MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_013315	AAGAT	2	10	1094985	1094994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_013315	GCA	2	6	1095056	1095061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_013315	ATTT	2	8	1095107	1095114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_013315	TTCA	2	8	1095119	1095126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7007	NC_013315	AT	4	8	1095132	1095139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013315	A	6	6	1095163	1095168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_013315	AG	3	6	1095295	1095300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_013315	CT	3	6	1095337	1095342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_013315	TGG	2	6	1095358	1095363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7013	NC_013315	TAA	2	6	1095421	1095426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_013315	T	7	7	1095466	1095472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_013315	AT	3	6	1095503	1095508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_013315	AT	3	6	1095512	1095517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_013315	T	7	7	1095522	1095528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_013315	T	6	6	1095530	1095535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013315	T	7	7	1095546	1095552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_013315	T	6	6	1095562	1095567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_013315	ATT	2	6	1095573	1095578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_013315	A	6	6	1095629	1095634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_013315	AAAT	2	8	1097716	1097723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_013315	TTTAAA	2	12	1097735	1097746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7033	NC_013315	TG	3	6	1097982	1097987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7042	NC_013315	TGTA	2	8	1100296	1100303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_013315	TA	4	8	1100326	1100333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_013315	T	7	7	1100339	1100345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7046	NC_013315	ATA	2	6	1100404	1100409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_013315	TTAAT	2	10	1100415	1100424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7050	NC_013315	AGTA	2	8	1104630	1104637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_013315	ACT	2	6	1104638	1104643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_013315	A	6	6	1104644	1104649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_013315	AG	3	6	1104658	1104663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_013315	TA	4	8	1112794	1112801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_013315	AT	3	6	1117564	1117569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_013315	AT	3	6	1117579	1117584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_013315	ATA	2	6	1117601	1117606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_013315	ATA	2	6	1117619	1117624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_013315	TTAT	2	8	1117641	1117648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_013315	ATTAAT	2	12	1117650	1117661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7064	NC_013315	CTT	2	6	1119010	1119015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7104	NC_013315	A	6	6	1127491	1127496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_013315	T	8	8	1127503	1127510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_013315	A	7	7	1127520	1127526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_013315	A	6	6	1127531	1127536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_013315	A	6	6	1127541	1127546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_013315	TAA	2	6	1127549	1127554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7124	NC_013315	AAAAT	2	10	1128026	1128035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7130	NC_013315	A	6	6	1132863	1132868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_013315	AT	3	6	1132878	1132883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7133	NC_013315	AT	3	6	1134219	1134224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_013315	AAAG	2	8	1134265	1134272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7135	NC_013315	GTTT	2	8	1134282	1134289	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7408	NC_013315	TAT	2	6	1183153	1183158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7409	NC_013315	AGAT	2	8	1183233	1183240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7410	NC_013315	GTT	2	6	1183241	1183246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7411	NC_013315	TTA	2	6	1183274	1183279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7412	NC_013315	GTTT	2	8	1183322	1183329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7421	NC_013315	TAA	2	6	1183487	1183492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7489	NC_013315	A	6	6	1194581	1194586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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