MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013315	TAT	2	6	2256374	2256379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_013315	TTA	2	6	2256400	2256405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_013315	ATTT	2	8	2256410	2256417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_013315	T	7	7	2256415	2256421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_013315	T	8	8	2256435	2256442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_013315	ATA	2	6	2256451	2256456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_013315	A	7	7	2256471	2256477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_013315	T	6	6	2256503	2256508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_013315	A	6	6	2256545	2256550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_013315	TA	3	6	2257626	2257631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_013315	TAA	2	6	2257689	2257694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_013315	TAT	2	6	2257695	2257700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_013315	AAAAC	2	10	2257704	2257713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14014	NC_013315	TAA	2	6	2257715	2257720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_013315	GATA	2	8	2257747	2257754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_013315	TTC	2	6	2257759	2257764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_013315	AAT	2	6	2257820	2257825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_013315	TTA	2	6	2257850	2257855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_013315	T	6	6	2257858	2257863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_013315	TAC	2	6	2257865	2257870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_013315	TA	3	6	2257887	2257892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_013315	TAA	2	6	2261890	2261895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_013315	TAA	2	6	2262927	2262932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_013315	AATT	2	8	2262940	2262947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_013315	A	7	7	2263495	2263501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_013315	TAA	2	6	2263503	2263508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_013315	TTTAT	2	10	2263515	2263524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_013315	ATT	2	6	2263565	2263570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_013315	TAT	2	6	2263600	2263605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_013315	ATA	2	6	2263611	2263616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_013315	TA	5	10	2263633	2263642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_013315	AT	3	6	2263645	2263650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_013315	TA	3	6	2263662	2263667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_013315	TTAA	2	8	2263693	2263700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_013315	A	6	6	2263708	2263713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14037	NC_013315	CAT	2	6	2264065	2264070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_013315	ATA	2	6	2264107	2264112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_013315	TAA	2	6	2264116	2264121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_013315	TTA	2	6	2264126	2264131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_013315	GTT	2	6	2264161	2264166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_013315	ATAA	2	8	2264194	2264201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_013315	TCC	2	6	2267713	2267718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14044	NC_013315	CAA	2	6	2267766	2267771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_013315	ATA	2	6	2267778	2267783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_013315	A	7	7	2267824	2267830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_013315	AAT	2	6	2267841	2267846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_013315	CAT	2	6	2267847	2267852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14050	NC_013315	TA	3	6	2269224	2269229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_013315	CA	3	6	2269237	2269242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14052	NC_013315	ATCA	2	8	2269253	2269260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14053	NC_013315	T	8	8	2269261	2269268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_013315	TA	3	6	2269313	2269318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_013315	T	6	6	2269328	2269333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_013315	TTA	2	6	2269339	2269344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_013315	TA	5	10	2269371	2269380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_013315	T	6	6	2269387	2269392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_013315	TCC	2	6	2269427	2269432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14060	NC_013315	TA	4	8	2269471	2269478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_013315	T	6	6	2269479	2269484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_013315	T	7	7	2269528	2269534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_013315	TCTAT	2	10	2269539	2269548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14064	NC_013315	TTAC	2	8	2269572	2269579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14065	NC_013315	TAT	2	6	2269606	2269611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_013315	TTA	2	6	2269715	2269720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_013315	A	6	6	2269745	2269750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_013315	AATAT	2	10	2269763	2269772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_013315	TA	4	8	2269793	2269800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_013315	ATT	2	6	2269812	2269817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_013315	T	6	6	2270919	2270924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_013315	TAC	2	6	2270944	2270949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_013315	TAT	2	6	2270956	2270961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14075	NC_013315	A	6	6	2272638	2272643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14079	NC_013315	ATT	2	6	2273583	2273588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_013315	AATA	2	8	2274756	2274763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_013315	ACA	2	6	2274771	2274776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_013315	ATC	2	6	2274798	2274803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14084	NC_013315	TTTAT	2	10	2274828	2274837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_013315	ATTAA	2	10	2274838	2274847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_013315	ATA	2	6	2274856	2274861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_013315	AAC	2	6	2276243	2276248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_013315	CCT	2	6	2276250	2276255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14092	NC_013315	TTAA	2	8	2276331	2276338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_013315	ATA	2	6	2276343	2276348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14095	NC_013315	TA	3	6	2276465	2276470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_013315	AT	3	6	2276484	2276489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_013315	TA	3	6	2276493	2276498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_013315	TTA	2	6	2276543	2276548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_013315	ATTATA	2	12	2276556	2276567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_013315	A	7	7	2276581	2276587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_013315	ATTT	2	8	2276607	2276614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_013315	TAA	2	6	2276652	2276657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_013315	TAA	2	6	2276660	2276665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_013315	T	7	7	2276666	2276672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14108	NC_013315	ATA	2	6	2279535	2279540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_013315	ATT	2	6	2279546	2279551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_013315	TA	3	6	2279580	2279585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_013315	ACT	2	6	2279608	2279613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_013315	ATA	2	6	2279622	2279627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_013315	TCTT	2	8	2280321	2280328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14114	NC_013315	TTA	2	6	2280334	2280339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_013315	TA	3	6	2280338	2280343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_013315	TAT	2	6	2280353	2280358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_013315	T	6	6	2280379	2280384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_013315	T	6	6	2280386	2280391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_013315	ATT	2	6	2280392	2280397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_013315	CTT	2	6	2280410	2280415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_013315	T	7	7	2280426	2280432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_013315	AT	3	6	2280449	2280454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_013315	A	6	6	2280461	2280466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_013315	ATTAA	2	10	2280479	2280488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_013315	AT	3	6	2280515	2280520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_013315	TA	3	6	2281348	2281353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_013315	TATAAA	2	12	2281369	2281380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_013315	ATTT	2	8	2281422	2281429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_013315	T	6	6	2281445	2281450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_013315	TAAA	2	8	2281558	2281565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_013315	AAT	2	6	2281602	2281607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14133	NC_013315	TAAAT	2	10	2281984	2281993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_013315	T	6	6	2281995	2282000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14143	NC_013315	T	6	6	2282192	2282197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14151	NC_013315	ATTTA	2	10	2284325	2284334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14165	NC_013315	TCT	2	6	2287256	2287261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14261	NC_013315	AT	3	6	2296222	2296227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_013315	AT	5	10	2296244	2296253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_013315	T	6	6	2296263	2296268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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