MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_013315	TCT	2	6	2328747	2328752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_013315	CAATT	2	10	2328766	2328775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14503	NC_013315	T	6	6	2328791	2328796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_013315	TTC	2	6	2328822	2328827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_013315	AT	3	6	2328889	2328894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_013315	AT	4	8	2328907	2328914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_013315	ATT	2	6	2328921	2328926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_013315	A	6	6	2328938	2328943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_013315	TATT	2	8	2328972	2328979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_013315	CAT	2	6	2328983	2328988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_013315	AT	3	6	2329018	2329023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_013315	TCT	2	6	2329073	2329078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_013315	CAAA	2	8	2329097	2329104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14514	NC_013315	A	8	8	2329102	2329109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_013315	ATT	2	6	2329160	2329165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_013315	CTTT	2	8	2330359	2330366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14517	NC_013315	TAAT	2	8	2330370	2330377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_013315	ATA	2	6	2330414	2330419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_013315	AAAT	2	8	2330428	2330435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_013315	AT	3	6	2330466	2330471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_013315	AT	3	6	2330486	2330491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_013315	TAA	2	6	2330492	2330497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_013315	ATTA	2	8	2330508	2330515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_013315	AAT	2	6	2330527	2330532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_013315	CAA	2	6	2330552	2330557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_013315	TTATT	2	10	2330558	2330567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_013315	TAT	2	6	2330609	2330614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_013315	TTAT	3	12	2330611	2330622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_013315	TTTGT	2	10	2330623	2330632	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_013315	ATTT	2	8	2330633	2330640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_013315	TTA	2	6	2330641	2330646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_013315	ATT	2	6	2330647	2330652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_013315	TA	3	6	2330679	2330684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_013315	ATTT	2	8	2330696	2330703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_013315	TA	3	6	2330704	2330709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_013315	T	9	9	2330711	2330719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_013315	ATTCT	2	10	2330732	2330741	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14538	NC_013315	AT	3	6	2330791	2330796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_013315	AGG	2	6	2330803	2330808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_013315	TA	3	6	2331862	2331867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_013315	AAT	2	6	2331892	2331897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_013315	ATTTTT	2	12	2331906	2331917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_013315	TAC	2	6	2331956	2331961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_013315	TAT	2	6	2331962	2331967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_013315	TAT	2	6	2332000	2332005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_013315	TA	3	6	2332010	2332015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_013315	TTC	2	6	2332031	2332036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_013315	TTG	2	6	2332043	2332048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_013315	TTAAA	2	10	2332049	2332058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_013315	TAAT	2	8	2332137	2332144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_013315	CTTTT	2	10	2332147	2332156	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14552	NC_013315	T	6	6	2332184	2332189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_013315	AGG	2	6	2332225	2332230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_013315	GGT	2	6	2332489	2332494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_013315	TAA	2	6	2333727	2333732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_013315	TA	3	6	2336222	2336227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_013315	TTAT	2	8	2336228	2336235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_013315	TAG	2	6	2336252	2336257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_013315	AGGG	2	8	2336283	2336290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_013315	T	7	7	2336781	2336787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_013315	ATC	2	6	2338129	2338134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_013315	TAAA	2	8	2338142	2338149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_013315	ATT	2	6	2338163	2338168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_013315	TA	3	6	2338203	2338208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_013315	AT	3	6	2338241	2338246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_013315	AT	3	6	2338285	2338290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_013315	ATT	2	6	2338311	2338316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_013315	A	6	6	2338321	2338326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_013315	CTATT	2	10	2338336	2338345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14570	NC_013315	AAT	2	6	2338364	2338369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_013315	ATT	2	6	2338382	2338387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_013315	AAT	2	6	2339250	2339255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_013315	T	6	6	2339267	2339272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_013315	T	6	6	2339275	2339280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_013315	AATA	2	8	2340313	2340320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_013315	CAAA	2	8	2340363	2340370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14577	NC_013315	A	6	6	2340368	2340373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_013315	A	6	6	2340376	2340381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_013315	TAA	2	6	2340406	2340411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_013315	TCC	2	6	2341365	2341370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14581	NC_013315	CTA	2	6	2341384	2341389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_013315	T	6	6	2341393	2341398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_013315	ATATA	2	10	2341399	2341408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_013315	ACT	2	6	2342641	2342646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_013315	AAGCT	2	10	2342669	2342678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14586	NC_013315	TAATT	2	10	2342679	2342688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_013315	TAT	2	6	2342710	2342715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_013315	TCT	2	6	2342725	2342730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14589	NC_013315	TAT	2	6	2342779	2342784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_013315	CTTA	2	8	2342808	2342815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14591	NC_013315	TA	3	6	2342822	2342827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_013315	ATT	2	6	2342894	2342899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14595	NC_013315	TAA	2	6	2342994	2342999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_013315	CTT	2	6	2343036	2343041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_013315	T	6	6	2343076	2343081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_013315	ATT	3	9	2343132	2343140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_013315	TA	4	8	2343141	2343148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_013315	TAA	2	6	2343195	2343200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_013315	TTA	2	6	2343201	2343206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_013315	ATA	2	6	2343215	2343220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_013315	CATT	2	8	2343227	2343234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14604	NC_013315	AG	3	6	2343238	2343243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_013315	T	6	6	2343258	2343263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_013315	TAAA	2	8	2343288	2343295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_013315	ATA	2	6	2343305	2343310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_013315	TTCT	2	8	2344369	2344376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14609	NC_013315	TTTTAA	2	12	2344450	2344461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14611	NC_013315	AAATT	2	10	2345625	2345634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_013315	TAA	2	6	2345666	2345671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_013315	ATT	2	6	2345680	2345685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14615	NC_013315	T	7	7	2345711	2345717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_013315	TAA	2	6	2345744	2345749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_013315	TAAA	2	8	2346727	2346734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_013315	TTTA	2	8	2346741	2346748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_013315	AAG	2	6	2346755	2346760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_013315	TAA	2	6	2346766	2346771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_013315	TAT	2	6	2346781	2346786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_013315	AAT	2	6	2347784	2347789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_013315	TA	4	8	2347800	2347807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_013315	TAAAA	2	10	2347876	2347885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_013315	TA	3	6	2347886	2347891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_013315	TA	3	6	2347898	2347903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_013315	TAT	2	6	2347910	2347915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14630	NC_013315	TAAA	2	8	2347984	2347991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_013315	GTC	2	6	2347994	2347999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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