067	NC_013315	AAT	2	6	3200914	3200919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_013315	AATTT	2	10	3200957	3200966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_013315	AAC	2	6	3203117	3203122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_013315	CCT	2	6	3205181	3205186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19072	NC_013315	ATTTTA	2	12	3205226	3205237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_013315	TTA	2	6	3205242	3205247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19074	NC_013315	CTA	2	6	3205285	3205290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19075	NC_013315	TAT	2	6	3206259	3206264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19076	NC_013315	TAT	2	6	3206299	3206304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19077	NC_013315	ATT	2	6	3206329	3206334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19078	NC_013315	TAAT	2	8	3206356	3206363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19079	NC_013315	TA	4	8	3206370	3206377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_013315	T	8	8	3206410	3206417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19081	NC_013315	ACACAA	2	12	3206427	3206438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19083	NC_013315	TAAA	2	8	3207011	3207018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19084	NC_013315	A	7	7	3207016	3207022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19085	NC_013315	TAA	2	6	3207032	3207037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19086	NC_013315	ATT	2	6	3207046	3207051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19087	NC_013315	T	6	6	3207063	3207068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19088	NC_013315	AAT	2	6	3207069	3207074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19089	NC_013315	ATTT	2	8	3209534	3209541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19090	NC_013315	TCC	2	6	3210878	3210883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19091	NC_013315	T	6	6	3211236	3211241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_013315	T	6	6	3211252	3211257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_013315	T	6	6	3211291	3211296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_013315	TA	3	6	3211304	3211309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_013315	TA	3	6	3211325	3211330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_013315	ATT	2	6	3211346	3211351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_013315	TA	3	6	3211364	3211369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_013315	TTTA	2	8	3211392	3211399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_013315	TTA	2	6	3212121	3212126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_013315	TA	3	6	3212138	3212143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_013315	TA	3	6	3212156	3212161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_013315	ATT	2	6	3213494	3213499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_013315	TTC	2	6	3213531	3213536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19104	NC_013315	AATT	2	8	3213546	3213553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_013315	ATTT	2	8	3213586	3213593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_013315	TA	3	6	3213597	3213602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_013315	TTGA	2	8	3213622	3213629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_013315	TAT	2	6	3213650	3213655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19109	NC_013315	AATATA	2	12	3213737	3213748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_013315	TCA	2	6	3213755	3213760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19111	NC_013315	CTTAA	2	10	3213776	3213785	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19112	NC_013315	TTTA	2	8	3213878	3213885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_013315	AAT	2	6	3213906	3213911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_013315	A	7	7	3213912	3213918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_013315	CA	3	6	3213961	3213966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19116	NC_013315	ATA	2	6	3213973	3213978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_013315	AT	3	6	3213984	3213989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_013315	AT	4	8	3214007	3214014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19119	NC_013315	AAT	2	6	3215213	3215218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19120	NC_013315	ATA	2	6	3215243	3215248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19121	NC_013315	TC	3	6	3218017	3218022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19122	NC_013315	TA	3	6	3218025	3218030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_013315	T	7	7	3218035	3218041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_013315	TCT	2	6	3218067	3218072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19125	NC_013315	ATT	2	6	3218090	3218095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_013315	AT	3	6	3219293	3219298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19127	NC_013315	AT	3	6	3219332	3219337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19128	NC_013315	A	6	6	3219373	3219378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19129	NC_013315	TC	3	6	3223257	3223262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19130	NC_013315	CCT	2	6	3223300	3223305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19131	NC_013315	TTA	2	6	3223311	3223316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19133	NC_013315	T	8	8	3225258	3225265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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