MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU2

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013284	GCTT	2	8	14	21	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013284	CG	3	6	391	396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013284	GC	3	6	399	404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013284	CGC	2	6	662	667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013284	TTC	2	6	701	706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013284	GAA	2	6	2470	2475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013284	ATG	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013284	A	6	6	2504	2509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013284	TA	3	6	3242	3247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013284	TA	3	6	3750	3755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013284	CCT	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013284	ATTAT	2	10	4436	4445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013284	TA	3	6	5109	5114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013284	TA	3	6	5191	5196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013284	CAT	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013284	TAT	2	6	6081	6086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013284	TGC	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013284	CGA	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013284	A	6	6	7098	7103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013284	A	6	6	7193	7198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013284	CATG	2	8	7211	7218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013284	CATT	2	8	7251	7258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013284	AAG	2	6	7289	7294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013284	GCA	2	6	7298	7303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013284	CAA	2	6	7410	7415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013284	AAC	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013284	GC	3	6	7624	7629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013284	CGA	2	6	7659	7664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013284	ATCC	2	8	7704	7711	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013284	ATGA	2	8	7848	7855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013284	TCG	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013284	TTAC	2	8	8134	8141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013284	GTT	2	6	8238	8243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013284	T	6	6	8242	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013284	ACG	3	9	8914	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013284	TCAC	2	8	9005	9012	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013284	TGA	2	6	9128	9133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013284	G	6	6	9142	9147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013284	CCGT	2	8	9234	9241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013284	CATTA	2	10	9254	9263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013284	ATC	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013284	ATT	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013284	GTT	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013284	T	6	6	9414	9419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013284	AAGCG	2	10	9442	9451	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013284	GGCA	2	8	9453	9460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013284	ACCC	2	8	9832	9839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_013284	GC	3	6	9865	9870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013284	TTA	2	6	9924	9929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013284	AC	3	6	9952	9957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013284	CGG	2	6	10037	10042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013284	CCG	2	6	10553	10558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013284	AGC	2	6	10566	10571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013284	T	7	7	10576	10582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013284	GCT	2	6	12063	12068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013284	CT	3	6	16851	16856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013284	AT	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013284	TGA	2	6	18717	18722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013284	AG	4	8	18788	18795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013284	CAT	2	6	21129	21134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013284	CCG	4	12	21155	21166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013284	AAC	2	6	21833	21838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013284	TAA	2	6	21846	21851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013284	CTG	2	6	21863	21868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013284	TCA	2	6	21887	21892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013284	ATCA	2	8	21919	21926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013284	TAAT	2	8	21939	21946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013284	ATC	2	6	21960	21965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013284	T	6	6	22036	22041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013284	CGC	2	6	22059	22064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013284	CAA	2	6	22073	22078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013284	A	6	6	22092	22097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.