MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_013315	ACG	2	6	2983073	2983078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_013315	CTA	2	6	2983134	2983139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_013315	TGA	2	6	2983153	2983158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_013315	ACC	2	6	2983268	2983273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18005	NC_013315	CT	3	6	2983328	2983333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18006	NC_013315	TACG	2	8	2983349	2983356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18007	NC_013315	GA	3	6	2983372	2983377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_013315	TAC	2	6	2983483	2983488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_013315	GGT	2	6	2983492	2983497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_013315	GTA	2	6	2983563	2983568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_013315	TGT	2	6	2983667	2983672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_013315	GCC	2	6	2983762	2983767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18013	NC_013315	TGG	2	6	2983928	2983933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_013315	AAC	2	6	2983978	2983983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_013315	TC	3	6	2983987	2983992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18016	NC_013315	CTC	2	6	2984010	2984015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18017	NC_013315	CTA	2	6	2984097	2984102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_013315	CA	3	6	2984174	2984179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18019	NC_013315	GCTTA	2	10	2984193	2984202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18020	NC_013315	TC	3	6	2984221	2984226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18021	NC_013315	GTA	2	6	2984239	2984244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_013315	TGT	2	6	2984259	2984264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_013315	CAT	2	6	2984459	2984464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_013315	GTA	2	6	2984484	2984489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_013315	GCT	2	6	2984562	2984567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_013315	ACTTA	2	10	2984614	2984623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18027	NC_013315	TC	3	6	2984783	2984788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18028	NC_013315	CA	3	6	2985083	2985088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18029	NC_013315	CTCCC	2	10	2985139	2985148	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18030	NC_013315	GTA	2	6	2985199	2985204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_013315	GGT	2	6	2985218	2985223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_013315	CCT	2	6	2985225	2985230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18033	NC_013315	TCT	2	6	2985282	2985287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_013315	TGG	2	6	2985317	2985322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_013315	TCGC	2	8	2985417	2985424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18036	NC_013315	TTTC	2	8	2985444	2985451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18037	NC_013315	CTTC	2	8	2985453	2985460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18038	NC_013315	TAA	2	6	2985659	2985664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_013315	TA	3	6	2985735	2985740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_013315	AT	4	8	2985767	2985774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_013315	AGG	2	6	2985862	2985867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_013315	CGA	2	6	2985935	2985940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_013315	CTT	2	6	2985941	2985946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_013315	GTG	2	6	2985988	2985993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_013315	GT	3	6	2986003	2986008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_013315	GCA	2	6	2986033	2986038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_013315	TAC	2	6	2986154	2986159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_013315	GT	3	6	2986172	2986177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_013315	ATG	2	6	2986197	2986202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_013315	TCC	2	6	2986223	2986228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18051	NC_013315	TC	3	6	2986245	2986250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18052	NC_013315	ATG	2	6	2986267	2986272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_013315	CACGA	2	10	2986322	2986331	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18054	NC_013315	GAC	2	6	2986335	2986340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_013315	CAC	2	6	2986348	2986353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18056	NC_013315	TTC	2	6	2986425	2986430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_013315	AG	3	6	2986662	2986667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_013315	TCC	2	6	2986687	2986692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18059	NC_013315	CTCTC	2	10	2986731	2986740	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18060	NC_013315	TAC	2	6	2986771	2986776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_013315	GCT	2	6	2986876	2986881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_013315	TCC	2	6	2986903	2986908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18063	NC_013315	TCA	2	6	2986962	2986967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_013315	TGC	2	6	2986980	2986985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_013315	CTG	2	6	2987019	2987024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_013315	TCG	2	6	2987094	2987099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_013315	TTACC	2	10	2987113	2987122	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18068	NC_013315	AT	3	6	2987191	2987196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_013315	GT	3	6	2987232	2987237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_013315	CCG	2	6	2987271	2987276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18072	NC_013315	GTTT	2	8	2987412	2987419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_013315	TTCAT	2	10	2987458	2987467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18074	NC_013315	CTT	2	6	2987476	2987481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18075	NC_013315	CTT	2	6	2987501	2987506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18076	NC_013315	TAT	2	6	2987519	2987524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_013315	TCT	2	6	2987532	2987537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18078	NC_013315	ATA	2	6	2987539	2987544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_013315	T	7	7	2987555	2987561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_013315	T	9	9	2987564	2987572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18082	NC_013315	TAT	2	6	2987633	2987638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_013315	TAA	2	6	2987658	2987663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_013315	ATT	3	9	2987675	2987683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_013315	TAATA	2	10	2988683	2988692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18094	NC_013315	GTATA	2	10	2988863	2988872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_013315	ATT	2	6	2988882	2988887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18098	NC_013315	TAA	2	6	2988956	2988961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_013315	ATT	2	6	2990390	2990395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18104	NC_013315	AT	3	6	2990559	2990564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_013315	T	7	7	2992607	2992613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18107	NC_013315	TTA	2	6	2992657	2992662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18110	NC_013315	TAA	2	6	2992755	2992760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_013315	TA	3	6	2992769	2992774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_013315	CTC	2	6	2995640	2995645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18113	NC_013315	CTTTT	2	10	2995653	2995662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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18119	NC_013315	AT	3	6	2995887	2995892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_013315	ATAC	2	8	2995897	2995904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18122	NC_013315	TATTT	2	10	2995929	2995938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18125	NC_013315	TTA	2	6	2997213	2997218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_013315	ATTTT	2	10	2997224	2997233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_013315	TAT	3	9	2997276	2997284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_013315	CTTT	2	8	2997343	2997350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18129	NC_013315	ATA	2	6	2997367	2997372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18265	NC_013315	AAC	2	6	3030086	3030091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18266	NC_013315	TAA	2	6	3030107	3030112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18269	NC_013315	ATTT	2	8	3030174	3030181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18274	NC_013315	T	7	7	3030271	3030277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18288	NC_013315	TGTT	2	8	3032402	3032409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18303	NC_013315	T	6	6	3033086	3033091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18394	NC_013315	T	6	6	3064238	3064243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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