MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013315	AT	3	6	2412089	2412094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_013315	TTG	2	6	2412099	2412104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_013315	A	9	9	2412182	2412190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_013315	GTA	2	6	2412253	2412258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_013315	ATA	2	6	2412276	2412281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_013315	TA	3	6	2412280	2412285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_013315	GA	3	6	2412292	2412297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_013315	ATTT	2	8	2412947	2412954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_013315	ACTTT	2	10	2412962	2412971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15011	NC_013315	AAT	2	6	2412972	2412977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_013315	TAT	2	6	2413008	2413013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_013315	AT	4	8	2413018	2413025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_013315	ACA	2	6	2413035	2413040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_013315	TAAA	2	8	2413042	2413049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_013315	TAA	2	6	2413068	2413073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_013315	TTACT	2	10	2413078	2413087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15018	NC_013315	TAT	2	6	2413091	2413096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_013315	TAT	2	6	2413112	2413117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_013315	ATT	3	9	2413154	2413162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_013315	AT	3	6	2413164	2413169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_013315	TA	3	6	2413170	2413175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_013315	T	6	6	2413192	2413197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_013315	A	7	7	2413201	2413207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15027	NC_013315	AAT	2	6	2413262	2413267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_013315	AT	3	6	2413296	2413301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_013315	TAA	2	6	2414194	2414199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15032	NC_013315	ATT	2	6	2414217	2414222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_013315	ATA	2	6	2414237	2414242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15035	NC_013315	TAT	2	6	2415160	2415165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_013315	T	6	6	2415186	2415191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_013315	A	7	7	2415201	2415207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15039	NC_013315	T	6	6	2415250	2415255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15041	NC_013315	AT	3	6	2415263	2415268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_013315	AT	3	6	2415319	2415324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15045	NC_013315	T	6	6	2417431	2417436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_013315	T	7	7	2417453	2417459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_013315	TA	3	6	2417471	2417476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_013315	AT	3	6	2417481	2417486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_013315	T	8	8	2417494	2417501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15051	NC_013315	AT	3	6	2417513	2417518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_013315	T	8	8	2417536	2417543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_013315	T	6	6	2417554	2417559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15058	NC_013315	AT	3	6	2418450	2418455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_013315	TACT	2	8	2421280	2421287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15062	NC_013315	T	7	7	2421398	2421404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_013315	TAT	2	6	2421413	2421418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_013315	TAT	2	6	2421468	2421473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15068	NC_013315	TAAAA	2	10	2421533	2421542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15073	NC_013315	TAA	2	6	2421616	2421621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15081	NC_013315	TA	3	6	2425635	2425640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_013315	TA	3	6	2425666	2425671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_013315	TAT	2	6	2425679	2425684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_013315	ATT	2	6	2425706	2425711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15086	NC_013315	AATTTT	2	12	2428179	2428190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15094	NC_013315	TA	3	6	2429034	2429039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_013315	T	6	6	2429048	2429053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_013315	T	7	7	2429078	2429084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_013315	TA	3	6	2429102	2429107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_013315	ACT	2	6	2429108	2429113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15101	NC_013315	TATAC	2	10	2429155	2429164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15102	NC_013315	AT	3	6	2431135	2431140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_013315	TATTT	2	10	2431146	2431155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_013315	TGT	2	6	2431165	2431170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_013315	T	6	6	2431170	2431175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_013315	TAT	2	6	2431216	2431221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_013315	TAT	2	6	2431230	2431235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_013315	AATTTA	2	12	2431240	2431251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15112	NC_013315	TATC	2	8	2431346	2431353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15113	NC_013315	AC	3	6	2431370	2431375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15114	NC_013315	AT	3	6	2431377	2431382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_013315	TAT	2	6	2432664	2432669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_013315	TAT	2	6	2432683	2432688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_013315	TA	3	6	2432713	2432718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_013315	TA	3	6	2432798	2432803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_013315	TAT	2	6	2432809	2432814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_013315	AT	3	6	2432813	2432818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15122	NC_013315	TTA	2	6	2434245	2434250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_013315	A	7	7	2434275	2434281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_013315	TA	3	6	2434294	2434299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_013315	ACC	2	6	2434329	2434334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15126	NC_013315	TACT	2	8	2434403	2434410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15127	NC_013315	TTC	2	6	2434442	2434447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_013315	CTCTT	2	10	2434510	2434519	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15129	NC_013315	TAT	2	6	2434536	2434541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_013315	CTA	2	6	2434544	2434549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_013315	TA	3	6	2434594	2434599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_013315	ATA	2	6	2434625	2434630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_013315	ATA	2	6	2434649	2434654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15134	NC_013315	CTT	2	6	2434672	2434677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15135	NC_013315	TAT	2	6	2434907	2434912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_013315	CAT	2	6	2434985	2434990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15137	NC_013315	TA	3	6	2435020	2435025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15138	NC_013315	T	7	7	2435063	2435069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_013315	ATTT	2	8	2435079	2435086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_013315	T	6	6	2435084	2435089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_013315	AATTA	2	10	2435126	2435135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15142	NC_013315	ATT	3	9	2440263	2440271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_013315	TA	3	6	2440310	2440315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15144	NC_013315	T	6	6	2440317	2440322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15145	NC_013315	AT	3	6	2440350	2440355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15146	NC_013315	A	6	6	2440357	2440362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15150	NC_013315	TTA	2	6	2442499	2442504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_013315	ATA	3	9	2442522	2442530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15152	NC_013315	TAT	2	6	2442547	2442552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15153	NC_013315	TAAA	2	8	2442569	2442576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15154	NC_013315	AT	4	8	2442628	2442635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15155	NC_013315	AAT	2	6	2442643	2442648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15158	NC_013315	TA	4	8	2442727	2442734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_013315	ATA	2	6	2442738	2442743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15166	NC_013315	ATT	2	6	2444112	2444117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15167	NC_013315	TA	3	6	2444131	2444136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15168	NC_013315	TAA	2	6	2444520	2444525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15179	NC_013315	ATT	2	6	2446126	2446131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15187	NC_013315	AAAT	2	8	2446273	2446280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15193	NC_013315	TA	3	6	2448559	2448564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15213	NC_013315	A	7	7	2453069	2453075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15215	NC_013315	TTAA	2	8	2453123	2453130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15241	NC_013315	A	8	8	2454213	2454220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15245	NC_013315	TAAA	2	8	2454395	2454402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15249	NC_013315	TAC	2	6	2454563	2454568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15251	NC_013315	TAG	2	6	2454587	2454592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_013315	T	6	6	2454610	2454615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15253	NC_013315	TAA	2	6	2454621	2454626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_013315	A	6	6	2454637	2454642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15255	NC_013315	CCT	2	6	2456488	2456493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15256	NC_013315	ATA	2	6	2456498	2456503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15257	NC_013315	AT	3	6	2456518	2456523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15258	NC_013315	TTA	2	6	2456537	2456542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15259	NC_013315	T	6	6	2456551	2456556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15260	NC_013315	TA	3	6	2456565	2456570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15261	NC_013315	T	7	7	2456633	2456639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15262	NC_013315	AAT	2	6	2456717	2456722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15263	NC_013315	A	7	7	2458125	2458131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15264	NC_013315	TAATAT	2	12	2458159	2458170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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