MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_013315	ATA	2	6	1302370	1302375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_013315	TAA	3	9	1302383	1302391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_013315	AT	3	6	1302456	1302461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_013315	CT	3	6	1302474	1302479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_013315	CTT	2	6	1302491	1302496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_013315	T	6	6	1302495	1302500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_013315	ATTA	2	8	1302501	1302508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_013315	ATATT	2	10	1302531	1302540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_013315	TGAT	2	8	1302551	1302558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_013315	TAT	2	6	1302566	1302571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_013315	TAA	2	6	1302626	1302631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_013315	AACTAA	2	12	1302646	1302657	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8014	NC_013315	GAT	2	6	1302678	1302683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_013315	TAG	2	6	1302769	1302774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_013315	ACT	2	6	1302789	1302794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_013315	TAGA	2	8	1302803	1302810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_013315	T	7	7	1302870	1302876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_013315	ATG	3	9	1302923	1302931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_013315	AGA	2	6	1302963	1302968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_013315	AGA	3	9	1302987	1302995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_013315	TGA	2	6	1302999	1303004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_013315	TAA	2	6	1303006	1303011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_013315	TA	3	6	1303092	1303097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_013315	ATT	2	6	1303108	1303113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_013315	A	6	6	1303132	1303137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_013315	AAT	2	6	1303145	1303150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_013315	AT	3	6	1303169	1303174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_013315	TAC	2	6	1303179	1303184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_013315	AGA	2	6	1303245	1303250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_013315	TAT	2	6	1303279	1303284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_013315	TAA	2	6	1303290	1303295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_013315	AAT	2	6	1303296	1303301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_013315	AAT	2	6	1303304	1303309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_013315	AGG	2	6	1303316	1303321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_013315	TAA	2	6	1303322	1303327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_013315	TA	3	6	1303845	1303850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_013315	ATT	2	6	1303893	1303898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_013315	TA	3	6	1303916	1303921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_013315	TCC	2	6	1304142	1304147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_013315	ATT	2	6	1304155	1304160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_013315	AT	3	6	1304165	1304170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_013315	AAT	2	6	1304193	1304198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_013315	TAT	2	6	1304235	1304240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_013315	TAA	2	6	1304250	1304255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_013315	A	7	7	1304254	1304260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_013315	A	6	6	1304288	1304293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_013315	TAT	2	6	1304297	1304302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_013315	TAT	2	6	1304322	1304327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_013315	TCA	2	6	1304331	1304336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8052	NC_013315	A	6	6	1304400	1304405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_013315	TTTG	2	8	1304419	1304426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_013315	ATTT	2	8	1304441	1304448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_013315	TTTGA	2	10	1304455	1304464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_013315	TAA	3	9	1304472	1304480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_013315	A	6	6	1304491	1304496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_013315	TGA	2	6	1304500	1304505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8060	NC_013315	TA	4	8	1304562	1304569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_013315	ATT	2	6	1304610	1304615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_013315	AATA	2	8	1304622	1304629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_013315	TA	6	12	1304628	1304639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_013315	AGT	2	6	1304660	1304665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8066	NC_013315	CTT	2	6	1304680	1304685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_013315	T	8	8	1304727	1304734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_013315	TAAT	2	8	1304833	1304840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_013315	ATC	2	6	1304864	1304869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_013315	ATT	2	6	1304885	1304890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_013315	TA	3	6	1304903	1304908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_013315	CTA	2	6	1304911	1304916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8074	NC_013315	TCT	2	6	1304994	1304999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_013315	TAA	2	6	1305109	1305114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_013315	AAT	2	6	1305115	1305120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_013315	AT	3	6	1305145	1305150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_013315	AATTTA	2	12	1305189	1305200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_013315	TGT	2	6	1305207	1305212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_013315	GAA	2	6	1305231	1305236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_013315	ATT	2	6	1305237	1305242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_013315	AATA	2	8	1305276	1305283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_013315	TA	3	6	1305301	1305306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_013315	GT	3	6	1305480	1305485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_013315	TA	3	6	1305491	1305496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_013315	GAA	2	6	1305504	1305509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_013315	A	6	6	1305550	1305555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_013315	TA	4	8	1305572	1305579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_013315	ATT	2	6	1305584	1305589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_013315	TA	3	6	1307689	1307694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_013315	ATA	2	6	1307700	1307705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_013315	ATA	3	9	1307742	1307750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_013315	A	6	6	1307896	1307901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_013315	ATTT	2	8	1307908	1307915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_013315	TA	3	6	1308502	1308507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_013315	TAA	2	6	1308523	1308528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_013315	AT	3	6	1308535	1308540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_013315	TA	4	8	1308553	1308560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_013315	A	6	6	1308560	1308565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_013315	ATG	2	6	1309065	1309070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8109	NC_013315	TAT	2	6	1309120	1309125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_013315	ATA	2	6	1309915	1309920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_013315	TGT	2	6	1309958	1309963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_013315	TAA	2	6	1311040	1311045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_013315	GA	3	6	1311052	1311057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8116	NC_013315	GTT	2	6	1315957	1315962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_013315	GTAAA	2	10	1315983	1315992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_013315	ATT	2	6	1317762	1317767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_013315	T	6	6	1318055	1318060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_013315	TAAG	2	8	1318075	1318082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_013315	AGG	2	6	1318350	1318355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_013315	TA	3	6	1318381	1318386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_013315	ATG	2	6	1318407	1318412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8125	NC_013315	AAG	2	6	1318440	1318445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_013315	TAA	2	6	1319749	1319754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_013315	AGTAT	2	10	1319762	1319771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_013315	AGG	2	6	1319845	1319850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_013315	G	6	6	1320230	1320235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_013315	AAT	2	6	1320279	1320284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_013315	AAAT	2	8	1320293	1320300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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