MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_013315	TTTA	2	8	1208687	1208694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_013315	GAG	2	6	1209885	1209890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_013315	AT	3	6	1210345	1210350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_013315	ATG	2	6	1210421	1210426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_013315	AAT	2	6	1210447	1210452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_013315	TAGA	2	8	1210467	1210474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_013315	GTA	2	6	1210475	1210480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_013315	TAA	2	6	1210504	1210509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_013315	TAT	3	9	1210529	1210537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_013315	AT	4	8	1210536	1210543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_013315	TGT	2	6	1210580	1210585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_013315	ACA	2	6	1210590	1210595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_013315	TAA	2	6	1210597	1210602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_013315	ATTT	2	8	1210610	1210617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_013315	TATT	2	8	1210676	1210683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_013315	TAT	2	6	1210716	1210721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_013315	TAT	3	9	1210733	1210741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_013315	AGT	2	6	1210769	1210774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_013315	GGT	2	6	1210787	1210792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_013315	TAATTT	2	12	1211936	1211947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_013315	AAAAT	2	10	1211969	1211978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_013315	ATC	2	6	1211983	1211988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_013315	T	6	6	1211992	1211997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_013315	TTGT	2	8	1211999	1212006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_013315	CTTTT	2	10	1212013	1212022	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7527	NC_013315	A	6	6	1212086	1212091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_013315	TGT	2	6	1212124	1212129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_013315	AATTTT	2	12	1212156	1212167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_013315	TAT	2	6	1212173	1212178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_013315	AAT	2	6	1212208	1212213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_013315	AT	3	6	1212253	1212258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_013315	ATT	2	6	1212261	1212266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_013315	TGA	2	6	1212279	1212284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_013315	TA	3	6	1212325	1212330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_013315	CA	3	6	1212392	1212397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7537	NC_013315	AAT	2	6	1213605	1213610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_013315	A	6	6	1213663	1213668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7540	NC_013315	AATT	2	8	1213697	1213704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_013315	ATTT	2	8	1213724	1213731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_013315	ATTT	2	8	1213746	1213753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_013315	ATA	2	6	1213757	1213762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_013315	TG	3	6	1213766	1213771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_013315	CCT	2	6	1214981	1214986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_013315	TA	3	6	1214999	1215004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_013315	TGAA	2	8	1215027	1215034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_013315	AT	3	6	1215084	1215089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_013315	A	7	7	1215100	1215106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_013315	CTATT	2	10	1215155	1215164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7551	NC_013315	AAT	2	6	1215170	1215175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_013315	TAC	2	6	1215237	1215242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7554	NC_013315	GGA	2	6	1215276	1215281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7556	NC_013315	TAAT	2	8	1219287	1219294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_013315	GAG	2	6	1219364	1219369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7559	NC_013315	TTAA	2	8	1220416	1220423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_013315	A	7	7	1222164	1222170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_013315	GAA	2	6	1222183	1222188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_013315	TAT	2	6	1222193	1222198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_013315	GCA	2	6	1222307	1222312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7565	NC_013315	TA	5	10	1222386	1222395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_013315	AAT	2	6	1222396	1222401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_013315	ATG	2	6	1222416	1222421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7573	NC_013315	T	6	6	1223788	1223793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_013315	TAA	2	6	1223808	1223813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_013315	ATA	2	6	1223815	1223820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_013315	T	6	6	1224540	1224545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7584	NC_013315	TGA	2	6	1224577	1224582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7602	NC_013315	ATA	2	6	1231660	1231665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_013315	ACTTT	2	10	1231672	1231681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7604	NC_013315	ATA	2	6	1231746	1231751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_013315	TGT	2	6	1231762	1231767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7612	NC_013315	TAT	2	6	1233193	1233198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7615	NC_013315	A	7	7	1233244	1233250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7623	NC_013315	ATATA	2	10	1233425	1233434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_013315	A	9	9	1233434	1233442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_013315	TA	3	6	1233444	1233449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7629	NC_013315	ATA	2	6	1233521	1233526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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