MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_013315	TGG	2	6	2495750	2495755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_013315	CCA	2	6	2495782	2495787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15504	NC_013315	TTC	2	6	2495788	2495793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_013315	ATTT	2	8	2495815	2495822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_013315	AAT	2	6	2495829	2495834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_013315	TCTA	2	8	2495866	2495873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15508	NC_013315	TA	3	6	2495875	2495880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_013315	TA	3	6	2495903	2495908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_013315	T	7	7	2495931	2495937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_013315	AAT	2	6	2495949	2495954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_013315	AATG	2	8	2495961	2495968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_013315	TATT	2	8	2496000	2496007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_013315	TTC	2	6	2496050	2496055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_013315	TAA	2	6	2496056	2496061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15518	NC_013315	ATT	2	6	2496175	2496180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_013315	GT	3	6	2496203	2496208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_013315	ACAA	2	8	2496462	2496469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15521	NC_013315	AAT	2	6	2496483	2496488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_013315	TTC	2	6	2496905	2496910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_013315	TAA	2	6	2496921	2496926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_013315	T	7	7	2496990	2496996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_013315	ATA	2	6	2497006	2497011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15527	NC_013315	AATA	2	8	2497057	2497064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_013315	TAT	2	6	2497074	2497079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15531	NC_013315	AAAT	2	8	2497157	2497164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_013315	ATTTT	2	10	2497197	2497206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_013315	T	6	6	2497221	2497226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_013315	TAA	2	6	2497234	2497239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_013315	TA	3	6	2497240	2497245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_013315	TTA	2	6	2497284	2497289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_013315	ATT	2	6	2497307	2497312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15540	NC_013315	GTA	2	6	2497366	2497371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15542	NC_013315	ATT	2	6	2497426	2497431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_013315	ATA	2	6	2497467	2497472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_013315	ATA	2	6	2497574	2497579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_013315	T	7	7	2497602	2497608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_013315	TA	3	6	2497612	2497617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_013315	CAA	2	6	2497642	2497647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15549	NC_013315	TTA	2	6	2497664	2497669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_013315	TAA	2	6	2498204	2498209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_013315	TGA	2	6	2498214	2498219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_013315	A	6	6	2498246	2498251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_013315	AGAAT	2	10	2498262	2498271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_013315	T	6	6	2498313	2498318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_013315	GTT	2	6	2498360	2498365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15557	NC_013315	TAA	2	6	2498437	2498442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_013315	TAA	2	6	2498474	2498479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_013315	TTG	2	6	2498528	2498533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15563	NC_013315	T	6	6	2498700	2498705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15570	NC_013315	T	6	6	2498875	2498880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15575	NC_013315	T	6	6	2498955	2498960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_013315	ATTT	2	8	2498986	2498993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15582	NC_013315	TAT	2	6	2499507	2499512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15592	NC_013315	TATT	2	8	2501232	2501239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15598	NC_013315	TTA	2	6	2502049	2502054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_013315	AAT	2	6	2502076	2502081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15601	NC_013315	T	6	6	2502236	2502241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_013315	ATT	2	6	2502323	2502328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15605	NC_013315	GTAA	2	8	2502418	2502425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15609	NC_013315	ATTT	2	8	2502512	2502519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_013315	AATA	2	8	2502530	2502537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_013315	ATA	2	6	2502590	2502595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_013315	T	8	8	2502896	2502903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_013315	A	6	6	2502919	2502924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_013315	A	6	6	2502927	2502932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_013315	CAA	2	6	2502939	2502944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15618	NC_013315	AT	3	6	2503004	2503009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_013315	AT	3	6	2503054	2503059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_013315	TAATA	2	10	2503062	2503071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_013315	ATAC	2	8	2503113	2503120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15622	NC_013315	TCTT	2	8	2503121	2503128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15623	NC_013315	TAA	2	6	2503167	2503172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15625	NC_013315	ATA	2	6	2503226	2503231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15627	NC_013315	TTTAAA	2	12	2503288	2503299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_013315	TAA	2	6	2503314	2503319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_013315	AAAAT	2	10	2503326	2503335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15630	NC_013315	T	6	6	2503367	2503372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15631	NC_013315	ATA	2	6	2503384	2503389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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