MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17503	NC_013315	CTTA	2	8	2890399	2890406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17504	NC_013315	AAT	2	6	2890436	2890441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_013315	TA	3	6	2890447	2890452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_013315	T	8	8	2890877	2890884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_013315	T	7	7	2890897	2890903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17508	NC_013315	ATT	2	6	2893024	2893029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_013315	TCT	2	6	2893042	2893047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17510	NC_013315	T	7	7	2893047	2893053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_013315	TAA	2	6	2893077	2893082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17512	NC_013315	A	7	7	2893111	2893117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17513	NC_013315	TTA	2	6	2893148	2893153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_013315	TAAA	2	8	2893184	2893191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_013315	TCA	2	6	2893200	2893205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_013315	TAC	2	6	2893220	2893225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17517	NC_013315	TA	3	6	2893234	2893239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_013315	TACA	2	8	2893252	2893259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17519	NC_013315	TAA	2	6	2893277	2893282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_013315	AT	3	6	2893296	2893301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17527	NC_013315	TA	4	8	2899573	2899580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_013315	TA	3	6	2899612	2899617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_013315	T	7	7	2899629	2899635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_013315	TA	3	6	2902030	2902035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_013315	CTATA	2	10	2902050	2902059	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17532	NC_013315	TTA	2	6	2902064	2902069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17537	NC_013315	TTC	2	6	2902245	2902250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17540	NC_013315	CT	3	6	2902280	2902285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17541	NC_013315	ATCTAT	2	12	2902320	2902331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17542	NC_013315	TA	3	6	2902354	2902359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_013315	T	6	6	2902397	2902402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_013315	CAA	2	6	2902419	2902424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17546	NC_013315	TAAT	2	8	2902441	2902448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17551	NC_013315	TAT	2	6	2904356	2904361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17554	NC_013315	T	6	6	2904432	2904437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_013315	AT	3	6	2904456	2904461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_013315	TA	3	6	2904514	2904519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_013315	AT	3	6	2904521	2904526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17561	NC_013315	TTTA	2	8	2907188	2907195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_013315	ATTT	3	12	2907217	2907228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17563	NC_013315	T	6	6	2907226	2907231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_013315	TA	4	8	2907235	2907242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17565	NC_013315	TAT	2	6	2907281	2907286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17569	NC_013315	ATGT	2	8	2907391	2907398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_013315	GATT	2	8	2907429	2907436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17571	NC_013315	TA	3	6	2907446	2907451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17610	NC_013315	AT	4	8	2914230	2914237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17611	NC_013315	TAAA	2	8	2914238	2914245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_013315	TA	3	6	2914268	2914273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_013315	TTA	2	6	2914275	2914280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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